More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1897 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1897  signal-transduction protein  100 
 
 		 231 aa  462  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  36.36 
 
 		 242 aa  156  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  36.36 
 
 		 242 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  34.09 
 
 		 243 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.55 
 
 		 243 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  34.07 
 
 		 242 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  38.39 
 
 		 226 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  34.09 
 
 		 243 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  33.19 
 
 		 230 aa  134  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 		 226 aa  133  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  37.27 
 
 		 233 aa  131  7.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  35.11 
 
 		 243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  33.48 
 
 		 246 aa  125  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  31.44 
 
 		 230 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  32.73 
 
 		 249 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  31.39 
 
 		 231 aa  118  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  34.08 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  31.9 
 
 		 229 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  30.87 
 
 		 229 aa  115  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  31.03 
 
 		 242 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  32.91 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  30 
 
 		 230 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  29.15 
 
 		 228 aa  113  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  31.28 
 
 		 246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  29.82 
 
 		 241 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  34.67 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2522  CBS domain containing membrane protein  33.63 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0807239 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  31.19 
 
 		 223 aa  105  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  30.99 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  26.17 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  33.57 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6177  transport-associated  26.37 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  33.33 
 
 		 153 aa  77.8  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  30.2 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  31.61 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  32.03 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  29.37 
 
 		 150 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  26.03 
 
 		 149 aa  74.7  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  27.97 
 
 		 152 aa  74.3  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  28.76 
 
 		 152 aa  73.9  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  29.37 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  29.08 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  28.47 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  29.17 
 
 		 153 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2138  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  31.08 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  27.27 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  28.37 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0960  CBS domain-containing protein  31.72 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0461508  hitchhiker  0.00174257 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  29.33 
 
 		 427 aa  68.6  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  33.33 
 
 		 154 aa  67  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  31.08 
 
 		 348 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  26.53 
 
 		 155 aa  67  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  29.41 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  29.73 
 
 		 339 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  29.91 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0394  CBS domain-containing membrane protein  30.69 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  26.92 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  27.97 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  35.62 
 
 		 162 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  30.71 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  29.33 
 
 		 873 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  28.67 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  27.23 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  27.14 
 
 		 149 aa  64.3  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  28.67 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  26.81 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  30.61 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  29.17 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  27.74 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  34.15 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0340  signal-transduction protein  34.53 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0589746  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  27.06 
 
 		 227 aa  62  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  29.14 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  24 
 
 		 154 aa  61.6  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  35.37 
 
 		 162 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  28.57 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  27.44 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1490  signal transduction protein  31.88 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.421198 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  31.79 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  30.83 
 
 		 145 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  25.87 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  29.17 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2021  CBS domain containing membrane protein  26.58 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3311  CBS domain-containing protein  28.66 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.881932 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  35.77 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  32.85 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  29.73 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  35.16 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  31.33 
 
 		 427 aa  58.9  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2711  CBS domain-containing membrane protein  26.13 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  25.54 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  28.47 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  27.89 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_8994  predicted protein  33.09 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  26.39 
 
 		 378 aa  58.5  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  34.15 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2287  CBS domain containing membrane protein  28.87 
 
 		 135 aa  57.4  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146345  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  27.66 
 
 		 909 aa  57  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>