More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0244 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3166  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  71.22 
 
 
496 aa  699    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.224874  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0084  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  70.81 
 
 
497 aa  693    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1289  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.94 
 
 
497 aa  669    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0121805  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3610  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  68.11 
 
 
495 aa  676    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.0328127 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0352  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  66.8 
 
 
497 aa  642    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258005  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  71.22 
 
 
496 aa  704    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0319  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  66.8 
 
 
497 aa  642    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1194  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  69.79 
 
 
499 aa  652    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0718304  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3123  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  69.75 
 
 
510 aa  676    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2146  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  68.1 
 
 
498 aa  689    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0040  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.33 
 
 
500 aa  669    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116515  normal  0.0387479 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3052  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  66.6 
 
 
497 aa  640    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0432  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  68.4 
 
 
494 aa  660    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401755  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2213  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.05 
 
 
487 aa  664    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6099  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0244  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 
487 aa  986    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20132  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3193  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  68.57 
 
 
498 aa  686    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.291902  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1752  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.52 
 
 
500 aa  669    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.151769  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5770  inosine-5`-monophosphate dehydrogenase  69.15 
 
 
532 aa  656    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3071  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  68.3 
 
 
497 aa  687    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.303181  normal  0.0977004 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0477  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.98 
 
 
494 aa  654    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2264  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  66.94 
 
 
498 aa  678    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2546  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  68.37 
 
 
498 aa  689    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.509974  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1027  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.11 
 
 
485 aa  680    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0467  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  69.2 
 
 
500 aa  667    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132943  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0379  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  69.26 
 
 
500 aa  673    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2495  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  69.39 
 
 
498 aa  691    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0968  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  69.57 
 
 
497 aa  681    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242284  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.08 
 
 
496 aa  672    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1646  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.02 
 
 
484 aa  644    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.536649  hitchhiker  0.0000000511927 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1175  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.97 
 
 
489 aa  662    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.654831  normal  0.725895 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0341  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  65.98 
 
 
499 aa  652    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0405  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.74 
 
 
485 aa  681    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0548973 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1923  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.48 
 
 
496 aa  674    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2939  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  71.22 
 
 
496 aa  699    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.27006 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1168  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  73.24 
 
 
486 aa  735    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1982  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.79 
 
 
482 aa  623  1e-177  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.311927  normal  0.313546 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1141  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.35 
 
 
486 aa  615  1e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.144187 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1224  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.81 
 
 
482 aa  616  1e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.717892  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2868  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.37 
 
 
482 aa  610  1e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.419057  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.04 
 
 
491 aa  608  1e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1514  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.37 
 
 
482 aa  610  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.339989  normal  0.154254 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.41 
 
 
491 aa  608  1e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_002978  WD0089  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.69 
 
 
494 aa  605  9.999999999999999e-173  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0800118  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1360  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.7 
 
 
490 aa  608  9.999999999999999e-173  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0613  IMP dehydrogenase  63.2 
 
 
486 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000830235  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1005  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.7 
 
 
490 aa  608  9.999999999999999e-173  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1152  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.96 
 
 
482 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.859407  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0592  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.22 
 
 
482 aa  607  9.999999999999999e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2195  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61 
 
 
491 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2293  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.62 
 
 
491 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.711267  normal  0.709548 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0224  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.37 
 
 
485 aa  601  1.0000000000000001e-171  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.218435  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0764  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.37 
 
 
489 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0781  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.17 
 
 
489 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1261  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.9 
 
 
490 aa  600  1e-170  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.289977  normal  0.031693 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1459  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.62 
 
 
556 aa  598  1e-170  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439962  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0784  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.16 
 
 
485 aa  596  1e-169  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3486  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  62.68 
 
 
489 aa  594  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2349  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.59 
 
 
487 aa  595  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163967  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3124  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.96 
 
 
489 aa  595  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1429  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  61.54 
 
 
487 aa  592  1e-168  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0657932  normal  0.0240553 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1615  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.38 
 
 
487 aa  594  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0609  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.71 
 
 
486 aa  591  1e-168  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.050446  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0529  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  62.24 
 
 
487 aa  592  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1193  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62 
 
 
490 aa  594  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1520  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.38 
 
 
487 aa  594  1e-168  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0307442  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.79 
 
 
489 aa  593  1e-168  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1728  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.11 
 
 
494 aa  590  1e-167  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.716764  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2623  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.03 
 
 
487 aa  588  1e-167  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1370  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  61.54 
 
 
487 aa  588  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.810739  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.04 
 
 
486 aa  588  1e-167  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.608786  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1108  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.79 
 
 
485 aa  590  1e-167  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.927877  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1260  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.62 
 
 
499 aa  590  1e-167  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1433  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.75 
 
 
496 aa  590  1e-167  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.51558 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1314  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.79 
 
 
486 aa  588  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3391  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.88 
 
 
493 aa  588  1e-167  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207114  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  59.29 
 
 
484 aa  586  1e-166  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1856  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.71 
 
 
487 aa  586  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.29 
 
 
488 aa  586  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1306  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  61.54 
 
 
487 aa  587  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24376  normal  0.894393 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0291  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.11 
 
 
487 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1423  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  62.86 
 
 
487 aa  581  1.0000000000000001e-165  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4214  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.96 
 
 
488 aa  583  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4148  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.65 
 
 
488 aa  581  1.0000000000000001e-165  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0201579  normal  0.112689 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1070  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.46 
 
 
485 aa  583  1.0000000000000001e-165  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.462822  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3120  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.41 
 
 
489 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.899033  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0420  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.42 
 
 
487 aa  581  1.0000000000000001e-165  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3015  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.62 
 
 
488 aa  584  1.0000000000000001e-165  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1049  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.93 
 
 
496 aa  579  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1900  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.79 
 
 
488 aa  580  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.33 
 
 
504 aa  581  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2338  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.2 
 
 
487 aa  578  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.879992  normal  0.100057 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0207  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.33 
 
 
507 aa  580  1e-164  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2431  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.71 
 
 
486 aa  580  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.171445 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1524  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.5 
 
 
487 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0988  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.04 
 
 
485 aa  580  1e-164  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00325513  hitchhiker  0.000530591 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3087  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.79 
 
 
485 aa  579  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000190164  hitchhiker  0.00103544 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1682  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.9 
 
 
514 aa  579  1e-164  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.155444  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1628  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.45 
 
 
497 aa  579  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2549  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.21 
 
 
486 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.425317  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2405  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.21 
 
 
486 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>