More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3002 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  100 
 
 
333 aa  659    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  48.19 
 
 
338 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  45.78 
 
 
339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  46.83 
 
 
339 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  43.64 
 
 
348 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  42.25 
 
 
332 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2008  CBS  40.76 
 
 
330 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1082  CBS domain-containing protein  50.93 
 
 
171 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70301  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  46.94 
 
 
230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  46.85 
 
 
230 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  45.03 
 
 
230 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  46.21 
 
 
229 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1171  hypothetical protein  34.97 
 
 
158 aa  103  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103455 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2707  hypothetical protein  36.03 
 
 
157 aa  102  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1567  hypothetical protein  40.98 
 
 
165 aa  100  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.41828  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  45.52 
 
 
229 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6910  hypothetical protein  46.24 
 
 
165 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5205  hypothetical protein  39.6 
 
 
156 aa  97.8  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  41.26 
 
 
242 aa  95.9  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  43.54 
 
 
231 aa  95.1  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4034  putative fusion protein: hypothetical conserved protein and adenylate cyclase protein  31.97 
 
 
155 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  38.36 
 
 
226 aa  94  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  36.14 
 
 
249 aa  93.2  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  39.16 
 
 
234 aa  93.2  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0054  hypothetical protein  44.32 
 
 
164 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1296  hypothetical protein  43.18 
 
 
164 aa  92  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  33.57 
 
 
149 aa  92  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2306  hypothetical protein  35.4 
 
 
163 aa  90.5  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0706708 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  41.84 
 
 
241 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0878  hypothetical protein  40.7 
 
 
151 aa  89.7  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  35.91 
 
 
155 aa  89.7  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  31.4 
 
 
228 aa  89.7  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  38.37 
 
 
246 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  34.12 
 
 
242 aa  89.4  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  36.5 
 
 
242 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  37.22 
 
 
231 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  38.67 
 
 
161 aa  86.7  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2451  hypothetical protein  37.76 
 
 
158 aa  86.3  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  38.03 
 
 
217 aa  85.5  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  34.04 
 
 
147 aa  85.1  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  34.36 
 
 
232 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  36.91 
 
 
232 aa  84.3  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  38.46 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  39.74 
 
 
223 aa  83.2  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  41.61 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  34.27 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  37.23 
 
 
242 aa  82.8  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  33.57 
 
 
154 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  35.77 
 
 
132 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  35.04 
 
 
243 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  32.56 
 
 
233 aa  80.9  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2138  putative signal transduction protein with CBS domains  36.54 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  39.04 
 
 
227 aa  79.7  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.31 
 
 
243 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  32.85 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 
149 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 
149 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  30.43 
 
 
155 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  32.88 
 
 
150 aa  77.4  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  31.39 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  31.88 
 
 
151 aa  75.1  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  35.46 
 
 
226 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  34.29 
 
 
120 aa  74.3  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  33.09 
 
 
426 aa  74.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  36.3 
 
 
193 aa  73.6  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1310  CBS  37.67 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1490  signal transduction protein  35.26 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.421198 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  30.56 
 
 
423 aa  72.8  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  35.25 
 
 
226 aa  72.8  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2522  CBS domain containing membrane protein  37.67 
 
 
235 aa  70.9  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0807239 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  36.65 
 
 
427 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  34.75 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  29.29 
 
 
149 aa  70.1  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5097  signal-transduction protein  37.68 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5185  signal-transduction protein  37.68 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254661  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5476  signal-transduction protein  37.68 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184871  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4840  signal-transduction protein containing cAMP- binding and CBS domains-like protein  36.75 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  36.18 
 
 
158 aa  69.3  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  37.14 
 
 
246 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1137  hypothetical protein  41.33 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  33.33 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  29.86 
 
 
149 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1021  CBS domain-containing protein  38.13 
 
 
159 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473362  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  32.61 
 
 
153 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 
431 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4802  signal-transduction protein containing cAMP- binding and CBS domains-like protein  33.1 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.476342  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  32.16 
 
 
417 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  27.78 
 
 
151 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  41.67 
 
 
436 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2711  CBS domain-containing membrane protein  32.88 
 
 
217 aa  65.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  30.56 
 
 
149 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1897  signal-transduction protein  30.71 
 
 
231 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3392  protein of unknown function DUF190  40.28 
 
 
433 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  31.29 
 
 
153 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  37.42 
 
 
201 aa  64.3  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  34.72 
 
 
428 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6177  transport-associated  40.54 
 
 
198 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  30.14 
 
 
154 aa  63.5  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1799  putative signal transduction protein with CBS domains  34.93 
 
 
202 aa  63.2  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446245  normal  0.0519326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>