More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4839 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  100 
 
 
232 aa  464  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  65.2 
 
 
234 aa  290  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  55.2 
 
 
228 aa  209  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  55.26 
 
 
226 aa  208  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  51.54 
 
 
241 aa  185  6e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  41.26 
 
 
227 aa  155  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  41.15 
 
 
221 aa  122  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4802  signal-transduction protein containing cAMP- binding and CBS domains-like protein  36.44 
 
 
219 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.476342  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1650  putative CBS domain-containing signal transduction protein  37.61 
 
 
218 aa  101  8e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0992945  normal  0.691102 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2711  CBS domain-containing membrane protein  37.78 
 
 
217 aa  99.8  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4840  signal-transduction protein containing cAMP- binding and CBS domains-like protein  34.96 
 
 
222 aa  98.6  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  33.48 
 
 
243 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  31.58 
 
 
242 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.17 
 
 
243 aa  95.5  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  32.89 
 
 
243 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  33.19 
 
 
230 aa  92.8  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1310  CBS  37.83 
 
 
213 aa  90.1  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  32.23 
 
 
231 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  34.64 
 
 
149 aa  90.1  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  30.87 
 
 
228 aa  89.7  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.85 
 
 
338 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2522  CBS domain containing membrane protein  34.35 
 
 
235 aa  88.6  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0807239 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  36.3 
 
 
426 aa  87.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  34.16 
 
 
339 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  34.59 
 
 
161 aa  86.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  37.27 
 
 
339 aa  85.1  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  31.58 
 
 
242 aa  85.1  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  34.36 
 
 
333 aa  84.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  28.7 
 
 
241 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  35.9 
 
 
423 aa  84  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  32.14 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  30.8 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  32.03 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  31.51 
 
 
232 aa  81.6  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  33.04 
 
 
223 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  32.48 
 
 
152 aa  80.5  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  26.29 
 
 
233 aa  80.1  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  35.06 
 
 
348 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  29.26 
 
 
230 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  34.01 
 
 
230 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  27.95 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  31.85 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2138  putative signal transduction protein with CBS domains  35.14 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  34.21 
 
 
427 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  32.9 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  35.68 
 
 
196 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  34.39 
 
 
229 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  33.33 
 
 
226 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  35.37 
 
 
217 aa  77  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  27.8 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  32.41 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  31.46 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  31.37 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  33.99 
 
 
417 aa  74.7  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1490  signal transduction protein  34.46 
 
 
150 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.421198 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  33.97 
 
 
229 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  31.65 
 
 
149 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  30.41 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  35.57 
 
 
428 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5476  signal-transduction protein  28.85 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184871  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5097  signal-transduction protein  28.85 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5185  signal-transduction protein  28.85 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254661  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  32.43 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3392  protein of unknown function DUF190  39.31 
 
 
433 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  29.87 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  40 
 
 
436 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  27.35 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  34.67 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2008  CBS  38.1 
 
 
330 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  29.3 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  29.49 
 
 
153 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  31.79 
 
 
427 aa  68.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  29.49 
 
 
153 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  31.21 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  32.89 
 
 
158 aa  67  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1799  putative signal transduction protein with CBS domains  31.31 
 
 
202 aa  67  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446245  normal  0.0519326 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  35.19 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  31.13 
 
 
410 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0640  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  29.81 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  27.57 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  30 
 
 
242 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  30.64 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  28.48 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_8994  predicted protein  33.78 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  27.04 
 
 
161 aa  64.3  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  30.87 
 
 
150 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2035  CBS domain containing membrane protein  31.72 
 
 
389 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02402  CBS domain protein  28.57 
 
 
148 aa  63.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.121948  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3827  CBS domain-containing protein  35.14 
 
 
391 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4541  CBS domain-containing protein  35.14 
 
 
391 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.0139408 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1669  CBS domain-containing protein  31.72 
 
 
389 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5763  CBS domain-containing protein  35.14 
 
 
391 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  27.56 
 
 
151 aa  63.5  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  30.72 
 
 
154 aa  63.2  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1897  signal-transduction protein  26.81 
 
 
231 aa  63.2  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1795  CBS domain-containing protein  30.34 
 
 
251 aa  63.2  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.346551  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1597  CBS domain containing membrane protein  28.85 
 
 
151 aa  62.8  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.105679 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1925  CBS domain protein  28.85 
 
 
151 aa  62.8  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  30.46 
 
 
373 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>