More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1649 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  100 
 
 
234 aa  464  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  65.2 
 
 
232 aa  290  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  53.1 
 
 
228 aa  204  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  51.98 
 
 
226 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  48.67 
 
 
241 aa  180  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  43.17 
 
 
227 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  41.85 
 
 
221 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4802  signal-transduction protein containing cAMP- binding and CBS domains-like protein  38.39 
 
 
219 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.476342  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2711  CBS domain-containing membrane protein  37.33 
 
 
217 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1650  putative CBS domain-containing signal transduction protein  36.36 
 
 
218 aa  112  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0992945  normal  0.691102 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1310  CBS  37.55 
 
 
213 aa  106  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  32.9 
 
 
242 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  31.93 
 
 
241 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4840  signal-transduction protein containing cAMP- binding and CBS domains-like protein  33.92 
 
 
222 aa  99  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  41.33 
 
 
428 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  38 
 
 
149 aa  96.7  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  32.16 
 
 
230 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  32 
 
 
223 aa  95.5  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  41.61 
 
 
427 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  32.47 
 
 
243 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.9 
 
 
243 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  39.16 
 
 
333 aa  93.2  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5476  signal-transduction protein  30.1 
 
 
189 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184871  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5097  signal-transduction protein  30.1 
 
 
189 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5185  signal-transduction protein  30.1 
 
 
189 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254661  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  32.49 
 
 
246 aa  92  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  28.96 
 
 
232 aa  92  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  36.94 
 
 
339 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  29.69 
 
 
228 aa  91.3  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  32.9 
 
 
243 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  35.62 
 
 
426 aa  90.5  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  38.85 
 
 
339 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  34.3 
 
 
161 aa  89.7  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  31.03 
 
 
231 aa  88.6  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2522  CBS domain containing membrane protein  33.19 
 
 
235 aa  87.4  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0807239 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  29.69 
 
 
249 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  33.76 
 
 
152 aa  86.3  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  33.12 
 
 
152 aa  85.9  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  29.87 
 
 
233 aa  86.3  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  31.17 
 
 
242 aa  85.9  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  37.75 
 
 
348 aa  85.1  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  34.62 
 
 
423 aa  84  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  31 
 
 
226 aa  83.6  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  33.96 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  29.69 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  33.64 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  29.65 
 
 
230 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  38.41 
 
 
427 aa  82.4  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  32.92 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  31.42 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  31.44 
 
 
229 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2138  putative signal transduction protein with CBS domains  36.24 
 
 
151 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.58 
 
 
338 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  29.61 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  34.3 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  31.41 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  32.72 
 
 
196 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  29.74 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  35.29 
 
 
158 aa  79  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  34.78 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  32.43 
 
 
153 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  31.33 
 
 
155 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1922  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 
196 aa  77  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  29.87 
 
 
229 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  34.64 
 
 
148 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  31.01 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1490  signal transduction protein  35.57 
 
 
150 aa  77  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.421198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  29.18 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  31.78 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2008  CBS  38.96 
 
 
330 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  32.48 
 
 
153 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  32.48 
 
 
153 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  28.3 
 
 
152 aa  74.7  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  32.67 
 
 
219 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  31.61 
 
 
154 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  40.4 
 
 
436 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0394  CBS domain-containing membrane protein  33.68 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3392  protein of unknown function DUF190  40.14 
 
 
433 aa  72  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  37.42 
 
 
153 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  28.95 
 
 
226 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  32.91 
 
 
154 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1799  putative signal transduction protein with CBS domains  31.16 
 
 
202 aa  70.1  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446245  normal  0.0519326 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  32.24 
 
 
417 aa  70.1  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  34.25 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02402  CBS domain protein  29.93 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.121948  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_8994  predicted protein  34.23 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  28.85 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0098  CBS domain-containing protein  31.79 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  27.31 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  37.24 
 
 
431 aa  68.6  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  30.91 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  35.06 
 
 
332 aa  68.6  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  30.92 
 
 
149 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  28.82 
 
 
236 aa  67.8  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  32 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  30.97 
 
 
153 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  30.07 
 
 
147 aa  68.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2666  putative signal transduction protein with CBS domains  30.61 
 
 
252 aa  67  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113422  normal  0.552797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>