More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0909 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0909  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 139 aa  284  4e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000468924 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0958  CBS domain-containing protein  75.54 
 
 		 140 aa  226  9e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3588  CBS domain containing membrane protein  71.22 
 
 		 141 aa  206  6e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0650  CBS domain-containing protein  71.22 
 
 		 141 aa  206  6e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3655  CBS domain-containing protein  71.22 
 
 		 141 aa  206  8e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3778  CBS domain-containing protein  70.5 
 
 		 141 aa  205  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0805  CBS domain-containing protein  69.57 
 
 		 172 aa  201  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3313  CBS domain-containing protein  69.78 
 
 		 141 aa  202  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0640  CBS domain-containing protein  69.78 
 
 		 141 aa  202  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3483  CBS domain-containing protein  69.78 
 
 		 141 aa  202  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3185  CBS domain-containing protein  69.57 
 
 		 142 aa  200  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3288  CBS domain-containing protein  70.07 
 
 		 142 aa  200  5e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0997819  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0831  CBS domain-containing protein  69.78 
 
 		 139 aa  200  7e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2925  CBS domain-containing protein  67.15 
 
 		 139 aa  191  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00660702  normal  0.275882 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3135  CBS domain-containing protein  64.23 
 
 		 141 aa  187  5e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0694667  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  30.37 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2078  CBS  32.12 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  29.5 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  31.11 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  29.2 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  30.22 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  30.22 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  30.22 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  31.88 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  33.58 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  29.55 
 
 		 373 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  30.72 
 
 		 230 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  33.08 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  34.06 
 
 		 426 aa  65.1  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  31.78 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  33.33 
 
 		 500 aa  63.5  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  31.82 
 
 		 382 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02666  CBS domain containing membrane protein  27.41 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  30.28 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1207  homoserine O-acetyltransferase  30.77 
 
 		 490 aa  62.8  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0144114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  28.26 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3995  CBS domain-containing protein  25.95 
 
 		 133 aa  62  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2632  CBS domain containing protein  29.93 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.231798  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1923  CBS domain containing protein  26.62 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1386  CBS domain-containing protein  34.07 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2437  hypothetical protein  28.68 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  27.46 
 
 		 232 aa  61.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  32.06 
 
 		 502 aa  60.8  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  30.22 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  30.3 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  31.06 
 
 		 490 aa  58.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2536  CBS domain containing protein  29.93 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.55636  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004370  putative acetoin utilization protein AcuB  28.47 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1323  XRE family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805809  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  34.85 
 
 		 279 aa  57.8  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  30 
 
 		 513 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  31.5 
 
 		 873 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  30.3 
 
 		 216 aa  57.4  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  34.85 
 
 		 279 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  28.46 
 
 		 513 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  32.85 
 
 		 640 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  26.57 
 
 		 378 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  26 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0268  hypothetical protein  28.06 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00882605  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2035  CBS domain containing membrane protein  28.57 
 
 		 389 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  30.37 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1669  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 389 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  27.03 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  26.47 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  32.58 
 
 		 279 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5608  signal transduction protein  24.09 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1843  CBS domain-containing protein  26.28 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  31.06 
 
 		 503 aa  55.1  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  28.46 
 
 		 513 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  28.89 
 
 		 300 aa  54.7  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  29.17 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  29.01 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  25.76 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  24.63 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  27.66 
 
 		 256 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  32.06 
 
 		 279 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0138  hypothetical protein  28.46 
 
 		 503 aa  54.7  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  27.01 
 
 		 210 aa  54.3  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  26.97 
 
 		 230 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  32.62 
 
 		 217 aa  54.3  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  25.53 
 
 		 223 aa  53.9  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3655  hypothetical protein  28.36 
 
 		 389 aa  54.3  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  30.14 
 
 		 232 aa  53.9  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  28.24 
 
 		 883 aa  53.9  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  28.68 
 
 		 392 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1907  CBS domain-containing protein  27.74 
 
 		 232 aa  53.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416143  hitchhiker  0.0000404489 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  27.69 
 
 		 488 aa  53.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  27.61 
 
 		 214 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0890  CBS domain-containing protein  26.43 
 
 		 383 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421594 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  30.37 
 
 		 250 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  25.95 
 
 		 368 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  31.39 
 
 		 379 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2085  hypothetical protein  29.55 
 
 		 500 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3348  CBS domain-containing protein  26.36 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  25.87 
 
 		 246 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3486  CBS domain-containing protein  26.81 
 
 		 221 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000172668 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1158  CBS domain containing protein  26.36 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  49.09 
 
 		 185 aa  52.4  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3209  CBS domain-containing protein  26.36 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549448  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  25.68 
 
 		 427 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>