More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6535 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0742  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  69.72 
 
 		 510 aa  704    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00516677  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3837  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  72.13 
 
 		 520 aa  686    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4909  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  78.07 
 
 		 517 aa  760    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.636899 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1213  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  75.65 
 
 		 513 aa  776    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0623  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  70.26 
 
 		 492 aa  687    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.637063 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28670  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.87 
 
 		 507 aa  665    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2596  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.35 
 
 		 500 aa  660    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1012  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.48 
 
 		 498 aa  690    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.155508 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1194  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  77.46 
 
 		 517 aa  778    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515075  normal  0.0933798 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4023  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  70.23 
 
 		 498 aa  671    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.836954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2587  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.78 
 
 		 503 aa  646    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000196974 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4447  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  71.52 
 
 		 501 aa  705    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4253  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  70 
 
 		 500 aa  705    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0636  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  70.97 
 
 		 537 aa  684    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.644185 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2585  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.76 
 
 		 507 aa  651    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.817903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1511  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  78.07 
 
 		 517 aa  764    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316091 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0638  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.45 
 
 		 504 aa  657    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.726913  normal  0.734007 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16510  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.04 
 
 		 514 aa  640    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00613898  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1091  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  70.29 
 
 		 495 aa  705    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13445  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  76.06 
 
 		 529 aa  739    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0612971  normal  0.0362546 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1726  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  77.28 
 
 		 503 aa  763    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04740  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  81.73 
 
 		 514 aa  834    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1160  IMP dehydrogenase  67.81 
 
 		 493 aa  667    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.827083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1167  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  77.46 
 
 		 517 aa  778    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.446861  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4227  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  72.75 
 
 		 520 aa  693    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.147199 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07600  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.27 
 
 		 498 aa  679    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.194742 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6535  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 		 503 aa  1009    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5998  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  70.69 
 
 		 597 aa  669    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352263  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2879  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.18 
 
 		 503 aa  639    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0154703  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0906  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  77.48 
 
 		 514 aa  754    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.213096  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0366  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  70.38 
 
 		 516 aa  716    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.213754 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1184  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  77.67 
 
 		 517 aa  779    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0687  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.49 
 
 		 501 aa  632  1e-180  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.559264  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3645  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.33 
 
 		 500 aa  633  1e-180  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.808002  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3055  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.62 
 
 		 505 aa  622  1e-177  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.171926 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08690  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.84 
 
 		 499 aa  619  1e-176  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0432795  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1899  IMP dehydrogenase/GMP reductase  60.95 
 
 		 517 aa  617  1e-175  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1082  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.9 
 
 		 514 aa  616  1e-175  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1108  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.16 
 
 		 485 aa  585  1e-166  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.927877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0749  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.45 
 
 		 493 aa  587  1e-166  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1137  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.96 
 
 		 489 aa  578  1e-164  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1070  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.11 
 
 		 485 aa  580  1e-164  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.462822  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.01 
 
 		 488 aa  579  1e-164  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  58.42 
 
 		 484 aa  580  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.55 
 
 		 490 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.26 
 
 		 488 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.35 
 
 		 488 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  57 
 
 		 488 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212236  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.16 
 
 		 486 aa  573  1.0000000000000001e-162  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.63 
 
 		 491 aa  573  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.62 
 
 		 486 aa  565  1e-160  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0225  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.57 
 
 		 493 aa  565  1e-160  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.1 
 
 		 494 aa  563  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0916  IMP dehydrogenase  57.76 
 
 		 484 aa  562  1.0000000000000001e-159  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.366746  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1906  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.52 
 
 		 484 aa  560  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0999  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.68 
 
 		 491 aa  559  1e-158  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000499041  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3391  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.32 
 
 		 493 aa  558  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.52 
 
 		 504 aa  555  1e-157  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5306  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.39 
 
 		 487 aa  555  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.19 
 
 		 487 aa  556  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.8 
 
 		 487 aa  557  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.303266  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.59 
 
 		 487 aa  555  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0594668  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0781  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.85 
 
 		 489 aa  555  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0764  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.64 
 
 		 489 aa  552  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.59 
 
 		 487 aa  554  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0011  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.39 
 
 		 487 aa  553  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.59 
 
 		 487 aa  553  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.59 
 
 		 487 aa  554  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.34316  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0829  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.94 
 
 		 504 aa  552  1e-156  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.363415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0029  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.12 
 
 		 485 aa  553  1e-156  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.39 
 
 		 487 aa  553  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0014  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.59 
 
 		 487 aa  554  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0120798  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1107  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.77 
 
 		 503 aa  553  1e-156  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.714847  normal  0.939326 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.19 
 
 		 487 aa  551  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2293  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.61 
 
 		 491 aa  548  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.711267  normal  0.709548 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  54.29 
 
 		 508 aa  550  1e-155  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3087  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.98 
 
 		 485 aa  550  1e-155  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000190164  hitchhiker  0.00103544 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3124  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.23 
 
 		 489 aa  550  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1193  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.91 
 
 		 490 aa  550  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2195  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.4 
 
 		 491 aa  546  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0069  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.78 
 
 		 488 aa  546  1e-154  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110755  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  54.34 
 
 		 493 aa  545  1e-154  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0694637  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3287  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.11 
 
 		 484 aa  548  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000039579  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0486  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.31 
 
 		 482 aa  546  1e-154  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.72 
 
 		 496 aa  547  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.73 
 
 		 483 aa  546  1e-154  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.839971  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0612  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.52 
 
 		 483 aa  546  1e-154  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00142081  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.02 
 
 		 489 aa  545  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2213  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.32 
 
 		 487 aa  541  1e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6099  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.17 
 
 		 492 aa  541  1e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0448  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.19 
 
 		 488 aa  542  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3166  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.52 
 
 		 496 aa  544  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.224874  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2939  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.52 
 
 		 496 aa  544  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.27006 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0437  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.19 
 
 		 488 aa  542  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0968  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.52 
 
 		 497 aa  542  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0084  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.32 
 
 		 497 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.61 
 
 		 491 aa  539  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.79 
 
 		 486 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.608786  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1260  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.56 
 
 		 499 aa  539  9.999999999999999e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08496  putative inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.26 
 
 		 490 aa  540  9.999999999999999e-153  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>