33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1169 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1169  Protein of unknown function DUF293  100 
 
 
176 aa  347  6e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.896672  normal  0.435827 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2105  Protein of unknown function DUF293  49.43 
 
 
178 aa  186  1e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0300972  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2734  Protein of unknown function DUF293  40.35 
 
 
177 aa  140  8e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.645133 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0304  Protein of unknown function DUF293  40.94 
 
 
177 aa  136  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.480647  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2269  Protein of unknown function DUF293  39.18 
 
 
177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2063  protein of unknown function UPF0074  37.5 
 
 
194 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4532  transcriptional regulator, TrmB  39.18 
 
 
177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2771  transcriptional regulator, TrmB  38.69 
 
 
177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.129306  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0936  Protein of unknown function DUF293  38.1 
 
 
177 aa  120  8e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0850424  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1886  hypothetical protein  36.36 
 
 
291 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1922  signal transduction protein  34.55 
 
 
293 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1153  signal transduction protein  33.33 
 
 
288 aa  105  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0640  hypothetical protein  33.33 
 
 
292 aa  105  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2936  signal transduction protein  33.33 
 
 
292 aa  105  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000290592  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2165  hypothetical protein  32.12 
 
 
291 aa  104  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.758559  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0054  putative signal transduction protein with CBS domains  32.73 
 
 
292 aa  104  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  32.53 
 
 
300 aa  103  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3672  Protein of unknown function DUF293  33.53 
 
 
173 aa  103  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.829255  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2102  signal transduction protein  34.55 
 
 
292 aa  102  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  31.52 
 
 
300 aa  90.9  8e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  28.48 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0754  signal transduction protein  30 
 
 
302 aa  79.3  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.284841  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0942  signal transduction protein  29.41 
 
 
307 aa  78.6  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1067  signal transduction protein  27.33 
 
 
303 aa  75.1  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1049  signal transduction protein  28 
 
 
303 aa  73.9  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1625  signal transduction protein  27.33 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0897  signal transduction protein  27.33 
 
 
303 aa  71.6  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1735  signal transduction protein  36.23 
 
 
286 aa  52.8  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.281156  decreased coverage  0.000421461 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1742  signal transduction protein  37.33 
 
 
286 aa  52.4  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.12379 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1555  signal transduction protein  36 
 
 
286 aa  50.8  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0565  signal transduction protein  33.77 
 
 
286 aa  50.8  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  hitchhiker  0.00109381 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0674  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.65 
 
 
157 aa  42.4  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000350812  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2051  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.28 
 
 
138 aa  41.6  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.482177 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>