More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1851 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  100 
 
 
151 aa  297  3e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  53.02 
 
 
152 aa  175  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  53.38 
 
 
150 aa  173  7e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  52.7 
 
 
152 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  52.38 
 
 
150 aa  168  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  52.38 
 
 
150 aa  167  4e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  52.7 
 
 
148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  39.86 
 
 
147 aa  118  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  37.76 
 
 
153 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  35.86 
 
 
155 aa  114  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  38.1 
 
 
149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  37.84 
 
 
150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  34.46 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  36.11 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  35.14 
 
 
149 aa  107  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  31.76 
 
 
154 aa  107  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  37.41 
 
 
154 aa  107  8.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  35.14 
 
 
149 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1925  CBS domain protein  33.56 
 
 
151 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1597  CBS domain containing membrane protein  33.56 
 
 
151 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.105679 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  31.76 
 
 
149 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  31.08 
 
 
149 aa  101  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  31.76 
 
 
153 aa  101  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  31.29 
 
 
152 aa  100  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  31.29 
 
 
152 aa  96.3  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0960  CBS domain-containing protein  32.19 
 
 
153 aa  93.6  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0461508  hitchhiker  0.00174257 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  32.41 
 
 
230 aa  92  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  30.56 
 
 
153 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  30.56 
 
 
153 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  36.55 
 
 
242 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  31.29 
 
 
151 aa  87.8  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  30.07 
 
 
153 aa  87.4  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  34.01 
 
 
246 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  32.43 
 
 
150 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  30.14 
 
 
226 aa  85.1  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  30.56 
 
 
229 aa  85.5  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  36.11 
 
 
249 aa  84.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  33.79 
 
 
154 aa  84.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  28.47 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  31.72 
 
 
230 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  31.97 
 
 
246 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  31.33 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  33.54 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  29.86 
 
 
223 aa  80.5  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  31.97 
 
 
247 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1899  putative signal transduction protein with CBS domains  34.9 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  33.11 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  31.58 
 
 
158 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  34.27 
 
 
217 aa  78.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  30.82 
 
 
231 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  31.97 
 
 
242 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  33.1 
 
 
191 aa  77.4  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  31.94 
 
 
231 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  32.41 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  33.33 
 
 
243 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.69 
 
 
243 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  35.86 
 
 
904 aa  74.3  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  28.67 
 
 
160 aa  74.3  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2021  CBS domain containing membrane protein  32.28 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  31.97 
 
 
242 aa  74.3  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  30.07 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  29.17 
 
 
120 aa  73.6  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  30.61 
 
 
873 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  29.17 
 
 
132 aa  73.6  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  32.64 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1897  signal-transduction protein  29.08 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  32.41 
 
 
232 aa  72.8  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2651  putative signal transduction protein with CBS domains  34.23 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  27.08 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  28.86 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17501  IMP dehydrogenase-like protein  27.89 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  31.29 
 
 
243 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  29.17 
 
 
233 aa  71.6  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  29.41 
 
 
154 aa  72  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  31.72 
 
 
769 aa  72  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  32.43 
 
 
243 aa  71.6  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  30.32 
 
 
404 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  33.1 
 
 
219 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  31.94 
 
 
216 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.24 
 
 
338 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  33.79 
 
 
223 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  30.56 
 
 
208 aa  70.9  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  30.56 
 
 
232 aa  71.2  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  33.79 
 
 
909 aa  70.5  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  25.52 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  30.13 
 
 
164 aa  70.1  0.000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2287  CBS domain containing membrane protein  27.97 
 
 
135 aa  70.1  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146345  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  32.68 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  28.86 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  34.03 
 
 
909 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  32.68 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  30.07 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  29.41 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_8994  predicted protein  29.37 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  28.17 
 
 
845 aa  68.2  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1879  CBS  26.67 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  31.03 
 
 
224 aa  68.2  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  30.56 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  27.92 
 
 
339 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  31.03 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>