More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2974 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  100 
 
 
417 aa  825    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  33.02 
 
 
426 aa  226  7e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  34.38 
 
 
427 aa  218  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  35.41 
 
 
428 aa  207  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  33.41 
 
 
436 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  32.37 
 
 
427 aa  186  5e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  31.83 
 
 
423 aa  186  6e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3392  protein of unknown function DUF190  33.64 
 
 
433 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  32.4 
 
 
431 aa  179  8e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2284  hypothetical protein  54.29 
 
 
113 aa  125  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0310791  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1697  hypothetical protein  27.04 
 
 
413 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2472  hypothetical protein  49 
 
 
110 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2769  protein of unknown function DUF190  49.04 
 
 
110 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0907  protein of unknown function DUF190  53.61 
 
 
114 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.59856  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2999  protein of unknown function DUF190  48.42 
 
 
110 aa  106  7e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2103  hypothetical protein  46.08 
 
 
116 aa  100  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2947  hypothetical protein  48.08 
 
 
114 aa  99.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.488215  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2322  hypothetical protein  26.95 
 
 
414 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2039  hypothetical protein  48.51 
 
 
112 aa  98.2  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.364154  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0462  protein of unknown function DUF190  51.11 
 
 
131 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.393164 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0192  protein of unknown function DUF190  48.84 
 
 
115 aa  95.9  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0769  hypothetical protein  48 
 
 
119 aa  94.7  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0819  hypothetical protein  48 
 
 
119 aa  94.7  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622964  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0982  hypothetical protein  42.27 
 
 
112 aa  95.1  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0955  protein of unknown function DUF190  39.09 
 
 
112 aa  93.6  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2688  hypothetical protein  50.55 
 
 
116 aa  93.2  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185071  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2397  protein of unknown function DUF190  45.65 
 
 
111 aa  93.2  8e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0610  hypothetical protein  44.21 
 
 
138 aa  92  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.309458  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0237  hypothetical protein  42.31 
 
 
118 aa  91.7  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.627259  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3017  hypothetical protein  41.67 
 
 
114 aa  91.3  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0306323  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4548  hypothetical protein  44.12 
 
 
114 aa  90.9  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.554874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3966  protein of unknown function DUF190  46.88 
 
 
130 aa  90.1  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0280785  normal  0.332101 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2558  hypothetical protein  42.55 
 
 
112 aa  89.7  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0504  hypothetical protein  40.91 
 
 
119 aa  89.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0703  protein of unknown function DUF190  42.39 
 
 
125 aa  89.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2323  hypothetical protein  50 
 
 
114 aa  89  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.329847  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2283  protein of unknown function DUF190  46.81 
 
 
115 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0715  protein of unknown function DUF190  42.39 
 
 
125 aa  89.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12794e-21 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1536  hypothetical protein  42.86 
 
 
114 aa  89  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.150946  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2801  protein of unknown function DUF190  43.16 
 
 
111 aa  89  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.628969  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0201  protein of unknown function DUF190  42.53 
 
 
113 aa  87.8  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.284086  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1022  protein of unknown function DUF190  45.65 
 
 
112 aa  87.8  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0929  hypothetical protein  38.68 
 
 
108 aa  87.4  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.846171  hitchhiker  0.00345393 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1919  CBS domain containing protein  24.06 
 
 
409 aa  87.4  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042523 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0834  hypothetical protein  41.58 
 
 
112 aa  87  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.858155  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2494  hypothetical protein  43.62 
 
 
107 aa  84  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1259  hypothetical protein  40.59 
 
 
114 aa  84  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.851649  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2956  hypothetical protein  43.43 
 
 
128 aa  83.6  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  35.42 
 
 
227 aa  83.2  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3713  hypothetical protein  37.37 
 
 
126 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0521  hypothetical protein  42.31 
 
 
110 aa  82.8  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  33.99 
 
 
232 aa  80.9  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0902  hypothetical protein  40 
 
 
102 aa  80.9  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  31.77 
 
 
242 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0924  hypothetical protein  38.95 
 
 
102 aa  80.1  0.00000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  35.33 
 
 
147 aa  80.1  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  40.22 
 
 
270 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2545  hypothetical protein  37.25 
 
 
118 aa  78.2  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  34.44 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0396  hypothetical protein  44.44 
 
 
115 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265474  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  33.56 
 
 
226 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  36.55 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  33.11 
 
 
348 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5462  hypothetical protein  41.84 
 
 
114 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.516775  normal  0.0516073 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0526  hypothetical protein  38.3 
 
 
123 aa  77  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245852  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  32.24 
 
 
234 aa  76.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  27.04 
 
 
161 aa  75.5  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  32.67 
 
 
231 aa  75.1  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  34.69 
 
 
246 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1796  CBS domain-containing protein  24.26 
 
 
315 aa  75.1  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.507937  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  30.61 
 
 
149 aa  75.1  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1100  hypothetical protein  33.67 
 
 
107 aa  74.7  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.418533  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.78 
 
 
338 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1418  hypothetical protein  37.76 
 
 
102 aa  73.6  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0187678  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1797  CBS domain-containing protein  25.86 
 
 
279 aa  72.4  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.966854  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  33.33 
 
 
151 aa  72.4  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  34.64 
 
 
241 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  33.56 
 
 
230 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  32.16 
 
 
333 aa  72  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  28.76 
 
 
154 aa  72  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0181  hypothetical protein  36.96 
 
 
105 aa  71.2  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  29.66 
 
 
228 aa  70.9  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0847  signal transduction protein  28.31 
 
 
287 aa  70.5  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766257  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  35.51 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  34.19 
 
 
339 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  31.13 
 
 
226 aa  69.3  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  28.97 
 
 
155 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0334  hypothetical protein  33.01 
 
 
111 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  30.43 
 
 
215 aa  68.9  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.11 
 
 
243 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  31.69 
 
 
217 aa  68.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  31.47 
 
 
368 aa  68.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1282  hypothetical protein  30.3 
 
 
113 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0271476  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  23.01 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  31.58 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  32.86 
 
 
160 aa  67.8  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  30.82 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  30.61 
 
 
153 aa  67.4  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  29.71 
 
 
215 aa  67  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  25.86 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>