More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2711 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2711  CBS domain-containing membrane protein  100 
 
 
217 aa  424  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  42.47 
 
 
227 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4802  signal-transduction protein containing cAMP- binding and CBS domains-like protein  37.9 
 
 
219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.476342  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1650  putative CBS domain-containing signal transduction protein  38.64 
 
 
218 aa  123  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0992945  normal  0.691102 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  37.33 
 
 
234 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4840  signal-transduction protein containing cAMP- binding and CBS domains-like protein  32.59 
 
 
222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  38.32 
 
 
228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  38.39 
 
 
241 aa  102  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  37.78 
 
 
232 aa  99.8  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  35.78 
 
 
221 aa  99  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  37.3 
 
 
226 aa  91.7  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  31.94 
 
 
249 aa  85.9  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  32.02 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1310  CBS  34.54 
 
 
213 aa  82  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  33.18 
 
 
242 aa  82  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  31.15 
 
 
241 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  32.52 
 
 
242 aa  81.3  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  30.3 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  32.7 
 
 
339 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  34 
 
 
191 aa  77  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  32.14 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  29.65 
 
 
426 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  28.83 
 
 
242 aa  75.1  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  30.94 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  31.94 
 
 
152 aa  72  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  34.25 
 
 
148 aa  71.2  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.49 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  29.13 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  32.62 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  31.54 
 
 
339 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.05 
 
 
321 aa  68.9  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1475  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.05 
 
 
321 aa  68.9  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  32.7 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  32.32 
 
 
226 aa  68.9  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  33.11 
 
 
348 aa  68.6  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  38.69 
 
 
392 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  27.39 
 
 
230 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  26.46 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  32.41 
 
 
416 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  31.51 
 
 
150 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
427 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  24.88 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  28.04 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  30.92 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  32.88 
 
 
333 aa  65.5  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  32.88 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  33.79 
 
 
465 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  33.1 
 
 
382 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  33.1 
 
 
346 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.73 
 
 
338 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  30.5 
 
 
373 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  25.9 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  32.61 
 
 
155 aa  64.7  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  33.1 
 
 
397 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  33.1 
 
 
397 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  33.1 
 
 
382 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  30.14 
 
 
147 aa  63.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  32.84 
 
 
142 aa  63.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  32.37 
 
 
209 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  33.1 
 
 
397 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  33.51 
 
 
193 aa  62.4  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  32.18 
 
 
428 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2522  CBS domain containing membrane protein  34.15 
 
 
235 aa  62.8  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0807239 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  25 
 
 
215 aa  62.4  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1568  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.39 
 
 
488 aa  62.4  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2035  CBS domain containing membrane protein  35.56 
 
 
389 aa  62.4  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  32.08 
 
 
247 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3439  hypothetical protein  32.59 
 
 
385 aa  62  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  29.25 
 
 
150 aa  62  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1669  CBS domain-containing protein  35.56 
 
 
389 aa  62  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  27.46 
 
 
155 aa  62  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  29.58 
 
 
211 aa  61.6  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  29.22 
 
 
223 aa  61.6  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  29.61 
 
 
154 aa  61.6  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40540  CBS domain-containing protein  32.59 
 
 
385 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  26.71 
 
 
152 aa  61.6  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3655  hypothetical protein  31.88 
 
 
389 aa  61.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  29.29 
 
 
132 aa  60.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  30.5 
 
 
217 aa  61.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  28.67 
 
 
153 aa  61.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5097  signal-transduction protein  28.25 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  28.32 
 
 
242 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5185  signal-transduction protein  28.25 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254661  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5476  signal-transduction protein  28.25 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184871  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  29.5 
 
 
223 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  29.17 
 
 
230 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3311  CBS domain-containing protein  30.15 
 
 
141 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.881932 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  27.21 
 
 
149 aa  59.7  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  28.87 
 
 
229 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2138  putative signal transduction protein with CBS domains  31.62 
 
 
151 aa  58.9  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  30.34 
 
 
151 aa  58.9  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1897  signal-transduction protein  26.13 
 
 
231 aa  59.3  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  27.81 
 
 
152 aa  58.5  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  30.07 
 
 
404 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  28.77 
 
 
391 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  27.43 
 
 
231 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5763  CBS domain-containing protein  28.37 
 
 
391 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3827  CBS domain-containing protein  29.79 
 
 
391 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  30.22 
 
 
423 aa  58.2  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  27.14 
 
 
256 aa  58.2  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>