More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1824 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  100 
 
 
154 aa  313  7e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  63.95 
 
 
153 aa  204  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  63.58 
 
 
152 aa  201  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  63.16 
 
 
153 aa  199  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  61.18 
 
 
152 aa  196  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  60.39 
 
 
153 aa  194  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  60.39 
 
 
153 aa  194  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0774  CBS  47.97 
 
 
157 aa  150  5.9999999999999996e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1879  CBS  47.97 
 
 
157 aa  147  4e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17501  IMP dehydrogenase-like protein  47.97 
 
 
156 aa  144  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  43.84 
 
 
152 aa  132  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  39.86 
 
 
153 aa  120  7e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  38.78 
 
 
148 aa  111  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  37.41 
 
 
151 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  35.1 
 
 
155 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  40.94 
 
 
154 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  35.81 
 
 
149 aa  103  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  35.14 
 
 
149 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  41.22 
 
 
243 aa  99.4  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  36.81 
 
 
150 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  35.86 
 
 
150 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  37.24 
 
 
150 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  32.19 
 
 
154 aa  96.7  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  31.97 
 
 
149 aa  95.9  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 
149 aa  95.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  29.86 
 
 
147 aa  94.7  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  31.29 
 
 
152 aa  95.1  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  36.67 
 
 
153 aa  95.1  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  38.89 
 
 
160 aa  94.7  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 
149 aa  94.4  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  38.19 
 
 
242 aa  92.8  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  35.85 
 
 
158 aa  92  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  34.67 
 
 
226 aa  91.7  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  36.73 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  37.58 
 
 
241 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  37.84 
 
 
226 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  37.58 
 
 
231 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  36.81 
 
 
249 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  35.57 
 
 
216 aa  85.1  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  35.57 
 
 
216 aa  84.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  34.25 
 
 
246 aa  84  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  33.56 
 
 
230 aa  84  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  36.73 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  33.33 
 
 
242 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  33.77 
 
 
427 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  34.25 
 
 
247 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  32.64 
 
 
243 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  33.77 
 
 
423 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
428 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  31.97 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  30.38 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  33.1 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  30 
 
 
410 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  31.51 
 
 
223 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  31.72 
 
 
242 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.1 
 
 
243 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  29.86 
 
 
149 aa  77  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0960  CBS domain-containing protein  32.67 
 
 
153 aa  77  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0461508  hitchhiker  0.00174257 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  34.19 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  32.69 
 
 
154 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  33.56 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  34.72 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  34.19 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  31.65 
 
 
226 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  31.29 
 
 
230 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2429  signal transduction protein  33.78 
 
 
149 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  29.73 
 
 
231 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1434  CBS domain containing protein  33.11 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1529  CBS domain containing protein  33.11 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0765916  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1182  putative transcriptional regulator, XRE family  29.45 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000705125  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  32.65 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  27.52 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  29.73 
 
 
379 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1899  putative signal transduction protein with CBS domains  33.11 
 
 
149 aa  72  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  30.61 
 
 
219 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  27.52 
 
 
215 aa  71.6  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  32.43 
 
 
230 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  32.45 
 
 
217 aa  72  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  30.07 
 
 
221 aa  72  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_8994  predicted protein  31.25 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  32 
 
 
368 aa  71.2  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  31.51 
 
 
426 aa  71.6  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  31.76 
 
 
229 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  32.89 
 
 
212 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  28.75 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  32.9 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  27.52 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  29.73 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  33.56 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  36 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1450  CBS domain-containing protein  30.41 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.463338  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  32 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  33.33 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  32.21 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  30.56 
 
 
233 aa  69.3  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  33.79 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  30.91 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1395  CBS domain-containing protein  28.76 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.95 
 
 
628 aa  68.6  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>