35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2105 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2105  Protein of unknown function DUF293  100 
 
 		 178 aa  360  7.0000000000000005e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0300972  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1169  Protein of unknown function DUF293  49.43 
 
 		 176 aa  186  1e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.896672  normal  0.435827 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2734  Protein of unknown function DUF293  41.76 
 
 		 177 aa  135  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.645133 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0304  Protein of unknown function DUF293  43.53 
 
 		 177 aa  133  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.480647  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2771  transcriptional regulator, TrmB  43.86 
 
 		 177 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.129306  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2269  Protein of unknown function DUF293  42.35 
 
 		 177 aa  132  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2063  protein of unknown function UPF0074  40.59 
 
 		 194 aa  131  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0936  Protein of unknown function DUF293  40.59 
 
 		 177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0850424  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4532  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 		 177 aa  123  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0640  hypothetical protein  38.93 
 
 		 292 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3672  Protein of unknown function DUF293  37.35 
 
 		 173 aa  117  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.829255  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0054  putative signal transduction protein with CBS domains  42.67 
 
 		 292 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2936  signal transduction protein  36.91 
 
 		 292 aa  110  9e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000290592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1922  signal transduction protein  40.27 
 
 		 293 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1886  hypothetical protein  37.58 
 
 		 291 aa  102  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2165  hypothetical protein  33.94 
 
 		 291 aa  97.4  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.758559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1153  signal transduction protein  33.33 
 
 		 288 aa  97.4  9e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2102  signal transduction protein  34.9 
 
 		 292 aa  97.4  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  29.88 
 
 		 300 aa  92.4  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0754  signal transduction protein  31.76 
 
 		 302 aa  90.1  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.284841  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1067  signal transduction protein  31.13 
 
 		 303 aa  85.5  4e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  31.71 
 
 		 300 aa  84.7  6e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1049  signal transduction protein  29.61 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1625  signal transduction protein  30.2 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0897  signal transduction protein  30.2 
 
 		 303 aa  81.3  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  27.38 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0942  signal transduction protein  30.63 
 
 		 307 aa  68.6  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1735  signal transduction protein  43.24 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.281156  decreased coverage  0.000421461 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0565  signal transduction protein  45.59 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  hitchhiker  0.00109381 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1555  signal transduction protein  44 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1742  signal transduction protein  41.89 
 
 		 286 aa  54.3  0.0000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.12379 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0089  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.99 
 
 		 337 aa  44.7  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000627651  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.88 
 
 		 238 aa  42  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1584  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.58 
 
 		 355 aa  42  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0405407  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.33 
 
 		 350 aa  41.6  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>