More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1228 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  100 
 
 		 339 aa  684    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  83.78 
 
 		 339 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  68.73 
 
 		 338 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  58.61 
 
 		 348 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  46.08 
 
 		 333 aa  278  8e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  42.14 
 
 		 332 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2008  CBS  42.81 
 
 		 330 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  44.59 
 
 		 230 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1082  CBS domain-containing protein  54.64 
 
 		 171 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  41.5 
 
 		 231 aa  119  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  45.27 
 
 		 230 aa  113  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  37.29 
 
 		 230 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  44.03 
 
 		 241 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  43.14 
 
 		 231 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  40.79 
 
 		 228 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  44.59 
 
 		 229 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  40.24 
 
 		 242 aa  107  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  38.51 
 
 		 246 aa  106  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  36.59 
 
 		 242 aa  105  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  39.87 
 
 		 223 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  42.33 
 
 		 229 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  35 
 
 		 226 aa  104  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  36.69 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  36.73 
 
 		 242 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  36.31 
 
 		 249 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  38.51 
 
 		 247 aa  102  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5205  hypothetical protein  35.42 
 
 		 156 aa  102  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2707  hypothetical protein  41.05 
 
 		 157 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1171  hypothetical protein  44.21 
 
 		 158 aa  100  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103455 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 243 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  38.18 
 
 		 243 aa  96.3  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 243 aa  95.9  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6910  hypothetical protein  43.68 
 
 		 165 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  32.73 
 
 		 243 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  34.73 
 
 		 226 aa  95.1  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1567  hypothetical protein  42.7 
 
 		 165 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.41828  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  36.6 
 
 		 217 aa  94.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0054  hypothetical protein  43.68 
 
 		 164 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  31.13 
 
 		 149 aa  92  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1296  hypothetical protein  42.53 
 
 		 164 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  35.81 
 
 		 132 aa  90.5  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  36.94 
 
 		 234 aa  90.9  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  35.71 
 
 		 423 aa  89  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  27.39 
 
 		 233 aa  88.6  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2306  hypothetical protein  44.58 
 
 		 163 aa  87  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0706708 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  34.16 
 
 		 232 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  35.76 
 
 		 147 aa  86.7  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  32.08 
 
 		 154 aa  86.7  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4034  putative fusion protein: hypothetical conserved protein and adenylate cyclase protein  32.41 
 
 		 155 aa  86.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2522  CBS domain containing membrane protein  38.51 
 
 		 235 aa  86.3  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0807239 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  32.45 
 
 		 151 aa  85.1  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  34.67 
 
 		 149 aa  84  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  34 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  35.53 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  33.99 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  32.69 
 
 		 149 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  35.67 
 
 		 232 aa  82.4  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2451  hypothetical protein  37.11 
 
 		 158 aa  81.6  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  36.49 
 
 		 120 aa  81.6  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0878  hypothetical protein  40 
 
 		 151 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  36.18 
 
 		 427 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1650  putative CBS domain-containing signal transduction protein  35.29 
 
 		 218 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0992945  normal  0.691102 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  34.93 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  35.98 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  37.84 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  33.11 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2711  CBS domain-containing membrane protein  32.7 
 
 		 217 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  34.9 
 
 		 226 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  31.54 
 
 		 149 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  27.89 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  32.21 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  35.57 
 
 		 431 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 149 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  30.82 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6177  transport-associated  42.11 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5097  signal-transduction protein  32.87 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5185  signal-transduction protein  32.87 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5476  signal-transduction protein  32.87 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  31.51 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  32.21 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4802  signal-transduction protein containing cAMP- binding and CBS domains-like protein  30.32 
 
 		 219 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.476342  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  30.07 
 
 		 147 aa  71.6  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  30.72 
 
 		 150 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  31.13 
 
 		 150 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3769  CBS domain-containing protein  31.97 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  29.61 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  31.29 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3446  signal transduction protein  33.33 
 
 		 226 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2021  CBS domain containing membrane protein  32.32 
 
 		 164 aa  68.6  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  31.54 
 
 		 191 aa  68.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01920  Inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  30.71 
 
 		 154 aa  68.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.778717  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  36.11 
 
 		 436 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  30.97 
 
 		 153 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  32.19 
 
 		 873 aa  67  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  27.7 
 
 		 151 aa  67  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3392  protein of unknown function DUF190  36.81 
 
 		 433 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  29.19 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  35.57 
 
 		 769 aa  66.2  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  27.33 
 
 		 845 aa  66.2  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>