More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2936 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2936  signal transduction protein  100 
 
 
292 aa  590  1e-167  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000290592  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2102  signal transduction protein  65.64 
 
 
292 aa  389  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0054  putative signal transduction protein with CBS domains  62.8 
 
 
292 aa  370  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1922  signal transduction protein  62.33 
 
 
293 aa  361  8e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0640  hypothetical protein  59.11 
 
 
292 aa  340  1e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2165  hypothetical protein  44.98 
 
 
291 aa  265  5.999999999999999e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.758559  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1886  hypothetical protein  43.94 
 
 
291 aa  259  3e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1153  signal transduction protein  40.34 
 
 
288 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0754  signal transduction protein  39.32 
 
 
302 aa  207  1e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.284841  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1625  signal transduction protein  37.5 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0897  signal transduction protein  37.5 
 
 
303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1049  signal transduction protein  36.11 
 
 
303 aa  196  3e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1067  signal transduction protein  35.52 
 
 
303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0936  Protein of unknown function DUF293  47.09 
 
 
177 aa  158  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0850424  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2771  transcriptional regulator, TrmB  43.6 
 
 
177 aa  156  4e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.129306  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2734  Protein of unknown function DUF293  43.02 
 
 
177 aa  156  4e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.645133 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  32.41 
 
 
300 aa  155  8e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2269  Protein of unknown function DUF293  44.19 
 
 
177 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  32.07 
 
 
300 aa  152  4e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4532  transcriptional regulator, TrmB  43.11 
 
 
177 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0304  Protein of unknown function DUF293  41.28 
 
 
177 aa  147  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.480647  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0942  signal transduction protein  31.74 
 
 
307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3672  Protein of unknown function DUF293  36.97 
 
 
173 aa  121  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.829255  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  31.4 
 
 
295 aa  121  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2105  Protein of unknown function DUF293  36.91 
 
 
178 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0300972  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1169  Protein of unknown function DUF293  33.33 
 
 
176 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.896672  normal  0.435827 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0565  signal transduction protein  31.16 
 
 
286 aa  103  3e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  hitchhiker  0.00109381 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1735  signal transduction protein  29.83 
 
 
286 aa  99.8  4e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.281156  decreased coverage  0.000421461 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1742  signal transduction protein  29.64 
 
 
286 aa  96.7  4e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.12379 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2063  protein of unknown function UPF0074  32.52 
 
 
194 aa  95.1  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1555  signal transduction protein  28.42 
 
 
286 aa  89.7  5e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  35.2 
 
 
364 aa  68.9  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  32.45 
 
 
161 aa  65.1  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0822  diguanylate cyclase  35.09 
 
 
287 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  33.87 
 
 
1560 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1725  signal-transduction protein  34.35 
 
 
155 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.467768 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  35.54 
 
 
216 aa  63.2  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  31.86 
 
 
863 aa  63.2  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  34.95 
 
 
144 aa  61.6  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  31.3 
 
 
867 aa  61.6  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  34.78 
 
 
873 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0035  signal-transduction protein  34.4 
 
 
138 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000525301  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  33.6 
 
 
214 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  33.91 
 
 
142 aa  60.1  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  36.43 
 
 
162 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2618  CBS  31.15 
 
 
275 aa  59.7  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  35.82 
 
 
154 aa  59.3  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2905  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 
252 aa  59.3  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2009  CBS domain-containing protein  30.3 
 
 
143 aa  59.3  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.416479  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  31.62 
 
 
145 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  29.77 
 
 
907 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  32.76 
 
 
863 aa  58.5  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  32.06 
 
 
225 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  31.86 
 
 
897 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  32.5 
 
 
577 aa  57.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  32.82 
 
 
225 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.55 
 
 
605 aa  57.4  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  32.64 
 
 
877 aa  58.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  28.68 
 
 
279 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  31.9 
 
 
377 aa  57.4  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  29.66 
 
 
223 aa  57.4  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  33.06 
 
 
208 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  27.05 
 
 
148 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  31.45 
 
 
232 aa  57  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  28.95 
 
 
141 aa  57  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  30.7 
 
 
845 aa  56.2  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  28.68 
 
 
279 aa  55.8  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  31.82 
 
 
873 aa  56.2  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  29.75 
 
 
877 aa  56.2  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  25.95 
 
 
331 aa  55.8  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  31.3 
 
 
282 aa  55.8  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  28.7 
 
 
147 aa  55.8  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  32.74 
 
 
879 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  32.74 
 
 
879 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  28.68 
 
 
279 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  32.23 
 
 
378 aa  55.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  31.54 
 
 
279 aa  55.1  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  30.5 
 
 
769 aa  55.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0401  signal-transduction protein  27.78 
 
 
302 aa  55.5  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  27.91 
 
 
219 aa  54.7  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  31.9 
 
 
863 aa  54.7  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1588  CBS  33.91 
 
 
859 aa  54.7  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.497223  normal  0.185787 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  34.56 
 
 
162 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  31.71 
 
 
370 aa  54.7  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0601  signal transduction protein  26.05 
 
 
283 aa  54.3  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.35039  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  29.84 
 
 
215 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  29.17 
 
 
862 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1395  putative signal transduction protein with CBS domains  30.47 
 
 
138 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  27.64 
 
 
370 aa  53.9  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  28 
 
 
153 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2169  putative signal transduction protein with CBS domains  29.51 
 
 
261 aa  53.5  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  29.51 
 
 
863 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2001  putative signal transduction protein with CBS domains  31.58 
 
 
157 aa  53.5  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0953206  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12645  hypothetical protein  30 
 
 
143 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  26 
 
 
153 aa  53.1  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0069  signal transduction protein  27.56 
 
 
158 aa  53.1  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2521  signal transduction protein  32.03 
 
 
143 aa  53.1  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1913  putative sigma54 specific transcriptional regulator  30.51 
 
 
710 aa  53.1  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0899132  normal  0.0546689 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1899  putative signal transduction protein with CBS domains  30.4 
 
 
149 aa  52.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  27.97 
 
 
384 aa  52.8  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.29511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>