More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3833 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 
201 aa  387  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  36.92 
 
 
191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1799  putative signal transduction protein with CBS domains  39.5 
 
 
202 aa  106  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446245  normal  0.0519326 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5476  signal-transduction protein  36.92 
 
 
189 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184871  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5097  signal-transduction protein  36.92 
 
 
189 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5185  signal-transduction protein  36.92 
 
 
189 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254661  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  36 
 
 
201 aa  100  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  48.85 
 
 
141 aa  95.9  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  37.09 
 
 
152 aa  95.1  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  36.04 
 
 
196 aa  88.6  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  34.56 
 
 
230 aa  85.5  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  39.85 
 
 
132 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  32.56 
 
 
232 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  32.24 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  34.78 
 
 
241 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  32.57 
 
 
246 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  33.5 
 
 
228 aa  81.6  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  34.91 
 
 
233 aa  80.1  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  32.39 
 
 
229 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  35.67 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  34.69 
 
 
161 aa  79.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0394  CBS domain-containing membrane protein  32.16 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  30.7 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  34.51 
 
 
148 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  35.42 
 
 
249 aa  76.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  32.89 
 
 
339 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  32 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  31.08 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  34.01 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  33.11 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  29.77 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  37.88 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  31.51 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  31.51 
 
 
230 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  28.84 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  34.81 
 
 
120 aa  73.6  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  33.02 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  32.09 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  30.84 
 
 
226 aa  72  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  30.82 
 
 
152 aa  72  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  32.39 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  33 
 
 
193 aa  72  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  32 
 
 
154 aa  72  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  33.79 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  37.88 
 
 
216 aa  71.2  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  32.24 
 
 
229 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  32.88 
 
 
152 aa  70.5  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  36.24 
 
 
154 aa  70.9  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  38.89 
 
 
141 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  37.88 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  34.59 
 
 
161 aa  70.9  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  33.56 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  32.62 
 
 
313 aa  70.5  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  30 
 
 
339 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  31.29 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.65 
 
 
338 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1072  CBS domain containing protein  37.21 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  30.73 
 
 
231 aa  69.3  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  29.86 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  29.38 
 
 
232 aa  68.6  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  30.14 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  30.14 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  28.22 
 
 
217 aa  68.2  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  34.25 
 
 
149 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  29.17 
 
 
151 aa  67.8  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  28.47 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  32.19 
 
 
149 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  31.32 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  33.13 
 
 
241 aa  67  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  29.73 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  37.24 
 
 
332 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  31.51 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  30.94 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  32.19 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1632  CBS domain-containing protein  36.22 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  28.99 
 
 
426 aa  65.5  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  30.56 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  28.93 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  30.15 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  32.43 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5763  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 
391 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  34.21 
 
 
348 aa  64.7  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  34.18 
 
 
333 aa  64.7  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  30.52 
 
 
154 aa  64.3  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  27.78 
 
 
152 aa  63.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3827  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 
391 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  34.85 
 
 
209 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  29.69 
 
 
909 aa  63.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4541  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 
391 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.0139408 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  34.46 
 
 
153 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  31.51 
 
 
150 aa  62.8  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  33.57 
 
 
391 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  28.48 
 
 
909 aa  62.8  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  33.58 
 
 
282 aa  62.8  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  32.86 
 
 
256 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1789  CBS domain-containing protein  31.62 
 
 
385 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228479  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
153 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1762  CBS domain-containing protein  31.78 
 
 
258 aa  62.4  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0911451  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  33.33 
 
 
142 aa  62.8  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>