More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0991 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  100 
 
 
196 aa  377  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  44.39 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0394  CBS domain-containing membrane protein  36.92 
 
 
201 aa  92  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5476  signal-transduction protein  35.23 
 
 
189 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184871  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5097  signal-transduction protein  35.23 
 
 
189 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5185  signal-transduction protein  35.23 
 
 
189 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254661  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  34.69 
 
 
153 aa  89.4  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  35.07 
 
 
223 aa  85.9  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  35.53 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  32.72 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  37.59 
 
 
391 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
153 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  38.3 
 
 
391 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
153 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  32.43 
 
 
152 aa  79  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  38.3 
 
 
391 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  35.68 
 
 
232 aa  78.2  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  32.42 
 
 
242 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  35.32 
 
 
241 aa  77.8  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5763  CBS domain-containing protein  37.59 
 
 
391 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  34.6 
 
 
221 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  30.87 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3827  CBS domain-containing protein  37.59 
 
 
391 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4541  CBS domain-containing protein  37.59 
 
 
391 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.0139408 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  35.46 
 
 
399 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  35.82 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  31.51 
 
 
242 aa  75.1  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  30.45 
 
 
243 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  32.16 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  32.09 
 
 
256 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  31.34 
 
 
215 aa  74.7  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  36.67 
 
 
161 aa  73.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  29.49 
 
 
226 aa  73.9  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.18 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  30.8 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  33.08 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  36.43 
 
 
423 aa  72.4  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  35.66 
 
 
427 aa  72  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  30.6 
 
 
215 aa  72  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  28.7 
 
 
230 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  33.81 
 
 
227 aa  71.2  0.000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  30.45 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  33.5 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  30.38 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  31.84 
 
 
228 aa  70.1  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0640  CBS domain-containing protein  34.93 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  33.15 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  32.72 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  34.93 
 
 
427 aa  68.9  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  33.58 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  31.94 
 
 
233 aa  68.6  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1799  putative signal transduction protein with CBS domains  35.67 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446245  normal  0.0519326 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  28.19 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  36.15 
 
 
368 aa  68.2  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  36.57 
 
 
378 aa  68.2  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  33.56 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  33.1 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  29.2 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  38.35 
 
 
146 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  29.87 
 
 
151 aa  67.4  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  38.35 
 
 
146 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  30.45 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  38.35 
 
 
146 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  28.57 
 
 
210 aa  67  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  27.33 
 
 
155 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  33.58 
 
 
216 aa  67  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.86 
 
 
488 aa  67  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  25.62 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1907  CBS domain-containing protein  33.83 
 
 
232 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416143  hitchhiker  0.0000404489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  33.51 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  29.49 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  35.17 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  37.59 
 
 
386 aa  65.9  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  30.6 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  28.21 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  35.29 
 
 
221 aa  65.1  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  32.35 
 
 
382 aa  64.7  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  36.57 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  30.6 
 
 
223 aa  64.7  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  32.35 
 
 
214 aa  64.3  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  32.89 
 
 
339 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  29.41 
 
 
231 aa  63.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  31.08 
 
 
149 aa  64.3  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  32.21 
 
 
153 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  33.82 
 
 
144 aa  64.3  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  29.73 
 
 
150 aa  63.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  29.37 
 
 
428 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  32.19 
 
 
148 aa  63.2  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  31.21 
 
 
339 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  27.41 
 
 
426 aa  63.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  32.48 
 
 
143 aa  63.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  31.08 
 
 
149 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  29.86 
 
 
231 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0178  CBS domain-containing protein  32.91 
 
 
145 aa  63.2  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4727  thioesterase family protein  31.11 
 
 
437 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4341  CBS domain-containing cytosolic protein  31.11 
 
 
437 aa  62.8  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4353  CBS domain-containing cytosolic protein  31.11 
 
 
437 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4858  thioesterase family protein  31.11 
 
 
437 aa  62.8  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  27.06 
 
 
228 aa  62.8  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_8994  predicted protein  30.88 
 
 
133 aa  62.8  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>