More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3645 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3837  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.01 
 
 
520 aa  642    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1082  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67 
 
 
514 aa  703    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4447  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.54 
 
 
501 aa  685    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2585  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  75.2 
 
 
507 aa  774    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.817903  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2596  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.14 
 
 
500 aa  659    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0638  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  72.58 
 
 
504 aa  761    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.726913  normal  0.734007 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4227  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.41 
 
 
520 aa  643    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.147199 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4253  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.67 
 
 
500 aa  675    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1213  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.14 
 
 
513 aa  652    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398253  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08690  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  72.29 
 
 
499 aa  743    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0432795  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07600  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.67 
 
 
498 aa  691    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.194742 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0623  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.37 
 
 
492 aa  645    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.637063 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0687  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  81.82 
 
 
501 aa  836    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.559264  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16510  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.79 
 
 
514 aa  679    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00613898  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1899  IMP dehydrogenase/GMP reductase  65.59 
 
 
517 aa  691    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2587  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.79 
 
 
503 aa  719    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000196974 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28670  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  75.86 
 
 
507 aa  777    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2879  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.39 
 
 
503 aa  716    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0154703  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0366  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.53 
 
 
516 aa  651    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.213754 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3055  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  82.26 
 
 
505 aa  840    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1012  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.73 
 
 
498 aa  670    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.155508 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3645  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 
500 aa  1016    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.808002  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0742  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.4 
 
 
510 aa  700    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00516677  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1160  IMP dehydrogenase  65.19 
 
 
493 aa  650    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.827083  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04740  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.93 
 
 
514 aa  644    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0636  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.87 
 
 
537 aa  630  1e-179  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.644185 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1194  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  64.02 
 
 
517 aa  629  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515075  normal  0.0933798 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1167  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  64.02 
 
 
517 aa  629  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.446861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1184  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  63.82 
 
 
517 aa  626  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4023  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.71 
 
 
498 aa  623  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.836954  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1091  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.79 
 
 
495 aa  619  1e-176  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5998  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.67 
 
 
597 aa  617  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352263  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6535  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.33 
 
 
503 aa  617  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13445  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  66.33 
 
 
529 aa  617  1e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0612971  normal  0.0362546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1511  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  64.61 
 
 
517 aa  617  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316091 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4909  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  64.41 
 
 
517 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.636899 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1726  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.05 
 
 
503 aa  603  1.0000000000000001e-171  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0906  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.25 
 
 
514 aa  593  1e-168  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.213096  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.98 
 
 
486 aa  543  1e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.62 
 
 
494 aa  540  9.999999999999999e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.11 
 
 
490 aa  536  1e-151  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1107  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  54.91 
 
 
503 aa  536  1e-151  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.714847  normal  0.939326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1108  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.98 
 
 
485 aa  536  1e-151  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.927877  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0829  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.4 
 
 
504 aa  533  1e-150  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.363415  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3391  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  54.64 
 
 
493 aa  530  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207114  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.44 
 
 
491 aa  529  1e-149  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  53.59 
 
 
483 aa  530  1e-149  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  52.41 
 
 
484 aa  526  1e-148  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  52.3 
 
 
488 aa  526  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  52.77 
 
 
508 aa  528  1e-148  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  54.62 
 
 
488 aa  528  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0999  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  54.02 
 
 
491 aa  526  1e-148  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000499041  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0749  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  52.81 
 
 
493 aa  525  1e-147  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  53.5 
 
 
488 aa  521  1e-147  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  52.93 
 
 
488 aa  523  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212236  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  53.18 
 
 
482 aa  519  1e-146  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  53.39 
 
 
482 aa  519  1e-146  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0764  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  53.63 
 
 
489 aa  521  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2213  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  54.91 
 
 
487 aa  518  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6099  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2195  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  53.28 
 
 
491 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0781  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  53.43 
 
 
489 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2293  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  53.39 
 
 
491 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.711267  normal  0.709548 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1137  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  53.32 
 
 
489 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0341  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  53.8 
 
 
499 aa  514  1e-144  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  53.04 
 
 
491 aa  512  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0770  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  53.66 
 
 
481 aa  513  1e-144  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0061566  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0548  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  53.74 
 
 
547 aa  514  1e-144  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0040  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.03 
 
 
500 aa  514  1e-144  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116515  normal  0.0387479 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0225  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  50.51 
 
 
493 aa  511  1e-144  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  50.51 
 
 
493 aa  508  1e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0694637  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2146  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  54.07 
 
 
498 aa  509  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3124  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  52.46 
 
 
489 aa  509  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1904  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  52.36 
 
 
483 aa  510  1e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00977743  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  54.75 
 
 
496 aa  511  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0968  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  53.94 
 
 
497 aa  509  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242284  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2495  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  54.36 
 
 
498 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1906  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  52.02 
 
 
484 aa  510  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0486  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  53.66 
 
 
482 aa  508  1e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0612  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  52.85 
 
 
483 aa  510  1e-143  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00142081  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  50.6 
 
 
486 aa  509  1e-143  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3166  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  54.55 
 
 
496 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.224874  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  52.53 
 
 
492 aa  505  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1594  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.11 
 
 
489 aa  506  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.221976 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1070  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  52.92 
 
 
485 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.462822  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  53.25 
 
 
504 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  51.81 
 
 
487 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.303266  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0664  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  53.46 
 
 
485 aa  506  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.116725  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2939  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  54.55 
 
 
496 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.27006 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4214  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  54.12 
 
 
488 aa  506  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3193  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  53.66 
 
 
498 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.291902  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5306  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  51.72 
 
 
487 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0029  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  52.81 
 
 
485 aa  508  9.999999999999999e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2264  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  53.86 
 
 
498 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3287  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  51.23 
 
 
484 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000039579  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1923  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  53.51 
 
 
496 aa  506  9.999999999999999e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0477  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  54.51 
 
 
494 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  51.31 
 
 
487 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0697  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  52.8 
 
 
490 aa  506  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0725248  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  51.72 
 
 
487 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0594668  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1193  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  53.33 
 
 
490 aa  505  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>