More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1108 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  100 
 
 		 221 aa  426  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1310  CBS  51.16 
 
 		 213 aa  167  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  44.2 
 
 		 228 aa  142  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  41.85 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  39.53 
 
 		 227 aa  132  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4802  signal-transduction protein containing cAMP- binding and CBS domains-like protein  41.51 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.476342  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  41.15 
 
 		 232 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1650  putative CBS domain-containing signal transduction protein  41.1 
 
 		 218 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0992945  normal  0.691102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  44.74 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4840  signal-transduction protein containing cAMP- binding and CBS domains-like protein  38.91 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  38.2 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2711  CBS domain-containing membrane protein  35.78 
 
 		 217 aa  99  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  40.14 
 
 		 427 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  34.03 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  30.63 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  32.65 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  34.72 
 
 		 148 aa  77  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  34.6 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2651  putative signal transduction protein with CBS domains  37.75 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  35.67 
 
 		 428 aa  75.1  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  26.58 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  31.73 
 
 		 232 aa  74.7  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  26.8 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  29.65 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  31.82 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  27.39 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  30.06 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  29.39 
 
 		 231 aa  72  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  29.73 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  27.78 
 
 		 155 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  31.21 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  27.81 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  27.81 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  28.7 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  27.56 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  29.3 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  32.88 
 
 		 427 aa  69.3  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.81 
 
 		 338 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  37.68 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  32.64 
 
 		 149 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  30.41 
 
 		 154 aa  67.4  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  31.13 
 
 		 154 aa  67.8  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  35.37 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  30.81 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  34.25 
 
 		 149 aa  67  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2138  putative signal transduction protein with CBS domains  32.67 
 
 		 151 aa  67  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  34.51 
 
 		 149 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  31.96 
 
 		 246 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  30.94 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  33.54 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40540  CBS domain-containing protein  37.88 
 
 		 385 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  30.45 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  32 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2035  CBS domain containing membrane protein  32.61 
 
 		 389 aa  66.2  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1669  CBS domain-containing protein  32.61 
 
 		 389 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  26.92 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  27.59 
 
 		 426 aa  65.5  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  27.21 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3439  hypothetical protein  37.12 
 
 		 385 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 242 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1490  signal transduction protein  32.67 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.421198 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  32.59 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2784  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.29 
 
 		 495 aa  64.3  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.757104  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  33.51 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  33.58 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  30.53 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  27.63 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  30.15 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0069  signal transduction protein  28.48 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3209  putative signal transduction protein with CBS domains  30.83 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  36.43 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0890  CBS domain-containing protein  32.61 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  30.99 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0640  CBS domain-containing protein  34.53 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1922  CBS domain containing membrane protein  33.57 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  29.93 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  29.53 
 
 		 154 aa  62  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  33.33 
 
 		 161 aa  62  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  30.15 
 
 		 219 aa  62  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  31.79 
 
 		 339 aa  62  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_8994  predicted protein  34.07 
 
 		 133 aa  62  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  30.36 
 
 		 241 aa  62  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  28.08 
 
 		 147 aa  62  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2520  putative signal transduction protein with CBS domains  30.83 
 
 		 143 aa  62  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1907  CBS domain-containing protein  32.88 
 
 		 232 aa  62  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416143  hitchhiker  0.0000404489 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  33.11 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  34.56 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  28 
 
 		 243 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  33.12 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  36.05 
 
 		 431 aa  61.6  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2526  signal-transduction protein  34.88 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.526316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  30.34 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0774  CBS  30.07 
 
 		 157 aa  61.2  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  31.21 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0847  signal transduction protein  28.78 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  32.39 
 
 		 142 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  27.15 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.15 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  26.62 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  29.41 
 
 		 120 aa  60.8  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>