More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1119 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  100 
 
 
295 aa  588  1e-167  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  40.96 
 
 
300 aa  239  4e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.548765 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  39.25 
 
 
300 aa  231  1e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0942  signal transduction protein  37.76 
 
 
307 aa  219  6e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0565  signal transduction protein  36.15 
 
 
286 aa  176  6e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  hitchhiker  0.00109381 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1555  signal transduction protein  35.59 
 
 
286 aa  171  2e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1742  signal transduction protein  33.8 
 
 
286 aa  159  5e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.12379 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1735  signal transduction protein  32.19 
 
 
286 aa  159  6e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.281156  decreased coverage  0.000421461 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1067  signal transduction protein  34.12 
 
 
303 aa  149  4e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0640  hypothetical protein  32.17 
 
 
292 aa  144  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1625  signal transduction protein  33.33 
 
 
303 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0754  signal transduction protein  31.56 
 
 
302 aa  143  4e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.284841  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0054  putative signal transduction protein with CBS domains  31.8 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0897  signal transduction protein  32.88 
 
 
303 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1886  hypothetical protein  30.61 
 
 
291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2165  hypothetical protein  30.95 
 
 
291 aa  138  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.758559  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1049  signal transduction protein  31.51 
 
 
303 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1922  signal transduction protein  31.23 
 
 
293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2102  signal transduction protein  30.63 
 
 
292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2936  signal transduction protein  31.4 
 
 
292 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000290592  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1153  signal transduction protein  27.27 
 
 
288 aa  110  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0936  Protein of unknown function DUF293  33.12 
 
 
177 aa  94  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0850424  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0304  Protein of unknown function DUF293  32.34 
 
 
177 aa  90.9  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.480647  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2269  Protein of unknown function DUF293  32.93 
 
 
177 aa  91.3  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2734  Protein of unknown function DUF293  29.94 
 
 
177 aa  87.8  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.645133 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4532  transcriptional regulator, TrmB  32.39 
 
 
177 aa  84.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3672  Protein of unknown function DUF293  28.3 
 
 
173 aa  84.7  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.829255  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1169  Protein of unknown function DUF293  28.48 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.896672  normal  0.435827 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2771  transcriptional regulator, TrmB  29.94 
 
 
177 aa  82.8  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.129306  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2105  Protein of unknown function DUF293  27.38 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0300972  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  38.71 
 
 
867 aa  72.4  0.000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  32.5 
 
 
164 aa  70.9  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  38.66 
 
 
413 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  27.11 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  36.21 
 
 
904 aa  70.1  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0258  signal transduction protein  39.5 
 
 
412 aa  69.3  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.100598  normal  0.0168412 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  28.68 
 
 
309 aa  68.9  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  30.65 
 
 
250 aa  68.6  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1407  signal transduction protein  33.59 
 
 
322 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1171  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.17 
 
 
916 aa  67  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  37.82 
 
 
413 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  33.62 
 
 
909 aa  66.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  30.53 
 
 
431 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  35.16 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  32.03 
 
 
366 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  37.12 
 
 
865 aa  66.2  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  34.45 
 
 
500 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0774  CBS  30.92 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  37.21 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0822  diguanylate cyclase  34.68 
 
 
287 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  31.13 
 
 
152 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2847  polynucleotide adenylyltransferase region  30.28 
 
 
874 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  31.91 
 
 
873 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  29.93 
 
 
154 aa  64.7  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  33.62 
 
 
909 aa  63.5  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.43 
 
 
321 aa  63.2  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1395  CBS domain-containing protein  29.32 
 
 
137 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1475  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.43 
 
 
321 aa  63.2  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  34.21 
 
 
907 aa  62.8  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  30.14 
 
 
155 aa  62.8  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0503  signal transduction protein  31.58 
 
 
137 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1762  CBS domain-containing protein  29.41 
 
 
258 aa  62  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0911451  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_8994  predicted protein  30.83 
 
 
133 aa  62  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1405  signal transduction protein  31.58 
 
 
137 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  35.94 
 
 
225 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1231  CBS domain-containing protein  30.83 
 
 
137 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.022182  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  32.89 
 
 
243 aa  61.2  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  30.25 
 
 
503 aa  60.8  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  32.48 
 
 
155 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.46 
 
 
903 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.9 
 
 
903 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.9 
 
 
903 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  28.02 
 
 
488 aa  60.1  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  32.77 
 
 
282 aa  60.1  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  25.52 
 
 
892 aa  60.1  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  26.71 
 
 
152 aa  59.7  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  24.68 
 
 
161 aa  59.7  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1386  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 
211 aa  59.7  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  23.4 
 
 
427 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  30.13 
 
 
907 aa  59.7  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2063  protein of unknown function UPF0074  24.65 
 
 
194 aa  59.3  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  32.79 
 
 
769 aa  59.3  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2578  putative signal transduction protein with CBS domains  30.08 
 
 
124 aa  59.3  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345851  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0767  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.56 
 
 
675 aa  59.3  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000798179  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2466  polynucleotide adenylyltransferase region  30.16 
 
 
872 aa  58.9  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.779181  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  35.63 
 
 
399 aa  58.9  0.00000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.48 
 
 
873 aa  58.9  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2693  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.06 
 
 
873 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  34.75 
 
 
151 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  34.45 
 
 
380 aa  58.9  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  36.36 
 
 
411 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  27.45 
 
 
379 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2428  homoserine O-acetyltransferase  26.67 
 
 
579 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71707  normal  0.191879 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1879  CBS  28.29 
 
 
157 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01920  Inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  29.6 
 
 
154 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.778717  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  29.25 
 
 
149 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  28.19 
 
 
152 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  30.61 
 
 
154 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  31.01 
 
 
143 aa  57  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  29.25 
 
 
153 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>