More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1873 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  88.65 
 
 		 229 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  85.22 
 
 		 230 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  50 
 
 		 230 aa  218  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  48.67 
 
 		 230 aa  210  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  45.65 
 
 		 231 aa  192  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  44.54 
 
 		 242 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  48.05 
 
 		 241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  43.67 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  46.4 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  41.59 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  40.87 
 
 		 242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  38.96 
 
 		 242 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  38.7 
 
 		 242 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.52 
 
 		 243 aa  148  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  39.74 
 
 		 249 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  36.52 
 
 		 243 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  35.22 
 
 		 243 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6177  transport-associated  44.81 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  37.28 
 
 		 223 aa  139  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  36.77 
 
 		 226 aa  135  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  34.63 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  38.46 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2522  CBS domain containing membrane protein  40.17 
 
 		 235 aa  123  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0807239 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  36.56 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1897  signal-transduction protein  31.9 
 
 		 231 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  35.11 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  35.32 
 
 		 232 aa  112  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  44.59 
 
 		 339 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  33.62 
 
 		 236 aa  108  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  42.86 
 
 		 339 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  34.8 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  46.21 
 
 		 333 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  37.01 
 
 		 147 aa  103  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  33.56 
 
 		 149 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  39.31 
 
 		 217 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  39.33 
 
 		 338 aa  98.6  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  41.89 
 
 		 348 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  34.84 
 
 		 201 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 		 120 aa  93.6  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  34.72 
 
 		 132 aa  92  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  35.45 
 
 		 193 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  32.47 
 
 		 149 aa  88.6  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  34.25 
 
 		 155 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  37.76 
 
 		 427 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  31.58 
 
 		 154 aa  87  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  32.47 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  32.89 
 
 		 151 aa  83.6  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  36.18 
 
 		 153 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  34.67 
 
 		 149 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  31.97 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  34 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  28.47 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  32.91 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  33.55 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  36.67 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  29.45 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  34.01 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  34.38 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  33.76 
 
 		 161 aa  81.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  30.92 
 
 		 152 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  31.25 
 
 		 155 aa  80.5  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  35.71 
 
 		 428 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  33.56 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  29.25 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  31.33 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0394  CBS domain-containing membrane protein  31.94 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  31.25 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  30.73 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.36 
 
 		 628 aa  78.2  0.00000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  31.72 
 
 		 149 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  29.87 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  33.78 
 
 		 153 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  34.27 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  28.19 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  34.27 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  29.37 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  32.65 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1922  CBS domain containing membrane protein  35.62 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  27.41 
 
 		 155 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  31.97 
 
 		 394 aa  74.7  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  38.1 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  33.97 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.71 
 
 		 620 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.892029  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  29.93 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  37.5 
 
 		 154 aa  72  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  31.76 
 
 		 154 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0960  CBS domain-containing protein  30.14 
 
 		 153 aa  71.6  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0461508  hitchhiker  0.00174257 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  32.86 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  28.67 
 
 		 153 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 		 153 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 155 aa  70.9  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  32.17 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  32.67 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  30.95 
 
 		 427 aa  69.7  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  30.84 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  34.03 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  28.78 
 
 		 845 aa  69.3  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0190  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.07 
 
 		 625 aa  68.9  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0550  CBS domain-containing protein  27.78 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>