More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2233 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  100 
 
 
232 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  45.33 
 
 
223 aa  174  9e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  47.92 
 
 
217 aa  159  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  39.25 
 
 
243 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.32 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  38.79 
 
 
243 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  37.79 
 
 
242 aa  135  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  38.64 
 
 
230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  39.45 
 
 
243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  37.38 
 
 
242 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  40.09 
 
 
246 aa  131  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  39.63 
 
 
230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  36.82 
 
 
242 aa  126  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  36.57 
 
 
226 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  36.44 
 
 
226 aa  118  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  35.94 
 
 
236 aa  115  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  38.71 
 
 
247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  40.19 
 
 
246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  34.43 
 
 
233 aa  113  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  38.79 
 
 
242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  34.76 
 
 
249 aa  112  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  35.32 
 
 
229 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  34.11 
 
 
229 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  34.26 
 
 
230 aa  105  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  33.77 
 
 
241 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  34.26 
 
 
231 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  31.34 
 
 
228 aa  101  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  31.02 
 
 
231 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  34.42 
 
 
201 aa  96.7  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2522  CBS domain containing membrane protein  35.32 
 
 
235 aa  96.7  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0807239 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  34.62 
 
 
132 aa  95.9  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  40.27 
 
 
147 aa  95.5  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  28.96 
 
 
234 aa  92  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  37.84 
 
 
348 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  30.32 
 
 
149 aa  88.6  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  33.79 
 
 
153 aa  87  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0394  CBS domain-containing membrane protein  33.33 
 
 
201 aa  85.9  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  31.25 
 
 
241 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  37.58 
 
 
339 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  36.91 
 
 
333 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  32.99 
 
 
226 aa  83.2  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  33.77 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  35.67 
 
 
339 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  31.51 
 
 
232 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  31.43 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1897  signal-transduction protein  26.17 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  31.65 
 
 
228 aa  79.7  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  30.82 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  29.87 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  31.62 
 
 
258 aa  77.8  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  27.81 
 
 
152 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.24 
 
 
338 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  33.11 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0152  signal transduction protein  33.77 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  38.24 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  28.43 
 
 
227 aa  75.5  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  30 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  31.73 
 
 
221 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  33.55 
 
 
154 aa  74.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  36.67 
 
 
160 aa  74.7  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  28.57 
 
 
149 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  34.48 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  29.25 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  30.43 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  28.67 
 
 
155 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  34.07 
 
 
845 aa  73.6  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  29.8 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  25.34 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  32.41 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0825  putative signal transduction protein with CBS domains  32.37 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  29.17 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  34.72 
 
 
332 aa  72.4  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  39.55 
 
 
769 aa  72.4  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  31.43 
 
 
149 aa  72  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  30.82 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  31.97 
 
 
152 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  29.72 
 
 
191 aa  71.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  30.87 
 
 
150 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  30.13 
 
 
161 aa  71.2  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  34.03 
 
 
154 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  29.33 
 
 
154 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  33.33 
 
 
877 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  32.39 
 
 
391 aa  70.1  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5097  signal-transduction protein  30.39 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  32.09 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5185  signal-transduction protein  30.39 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254661  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5476  signal-transduction protein  30.39 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184871  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.82 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4802  signal-transduction protein containing cAMP- binding and CBS domains-like protein  28.85 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.476342  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  34.27 
 
 
863 aa  69.7  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  27.78 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2651  putative signal transduction protein with CBS domains  30.82 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  31.65 
 
 
426 aa  68.6  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  28.05 
 
 
907 aa  68.6  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2667  hypothetical protein  35.07 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.262704  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1843  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
181 aa  68.6  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  30.71 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.7 
 
 
873 aa  68.6  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  29.86 
 
 
150 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  33.81 
 
 
427 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>