More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4725 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 		 243 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  85.48 
 
 		 243 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  85.19 
 
 		 243 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  75 
 
 		 242 aa  387  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  68.6 
 
 		 242 aa  361  5.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  68.2 
 
 		 242 aa  348  6e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  55.7 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  56 
 
 		 226 aa  259  4e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  45.5 
 
 		 249 aa  217  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  41.3 
 
 		 230 aa  186  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  40.59 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  40.35 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  40.24 
 
 		 247 aa  165  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  39.47 
 
 		 231 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  42.61 
 
 		 246 aa  163  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  42.99 
 
 		 242 aa  159  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  36.52 
 
 		 230 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  35.62 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  36.32 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  36.96 
 
 		 230 aa  152  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  37.84 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  38.57 
 
 		 228 aa  148  7e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  36.09 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  39.25 
 
 		 232 aa  144  9e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  38.64 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1897  signal-transduction protein  34.09 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  35.22 
 
 		 229 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  36.55 
 
 		 236 aa  140  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2522  CBS domain containing membrane protein  38.36 
 
 		 235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0807239 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6177  transport-associated  36.04 
 
 		 198 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  40.28 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  34.87 
 
 		 152 aa  98.6  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  33.48 
 
 		 232 aa  96.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  37.21 
 
 		 348 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 339 aa  95.9  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  37.24 
 
 		 332 aa  95.1  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  31.22 
 
 		 201 aa  91.7  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  32.9 
 
 		 234 aa  91.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  36.11 
 
 		 132 aa  90.5  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  33.78 
 
 		 149 aa  90.1  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  32.88 
 
 		 339 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0394  CBS domain-containing membrane protein  33.85 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.69 
 
 		 338 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  34.03 
 
 		 155 aa  87  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  30.85 
 
 		 193 aa  86.3  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  34.72 
 
 		 152 aa  85.9  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  30.26 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  31.94 
 
 		 191 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  34.23 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  32.87 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2711  CBS domain-containing membrane protein  32.02 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  30.67 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  30 
 
 		 153 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  32.64 
 
 		 154 aa  81.3  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  31.94 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  31.82 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  32.85 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  33.13 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  30.07 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  32.47 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  29.8 
 
 		 150 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  29.59 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  30.28 
 
 		 149 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  31.64 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  30.34 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  27.51 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  30.34 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  26.32 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  31.03 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2008  CBS  32.48 
 
 		 330 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  29.93 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  32 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  28.77 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  30.14 
 
 		 413 aa  72.4  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  31.29 
 
 		 151 aa  72  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  29.45 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  36.05 
 
 		 154 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  31.03 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0171  signal transduction protein  29.73 
 
 		 132 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  31.47 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  30.45 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0825  putative signal transduction protein with CBS domains  31.29 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  27.74 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  31.33 
 
 		 428 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  29.71 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1310  CBS  29.47 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  29.86 
 
 		 863 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  32.48 
 
 		 909 aa  68.9  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  25.34 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  29.3 
 
 		 154 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  27.89 
 
 		 149 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  26.67 
 
 		 164 aa  68.2  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  29.37 
 
 		 150 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  31.47 
 
 		 216 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  27.27 
 
 		 862 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0258  signal transduction protein  28.08 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.100598  normal  0.0168412 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  31.16 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  31.41 
 
 		 141 aa  67  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  36.03 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>