More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1879 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1879  CBS  100 
 
 
157 aa  318  9.999999999999999e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0774  CBS  80.65 
 
 
157 aa  254  3e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17501  IMP dehydrogenase-like protein  71.15 
 
 
156 aa  233  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  47.97 
 
 
154 aa  147  4e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  45.64 
 
 
153 aa  141  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  43.24 
 
 
153 aa  140  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  44.59 
 
 
152 aa  138  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  42.95 
 
 
152 aa  134  5e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  44.22 
 
 
153 aa  133  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  44.22 
 
 
153 aa  133  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  37.41 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  33.1 
 
 
155 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  34.01 
 
 
152 aa  89.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  33.11 
 
 
223 aa  89.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  35.86 
 
 
154 aa  87.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  34.25 
 
 
148 aa  85.9  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  29.25 
 
 
149 aa  85.5  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  25.66 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  34.48 
 
 
243 aa  82  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  29.11 
 
 
161 aa  82  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  32.19 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  32.89 
 
 
226 aa  80.9  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  29.93 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  29.25 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  28.67 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  24.48 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  34.25 
 
 
230 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  31.08 
 
 
150 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  28.57 
 
 
149 aa  77  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  27.7 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  26.71 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  32 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  34.25 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  32.21 
 
 
427 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  33.57 
 
 
246 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  33.56 
 
 
231 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  30.61 
 
 
242 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  29.73 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_8994  predicted protein  30.07 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  33.1 
 
 
226 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  26.67 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  29.05 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  29.94 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1899  putative signal transduction protein with CBS domains  30.92 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  30.56 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  30.52 
 
 
428 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  30.61 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  27.63 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  28.85 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  33.56 
 
 
249 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  32.03 
 
 
229 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0069  signal transduction protein  28.48 
 
 
158 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  30.72 
 
 
229 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  31.33 
 
 
399 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  27.78 
 
 
243 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  26.85 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  29.87 
 
 
161 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  28.03 
 
 
153 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  26.62 
 
 
153 aa  60.8  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  26.62 
 
 
153 aa  60.8  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  30.61 
 
 
242 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1182  putative transcriptional regulator, XRE family  22.07 
 
 
147 aa  60.5  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000705125  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2349  CBS domain-containing protein  31.29 
 
 
384 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  25 
 
 
423 aa  60.1  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  29.68 
 
 
391 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  25.69 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  27.78 
 
 
243 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  27.27 
 
 
247 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  27.4 
 
 
228 aa  59.7  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  29.68 
 
 
391 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  22.84 
 
 
158 aa  59.3  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3347  CBS domain-containing protein  31.29 
 
 
384 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0035  signal-transduction protein  28.48 
 
 
138 aa  58.9  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000525301  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  28.39 
 
 
391 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3827  CBS domain-containing protein  29.68 
 
 
391 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4541  CBS domain-containing protein  29.68 
 
 
391 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.0139408 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5763  CBS domain-containing protein  30.41 
 
 
391 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  28.29 
 
 
295 aa  58.2  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  29.17 
 
 
228 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  26.21 
 
 
231 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  28.08 
 
 
404 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  27.45 
 
 
769 aa  57.8  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  30.46 
 
 
410 aa  57.8  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1789  CBS domain-containing protein  29.25 
 
 
385 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228479  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  27.63 
 
 
241 aa  57  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0640  CBS domain-containing protein  28.1 
 
 
150 aa  57  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  22.08 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1949  CBS domain-containing protein  30.61 
 
 
384 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429977  normal  0.0328188 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  28.47 
 
 
242 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  26.35 
 
 
373 aa  57  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  25.5 
 
 
223 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  45.45 
 
 
225 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  29.05 
 
 
386 aa  56.2  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1725  signal-transduction protein  27.45 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.467768 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  25.66 
 
 
392 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  28.67 
 
 
246 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2651  putative signal transduction protein with CBS domains  27.27 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  25 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  29.25 
 
 
216 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>