31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0936 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0936  Protein of unknown function DUF293  100 
 
 		 177 aa  359  1e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0850424  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0304  Protein of unknown function DUF293  76.84 
 
 		 177 aa  274  5e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.480647  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4532  transcriptional regulator, TrmB  72.32 
 
 		 177 aa  269  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2269  Protein of unknown function DUF293  75.71 
 
 		 177 aa  269  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2734  Protein of unknown function DUF293  74.58 
 
 		 177 aa  264  4e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.645133 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2771  transcriptional regulator, TrmB  72.32 
 
 		 177 aa  258  2e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.129306  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3672  Protein of unknown function DUF293  56.98 
 
 		 173 aa  204  6e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.829255  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1886  hypothetical protein  52 
 
 		 291 aa  187  8e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1922  signal transduction protein  47.43 
 
 		 293 aa  177  5.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1153  signal transduction protein  52.73 
 
 		 288 aa  176  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2165  hypothetical protein  48.57 
 
 		 291 aa  171  5.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.758559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0054  putative signal transduction protein with CBS domains  51.52 
 
 		 292 aa  169  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2102  signal transduction protein  46.55 
 
 		 292 aa  165  4e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2936  signal transduction protein  47.09 
 
 		 292 aa  158  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000290592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0640  hypothetical protein  45.51 
 
 		 292 aa  157  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1067  signal transduction protein  48.75 
 
 		 303 aa  155  4e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0897  signal transduction protein  50 
 
 		 303 aa  154  8e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1049  signal transduction protein  49.38 
 
 		 303 aa  152  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1625  signal transduction protein  49.38 
 
 		 303 aa  151  4e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0754  signal transduction protein  44.25 
 
 		 302 aa  151  5e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.284841  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2063  protein of unknown function UPF0074  39.53 
 
 		 194 aa  129  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2105  Protein of unknown function DUF293  40.59 
 
 		 178 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0300972  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1169  Protein of unknown function DUF293  38.1 
 
 		 176 aa  120  8e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.896672  normal  0.435827 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  38.1 
 
 		 300 aa  114  7.999999999999999e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.548765 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  34.1 
 
 		 300 aa  110  7.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  33.12 
 
 		 295 aa  94  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0942  signal transduction protein  33.95 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1735  signal transduction protein  32.62 
 
 		 286 aa  58.2  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.281156  decreased coverage  0.000421461 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1555  signal transduction protein  33.33 
 
 		 286 aa  57.8  0.00000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0565  signal transduction protein  31.21 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  hitchhiker  0.00109381 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1742  signal transduction protein  31.72 
 
 		 286 aa  54.3  0.0000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.12379 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>