More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1703 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  100 
 
 
148 aa  294  3e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  64.19 
 
 
152 aa  196  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  59.46 
 
 
152 aa  178  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  58.45 
 
 
150 aa  178  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  58.45 
 
 
150 aa  175  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  56.76 
 
 
150 aa  169  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  52.7 
 
 
151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  40.54 
 
 
149 aa  123  9e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  39.86 
 
 
149 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  40.54 
 
 
149 aa  118  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  40 
 
 
153 aa  118  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  39.04 
 
 
153 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  39.86 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  39.04 
 
 
153 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  38.26 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  38.78 
 
 
154 aa  111  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  37.84 
 
 
149 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  37.58 
 
 
152 aa  108  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  37.16 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  37.24 
 
 
149 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  38.1 
 
 
153 aa  107  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1925  CBS domain protein  37.58 
 
 
151 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1597  CBS domain containing membrane protein  37.58 
 
 
151 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.105679 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  37.76 
 
 
154 aa  103  7e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  39.33 
 
 
153 aa  99.4  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  39.19 
 
 
150 aa  98.2  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  34.51 
 
 
149 aa  97.8  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  38.46 
 
 
160 aa  96.7  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0960  CBS domain-containing protein  37.67 
 
 
153 aa  94  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0461508  hitchhiker  0.00174257 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  32.39 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0774  CBS  36.3 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  33.79 
 
 
155 aa  92  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  34.64 
 
 
158 aa  92.4  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  33.57 
 
 
147 aa  90.5  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  36.11 
 
 
243 aa  88.6  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1879  CBS  34.25 
 
 
157 aa  85.9  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  33.56 
 
 
427 aa  84.3  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1182  putative transcriptional regulator, XRE family  33.11 
 
 
147 aa  84  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000705125  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0095  putative signal transduction protein with CBS domains  38.13 
 
 
135 aa  84  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  36.17 
 
 
249 aa  83.6  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2651  putative signal transduction protein with CBS domains  31.79 
 
 
161 aa  83.6  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  35.57 
 
 
428 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  29.66 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0069  signal transduction protein  33.33 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  34.19 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17501  IMP dehydrogenase-like protein  34.25 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  32.65 
 
 
423 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  34.01 
 
 
147 aa  80.1  0.000000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  37.24 
 
 
426 aa  80.1  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  33.8 
 
 
242 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  31.51 
 
 
427 aa  77.4  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  33.97 
 
 
234 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  32.87 
 
 
230 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  35.17 
 
 
216 aa  77  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  34.72 
 
 
221 aa  77  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  36.3 
 
 
223 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  35.17 
 
 
216 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  31.29 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  31.47 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  33.76 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  29.37 
 
 
229 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1490  signal transduction protein  33.57 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.421198 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  30.52 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  30 
 
 
232 aa  75.1  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  33.12 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2138  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  29.93 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  26.97 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  30.5 
 
 
243 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  31.69 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1899  putative signal transduction protein with CBS domains  35.33 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  33.12 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  33.56 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  31.21 
 
 
242 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  27.27 
 
 
229 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  26.57 
 
 
226 aa  71.6  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  29.93 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  33.1 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  31.51 
 
 
242 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  32.39 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  29.17 
 
 
230 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  32.43 
 
 
227 aa  71.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  34.48 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  31.97 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  30.28 
 
 
246 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  31.69 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 
241 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2711  CBS domain-containing membrane protein  34.25 
 
 
217 aa  71.2  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  31.85 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  33.56 
 
 
219 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  30.82 
 
 
410 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  31.37 
 
 
154 aa  70.5  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  29.53 
 
 
339 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  36.99 
 
 
144 aa  70.1  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.91 
 
 
243 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  31.82 
 
 
228 aa  70.1  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  30.34 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_8994  predicted protein  32.64 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  33.79 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0592801 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>