More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0680 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  500  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  48.54 
 
 		 242 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  50 
 
 		 242 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  49.1 
 
 		 242 aa  225  4e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  49.1 
 
 		 243 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  48.2 
 
 		 243 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  45.5 
 
 		 243 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  46.22 
 
 		 243 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  46.64 
 
 		 226 aa  205  5e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  40.27 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  41.56 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  41.59 
 
 		 231 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  38.22 
 
 		 230 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  41.23 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  38.43 
 
 		 246 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  38.67 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  36.94 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  39.74 
 
 		 229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  36.65 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  38.01 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  39.82 
 
 		 247 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  38.11 
 
 		 246 aa  138  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  39.22 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  38.86 
 
 		 236 aa  135  5e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  33.63 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6177  transport-associated  40.54 
 
 		 198 aa  125  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1897  signal-transduction protein  32.73 
 
 		 231 aa  119  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  31.86 
 
 		 223 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2522  CBS domain containing membrane protein  37.72 
 
 		 235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0807239 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  34.76 
 
 		 232 aa  112  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  36.31 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.88 
 
 		 338 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  33.98 
 
 		 217 aa  102  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  36.99 
 
 		 339 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  35.62 
 
 		 152 aa  97.1  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  36.14 
 
 		 333 aa  93.2  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  39.35 
 
 		 158 aa  92.4  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  32.65 
 
 		 149 aa  92  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  34.93 
 
 		 152 aa  91.3  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  38.3 
 
 		 427 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  37.93 
 
 		 153 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  37.93 
 
 		 153 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  39.33 
 
 		 153 aa  90.1  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  37.24 
 
 		 153 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  34.27 
 
 		 152 aa  89  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  34.25 
 
 		 147 aa  88.6  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  30.09 
 
 		 191 aa  87.8  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  29.69 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  29.73 
 
 		 149 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  31.94 
 
 		 155 aa  86.7  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  31.49 
 
 		 348 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  35.92 
 
 		 149 aa  86.3  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2711  CBS domain-containing membrane protein  31.94 
 
 		 217 aa  85.9  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  35.42 
 
 		 153 aa  85.5  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2651  putative signal transduction protein with CBS domains  36.18 
 
 		 161 aa  85.1  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  36.11 
 
 		 151 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  33.33 
 
 		 152 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  36.81 
 
 		 154 aa  85.1  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  35.71 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  36.17 
 
 		 148 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  36.88 
 
 		 428 aa  82.4  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  30.8 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  30.87 
 
 		 155 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  31.51 
 
 		 149 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  32.12 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  31.91 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  33.63 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  33.11 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  31.51 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  32 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  41.01 
 
 		 769 aa  79.3  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5476  signal-transduction protein  30.7 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5097  signal-transduction protein  30.7 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5185  signal-transduction protein  30.7 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 		 410 aa  79  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  30.19 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  31.76 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  34.01 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  28.76 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  40.74 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  33.11 
 
 		 151 aa  77.8  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0069  signal transduction protein  33.99 
 
 		 158 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  35.66 
 
 		 150 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1006  HPP family protein+B94  31.25 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  32.64 
 
 		 132 aa  77  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  34.69 
 
 		 150 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  32.93 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  37.93 
 
 		 427 aa  76.6  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  32.47 
 
 		 161 aa  77  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  31.25 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  36.05 
 
 		 404 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  31.91 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  32.88 
 
 		 208 aa  74.7  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  30.52 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  32.14 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  36 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  28.77 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  37.33 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  34.51 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>