More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0490 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  100 
 
 
158 aa  310  5.999999999999999e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  53.25 
 
 
154 aa  172  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3228  XRE family transcriptional regulator  47.13 
 
 
158 aa  159  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0069  signal transduction protein  46.84 
 
 
158 aa  157  5e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  48.37 
 
 
154 aa  155  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2651  putative signal transduction protein with CBS domains  50.33 
 
 
161 aa  155  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0152  signal transduction protein  48.73 
 
 
160 aa  150  7e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  46.71 
 
 
153 aa  148  4e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  44.74 
 
 
153 aa  144  3e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  44.74 
 
 
153 aa  143  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  40.79 
 
 
153 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  39.07 
 
 
155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  37.01 
 
 
152 aa  97.4  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  40.51 
 
 
153 aa  97.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  33.77 
 
 
152 aa  96.7  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  35.95 
 
 
152 aa  96.3  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  35.71 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  32.3 
 
 
161 aa  94.4  5e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  38.75 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  38.75 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  37.97 
 
 
153 aa  92.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  39.35 
 
 
249 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  34.64 
 
 
148 aa  92.4  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  32.89 
 
 
210 aa  92.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  35.85 
 
 
154 aa  92  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  39.61 
 
 
153 aa  92  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  35.9 
 
 
154 aa  91.3  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  35.29 
 
 
149 aa  91.3  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  32.9 
 
 
214 aa  89  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  34.62 
 
 
150 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  39.49 
 
 
247 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  37.58 
 
 
230 aa  87.8  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  35.26 
 
 
150 aa  87.4  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  35.29 
 
 
149 aa  85.9  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  34.21 
 
 
150 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  35.71 
 
 
149 aa  84.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  32.89 
 
 
209 aa  84.3  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  36.23 
 
 
141 aa  84  8e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  37.58 
 
 
231 aa  84  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  35.33 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  32.91 
 
 
153 aa  83.6  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  35.26 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  31.13 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  31.13 
 
 
138 aa  82  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  35.76 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  34.38 
 
 
229 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  35.62 
 
 
229 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  34.62 
 
 
147 aa  80.9  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  36.18 
 
 
208 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  33.99 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  33.12 
 
 
214 aa  80.5  0.000000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  35.53 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  33.55 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  33.77 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  33.13 
 
 
243 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  34.64 
 
 
246 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  30 
 
 
215 aa  79  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  31.58 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  30.49 
 
 
242 aa  79  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  35.29 
 
 
234 aa  79  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  34.39 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  35.1 
 
 
426 aa  79  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  33.99 
 
 
230 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  34.9 
 
 
227 aa  77.4  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  34.16 
 
 
241 aa  77.4  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  33.13 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  34.42 
 
 
120 aa  76.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  32.93 
 
 
243 aa  77  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  36.18 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  33.11 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  29.03 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  29.88 
 
 
242 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  33.76 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  32.47 
 
 
282 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  30.63 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  32.03 
 
 
236 aa  75.5  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2522  CBS domain containing membrane protein  38.22 
 
 
235 aa  75.5  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0807239 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  32.9 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  31.21 
 
 
230 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0960  CBS domain-containing protein  29.53 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0461508  hitchhiker  0.00174257 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  33.99 
 
 
216 aa  74.7  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.71 
 
 
243 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  32.45 
 
 
242 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  31.54 
 
 
279 aa  74.3  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0630  CBS domain-containing protein  31.33 
 
 
279 aa  73.9  0.0000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  32.69 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  36.6 
 
 
216 aa  73.9  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  31.82 
 
 
141 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  33.99 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  32.24 
 
 
769 aa  72.8  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  29.81 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2021  CBS domain containing membrane protein  30.77 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  29.33 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  28.95 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  29.19 
 
 
219 aa  72  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  29.87 
 
 
220 aa  72  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  33.55 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  30.61 
 
 
683 aa  72  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  30.14 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  28.1 
 
 
279 aa  71.6  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>