More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0960 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0960  CBS domain-containing protein  100 
 
 
153 aa  301  2.0000000000000002e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0461508  hitchhiker  0.00174257 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  37.41 
 
 
147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  38.78 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  38.78 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  39.19 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  39.19 
 
 
153 aa  106  9.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  36.3 
 
 
149 aa  104  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  35.37 
 
 
149 aa  103  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  37.76 
 
 
160 aa  102  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  35.37 
 
 
149 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  36.11 
 
 
150 aa  101  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1925  CBS domain protein  41.5 
 
 
151 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1597  CBS domain containing membrane protein  41.5 
 
 
151 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.105679 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  33.56 
 
 
150 aa  99  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  36.81 
 
 
155 aa  97.8  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  35.37 
 
 
150 aa  97.1  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  34.72 
 
 
149 aa  95.9  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  34.44 
 
 
152 aa  95.5  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  33.99 
 
 
153 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  37.67 
 
 
148 aa  94  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  32.41 
 
 
152 aa  94  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  32.19 
 
 
151 aa  93.6  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  29.33 
 
 
154 aa  89.7  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  30.82 
 
 
150 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  36.73 
 
 
150 aa  85.1  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1182  putative transcriptional regulator, XRE family  30.99 
 
 
147 aa  84.3  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000705125  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  33.56 
 
 
152 aa  83.6  9e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  32.67 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  32.67 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  34.46 
 
 
153 aa  79  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  30.2 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  32.67 
 
 
154 aa  77  0.00000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  31.47 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  29.53 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  30.14 
 
 
229 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  30.92 
 
 
241 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  30.92 
 
 
348 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.91 
 
 
657 aa  70.5  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0152  signal transduction protein  26.28 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  27.78 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  30.61 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  30.57 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  28.77 
 
 
246 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  29.14 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  28.77 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1897  signal-transduction protein  31.72 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  29.25 
 
 
154 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  28.85 
 
 
161 aa  67  0.00000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2651  putative signal transduction protein with CBS domains  26.35 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  30.67 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  33.56 
 
 
391 aa  65.5  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  29.93 
 
 
230 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  34.09 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  30.87 
 
 
233 aa  64.3  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2021  CBS domain containing membrane protein  27.56 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  27.78 
 
 
232 aa  63.9  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  25 
 
 
217 aa  63.9  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  30.87 
 
 
242 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  25.83 
 
 
154 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  27.86 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  28.38 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  32.43 
 
 
339 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  27.4 
 
 
247 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3228  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 
158 aa  60.8  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  26.95 
 
 
141 aa  60.8  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  26.49 
 
 
153 aa  60.8  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  29.8 
 
 
120 aa  60.8  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  31.08 
 
 
339 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0069  signal transduction protein  24.83 
 
 
158 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  28.47 
 
 
249 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  27.7 
 
 
615 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  28.28 
 
 
226 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  27.08 
 
 
242 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  29.25 
 
 
161 aa  59.7  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  29.86 
 
 
614 aa  59.3  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  26.62 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  27.08 
 
 
155 aa  58.9  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  28.97 
 
 
423 aa  58.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  31.47 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  30.94 
 
 
282 aa  58.5  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  30.2 
 
 
228 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  30.57 
 
 
236 aa  58.2  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1097  hypothetical protein  29.66 
 
 
222 aa  58.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  29.29 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  27.03 
 
 
615 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  30.22 
 
 
333 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0190  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.14 
 
 
625 aa  57.8  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  30.22 
 
 
272 aa  57.4  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  31.21 
 
 
226 aa  57  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  27.03 
 
 
615 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  27.78 
 
 
620 aa  57  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  23.61 
 
 
223 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  27.03 
 
 
615 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.03 
 
 
615 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  27.33 
 
 
246 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  26.53 
 
 
877 aa  56.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  32.39 
 
 
133 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2666  putative signal transduction protein with CBS domains  23.97 
 
 
252 aa  55.1  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113422  normal  0.552797 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  23.53 
 
 
598 aa  55.5  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  31.29 
 
 
162 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>