More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1886 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1886  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  588  1e-167  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2165  hypothetical protein  65.17 
 
 
291 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.758559  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1153  signal transduction protein  46.18 
 
 
288 aa  277  1e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1922  signal transduction protein  47.39 
 
 
293 aa  275  4e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0640  hypothetical protein  45.99 
 
 
292 aa  275  8e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2102  signal transduction protein  46.85 
 
 
292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0054  putative signal transduction protein with CBS domains  46.85 
 
 
292 aa  268  8.999999999999999e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2936  signal transduction protein  43.94 
 
 
292 aa  259  3e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000290592  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0754  signal transduction protein  42.27 
 
 
302 aa  225  6e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.284841  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1049  signal transduction protein  41.87 
 
 
303 aa  224  1e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0897  signal transduction protein  42.21 
 
 
303 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1625  signal transduction protein  41.32 
 
 
303 aa  222  6e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1067  signal transduction protein  40.42 
 
 
303 aa  217  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2771  transcriptional regulator, TrmB  52.57 
 
 
177 aa  194  2e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.129306  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2734  Protein of unknown function DUF293  53.94 
 
 
177 aa  192  6e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.645133 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0936  Protein of unknown function DUF293  52 
 
 
177 aa  187  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0850424  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2269  Protein of unknown function DUF293  49.71 
 
 
177 aa  181  9.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0304  Protein of unknown function DUF293  48.57 
 
 
177 aa  178  8e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.480647  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  34.69 
 
 
300 aa  177  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4532  transcriptional regulator, TrmB  49.14 
 
 
177 aa  176  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  33.33 
 
 
300 aa  174  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3672  Protein of unknown function DUF293  44.24 
 
 
173 aa  145  6e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.829255  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  30.61 
 
 
295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0942  signal transduction protein  29.33 
 
 
307 aa  125  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1169  Protein of unknown function DUF293  36.36 
 
 
176 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.896672  normal  0.435827 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0565  signal transduction protein  31.9 
 
 
286 aa  113  3e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  hitchhiker  0.00109381 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1735  signal transduction protein  29.86 
 
 
286 aa  109  5e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.281156  decreased coverage  0.000421461 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2105  Protein of unknown function DUF293  37.58 
 
 
178 aa  102  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0300972  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1742  signal transduction protein  29.71 
 
 
286 aa  99  8e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.12379 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2063  protein of unknown function UPF0074  33.74 
 
 
194 aa  94  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1555  signal transduction protein  28.32 
 
 
286 aa  93.6  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  32.81 
 
 
366 aa  72.8  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  32.8 
 
 
370 aa  68.2  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.85 
 
 
877 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.5 
 
 
482 aa  68.2  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  32.82 
 
 
873 aa  67  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  35.25 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  31.03 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  26.62 
 
 
282 aa  65.1  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  29.13 
 
 
378 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  30.23 
 
 
219 aa  62.8  0.000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  32.41 
 
 
907 aa  62.8  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  31.2 
 
 
209 aa  62.4  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  33.04 
 
 
147 aa  62.4  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.1 
 
 
873 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  32.56 
 
 
230 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  30.43 
 
 
148 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  28.87 
 
 
867 aa  61.6  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  32.48 
 
 
250 aa  61.6  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  35.24 
 
 
138 aa  61.6  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  27.97 
 
 
155 aa  60.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  36.56 
 
 
364 aa  60.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  28.36 
 
 
229 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1405  signal transduction protein  39 
 
 
137 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  30 
 
 
909 aa  60.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1231  CBS domain-containing protein  38 
 
 
137 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.022182  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1407  signal transduction protein  35.21 
 
 
322 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0503  signal transduction protein  38 
 
 
137 aa  59.7  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  31.9 
 
 
141 aa  59.7  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  29.63 
 
 
412 aa  59.7  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  33.9 
 
 
128 aa  59.3  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1475  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.25 
 
 
321 aa  58.5  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  27.01 
 
 
229 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  32.12 
 
 
877 aa  58.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.25 
 
 
321 aa  58.5  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  36.61 
 
 
269 aa  58.9  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0635  CBS domain-containing protein  28.16 
 
 
432 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00186716  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  32.06 
 
 
223 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  28.33 
 
 
769 aa  58.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  28 
 
 
313 aa  57.4  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1913  putative sigma54 specific transcriptional regulator  34.88 
 
 
710 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0899132  normal  0.0546689 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  28 
 
 
384 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  30.71 
 
 
503 aa  57.4  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  32.31 
 
 
215 aa  57.4  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  31.2 
 
 
208 aa  57.4  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  31.53 
 
 
395 aa  56.6  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2340  signal transduction protein  27.78 
 
 
163 aa  57  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  30.51 
 
 
885 aa  56.6  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25 
 
 
605 aa  56.6  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  33.63 
 
 
153 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1395  CBS domain-containing protein  36 
 
 
137 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0258  signal transduction protein  34.86 
 
 
412 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.100598  normal  0.0168412 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  30.4 
 
 
845 aa  55.8  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  33.33 
 
 
281 aa  55.8  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  34.23 
 
 
393 aa  55.8  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  37.08 
 
 
399 aa  55.8  0.0000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  29.46 
 
 
145 aa  55.8  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  27.88 
 
 
377 aa  55.8  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  34.21 
 
 
145 aa  55.5  0.0000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  37.21 
 
 
875 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  31.54 
 
 
215 aa  55.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  31.13 
 
 
166 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1108  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.9 
 
 
485 aa  55.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.927877  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00722  Signaling protein with a cAMP-binding, CBS domains and predicted nucleotidyltransferase domain  32.46 
 
 
613 aa  55.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  32.54 
 
 
225 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  28.24 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  32.48 
 
 
145 aa  55.1  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  33.33 
 
 
413 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  35.37 
 
 
879 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0451  hypothetical protein  35.37 
 
 
502 aa  54.3  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>