More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2451 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  100 
 
 		 141 aa  275  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1799  putative signal transduction protein with CBS domains  56.72 
 
 		 202 aa  107  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446245  normal  0.0519326 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  45.74 
 
 		 201 aa  88.2  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  42.54 
 
 		 225 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  44.88 
 
 		 216 aa  85.9  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  40.43 
 
 		 225 aa  84.3  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  38.1 
 
 		 191 aa  84.3  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  38.03 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  37.5 
 
 		 348 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  35.61 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  34.38 
 
 		 279 aa  80.9  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  36.84 
 
 		 215 aa  80.9  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  36.99 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  35.42 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  39.23 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  37.06 
 
 		 226 aa  77.4  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  32.87 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  40.62 
 
 		 212 aa  77.4  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  39.68 
 
 		 193 aa  77  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  39.84 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  40.62 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  38.24 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  31.15 
 
 		 845 aa  75.1  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  38.73 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  37.21 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  35.11 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1789  CBS domain-containing protein  33.88 
 
 		 385 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228479  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  35.82 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  31.01 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  35.66 
 
 		 242 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  33.06 
 
 		 142 aa  72  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  37.14 
 
 		 867 aa  71.2  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  38.4 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  35.62 
 
 		 241 aa  70.9  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  37.21 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  30.08 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  30.56 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  37.3 
 
 		 282 aa  70.9  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  30.43 
 
 		 880 aa  70.5  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0394  CBS domain-containing membrane protein  35.38 
 
 		 201 aa  70.1  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1899  putative signal transduction protein with CBS domains  36.17 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  33.56 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  28.91 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  28.91 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  36.92 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  34.88 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  34.75 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  34.67 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  37.21 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  36.92 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2349  CBS domain-containing protein  32.23 
 
 		 384 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  31.47 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  29.32 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  32.59 
 
 		 769 aa  68.2  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  31.15 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  28.46 
 
 		 279 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2268  signal transduction protein  32.31 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.220391  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  33.83 
 
 		 320 aa  68.2  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.72 
 
 		 338 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5608  signal transduction protein  34.88 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  31.75 
 
 		 907 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3347  CBS domain-containing protein  32.23 
 
 		 384 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  32.87 
 
 		 149 aa  67  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  31.37 
 
 		 223 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  32.33 
 
 		 220 aa  67.4  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  36.51 
 
 		 155 aa  67  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  34.85 
 
 		 386 aa  67  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  36.88 
 
 		 903 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  31.41 
 
 		 243 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  32.39 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  35.43 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  30.41 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.39 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  32.39 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  37.8 
 
 		 382 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  36.51 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  36.43 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  32.89 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1949  CBS domain-containing protein  31.4 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429977  normal  0.0328188 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  35.76 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  30.99 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  35.38 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  35.2 
 
 		 640 aa  65.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  38.35 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  31.94 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  34.48 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  34.48 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2666  putative signal transduction protein with CBS domains  32.8 
 
 		 252 aa  65.1  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113422  normal  0.552797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  32.9 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  34.04 
 
 		 903 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  32.03 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  36.03 
 
 		 373 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  37.8 
 
 		 382 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  36.96 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  31.08 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  30.28 
 
 		 242 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2230  signal transduction protein  38.4 
 
 		 249 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  36.22 
 
 		 370 aa  64.7  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  29.29 
 
 		 877 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>