More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0451 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1290  protein of unknown function DUF39  60.76 
 
 
502 aa  637    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0616948  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1272  hypothetical protein  63.33 
 
 
502 aa  664    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573905  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  62.15 
 
 
502 aa  654    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0451  hypothetical protein  100 
 
 
502 aa  1036    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0138  hypothetical protein  58.37 
 
 
503 aa  614  9.999999999999999e-175  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  55.8 
 
 
500 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2085  hypothetical protein  55.13 
 
 
500 aa  570  1e-161  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41176  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  54.93 
 
 
503 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  49.12 
 
 
513 aa  497  1e-139  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  48.54 
 
 
513 aa  497  1e-139  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  48.34 
 
 
513 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0669  hypothetical protein  46.59 
 
 
513 aa  479  1e-134  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0793  hypothetical protein  48.05 
 
 
511 aa  480  1e-134  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.455242  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0101  hypothetical protein  51.6 
 
 
399 aa  365  1e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.235575  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1441  hypothetical protein  49.08 
 
 
412 aa  355  1e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0732  protein of unknown function DUF39  47.88 
 
 
407 aa  351  2e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.855526  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3584  protein of unknown function DUF39  47.06 
 
 
423 aa  350  4e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00707173  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0430  hypothetical protein  49.22 
 
 
390 aa  348  1e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.943897  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1059  hypothetical protein  48.92 
 
 
403 aa  347  2e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1281  hypothetical protein  45.91 
 
 
455 aa  340  4e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1464  protein of unknown function DUF39  47.92 
 
 
390 aa  340  4e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.552169 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1432  protein of unknown function DUF39  46.98 
 
 
406 aa  334  2e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00503858  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0733  hypothetical protein  49.71 
 
 
434 aa  333  6e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0805  hypothetical protein  45.98 
 
 
408 aa  332  1e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3007  hypothetical protein  47.27 
 
 
421 aa  330  3e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0812  protein of unknown function DUF39  44.19 
 
 
438 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3098  protein of unknown function DUF39  45.31 
 
 
390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0613038  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0921  hypothetical protein  45.23 
 
 
408 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0664  hypothetical protein  45.14 
 
 
389 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120949  normal  0.0723029 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5211  protein of unknown function DUF39  42.17 
 
 
403 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000734482 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0911  hypothetical protein  45.96 
 
 
405 aa  322  9.999999999999999e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00849288  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_792  hypothetical protein  43.72 
 
 
408 aa  319  9e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2393  hypothetical protein  43.58 
 
 
384 aa  316  8e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2809  hypothetical protein  43.57 
 
 
389 aa  312  1e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0777077  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2469  protein of unknown function DUF39  43.12 
 
 
388 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000655672  hitchhiker  0.000229248 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2541  protein of unknown function DUF39  41.94 
 
 
404 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3565  protein of unknown function DUF39  41.94 
 
 
404 aa  306  8.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0178473  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0414  hypothetical protein  42.51 
 
 
390 aa  305  2.0000000000000002e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1625  hypothetical protein  33.44 
 
 
418 aa  150  6e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0110  hypothetical protein  30.84 
 
 
413 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31254  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2735  methanogenesis marker 16 metalloprotein  30.15 
 
 
414 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0502  pseudouridylate synthase subunit TruB  29.59 
 
 
408 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2978  hypothetical protein  28.4 
 
 
405 aa  119  9e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1460  hypothetical protein  28.95 
 
 
427 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.194077  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3546  hypothetical protein  28.26 
 
 
438 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0943235  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1161  homoserine O-acetyltransferase  41.18 
 
 
496 aa  101  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.985258  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1805  hypothetical protein  29.28 
 
 
388 aa  98.6  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0748579  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0914  hypothetical protein  26.25 
 
 
388 aa  98.6  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1368  hypothetical protein  29.09 
 
 
410 aa  94  6e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0545  homoserine O-acetyltransferase  43.86 
 
 
487 aa  93.2  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.193935 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0850  hypothetical protein  27 
 
 
388 aa  90.5  6e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.711109  normal  0.0659427 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1067  methanogenesis marker 16 metalloprotein  25.53 
 
 
388 aa  89  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0245608  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2043  homoserine O-acetyltransferase  37.82 
 
 
491 aa  88.6  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  35 
 
 
492 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  36.15 
 
 
488 aa  84.3  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1207  homoserine O-acetyltransferase  35.29 
 
 
490 aa  81.3  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0144114  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  31.36 
 
 
490 aa  76.3  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2428  homoserine O-acetyltransferase  29.92 
 
 
579 aa  73.9  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71707  normal  0.191879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  32.82 
 
 
223 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  34.21 
 
 
769 aa  66.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
867 aa  66.2  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  29.82 
 
 
141 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1049  signal transduction protein  25.89 
 
 
303 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2674  signal transduction protein  28.68 
 
 
166 aa  65.5  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.184526  hitchhiker  0.0000000000000277355 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  31.5 
 
 
225 aa  65.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  31.4 
 
 
300 aa  65.9  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  28.57 
 
 
313 aa  63.5  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0897  signal transduction protein  25.89 
 
 
303 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1625  signal transduction protein  25.89 
 
 
303 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  32.54 
 
 
223 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  28.87 
 
 
256 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0503  signal transduction protein  32.23 
 
 
137 aa  60.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0754  signal transduction protein  30.19 
 
 
302 aa  60.5  0.00000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.284841  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2788  sugar phosphate isomerase  36.59 
 
 
330 aa  60.1  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000495576  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1899  putative signal transduction protein with CBS domains  29.92 
 
 
149 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1899  IMP dehydrogenase/GMP reductase  30.63 
 
 
517 aa  58.9  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1594  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.23 
 
 
489 aa  59.3  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.221976 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0635  CBS domain-containing protein  30.7 
 
 
432 aa  58.9  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00186716  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1405  signal transduction protein  31.4 
 
 
137 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  27.83 
 
 
202 aa  58.9  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0942  signal transduction protein  32.65 
 
 
307 aa  58.9  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  32.17 
 
 
131 aa  58.5  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  31.62 
 
 
413 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1569  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.53 
 
 
476 aa  58.5  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  31.39 
 
 
216 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1407  signal transduction protein  34.43 
 
 
322 aa  58.5  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0178  CBS domain-containing protein  26.83 
 
 
145 aa  58.5  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  30.16 
 
 
215 aa  57.8  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  31.25 
 
 
145 aa  57.4  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  30.77 
 
 
413 aa  57.8  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  29.37 
 
 
215 aa  57.8  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3609  KpsF/GutQ family protein  38.75 
 
 
331 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  30.47 
 
 
225 aa  57.8  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  30.95 
 
 
210 aa  57.4  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  24.14 
 
 
372 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  26.36 
 
 
217 aa  57.4  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  28.47 
 
 
333 aa  57.4  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1203  signal transduction protein  32.5 
 
 
315 aa  57  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.803351  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  30.91 
 
 
133 aa  57  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1386  CBS domain-containing protein  23.44 
 
 
211 aa  57  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>