More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1735 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1735  signal transduction protein  100 
 
 		 286 aa  568  1e-161  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.281156  decreased coverage  0.000421461 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1555  signal transduction protein  74.83 
 
 		 286 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0565  signal transduction protein  73.43 
 
 		 286 aa  449  1e-125  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  hitchhiker  0.00109381 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1742  signal transduction protein  71.33 
 
 		 286 aa  435  1e-121  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.12379 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  36.58 
 
 		 300 aa  169  6e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  36.54 
 
 		 300 aa  163  3e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  32.19 
 
 		 295 aa  159  6e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0942  signal transduction protein  34.14 
 
 		 307 aa  145  6e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1067  signal transduction protein  29.12 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1625  signal transduction protein  30.6 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1049  signal transduction protein  29.18 
 
 		 303 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0897  signal transduction protein  29.89 
 
 		 303 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2165  hypothetical protein  28.17 
 
 		 291 aa  112  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.758559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1886  hypothetical protein  29.86 
 
 		 291 aa  109  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0754  signal transduction protein  26.15 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.284841  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2936  signal transduction protein  29.83 
 
 		 292 aa  99.8  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000290592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0640  hypothetical protein  27.62 
 
 		 292 aa  99.4  6e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0054  putative signal transduction protein with CBS domains  29.01 
 
 		 292 aa  95.5  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2102  signal transduction protein  29.17 
 
 		 292 aa  92  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1922  signal transduction protein  30.14 
 
 		 293 aa  89.7  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1153  signal transduction protein  25.09 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  35.29 
 
 		 903 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1407  signal transduction protein  33.58 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1487  sigma-L-dependent transcriptional regulator  36.61 
 
 		 696 aa  70.5  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2734  Protein of unknown function DUF293  34.75 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.645133 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  31.62 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  30.37 
 
 		 426 aa  69.7  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1913  putative sigma54 specific transcriptional regulator  39.13 
 
 		 710 aa  68.9  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0899132  normal  0.0546689 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  29.05 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  33.57 
 
 		 909 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  27.7 
 
 		 152 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1475  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.17 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.17 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  30.99 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  31.93 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2771  transcriptional regulator, TrmB  36.17 
 
 		 177 aa  67  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.129306  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  38.52 
 
 		 386 aa  67  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0838  signal transduction protein  35.43 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.545659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  28.77 
 
 		 153 aa  67  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1763  putative PAS/PAC sensor protein  35.54 
 
 		 698 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  26.8 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  35.71 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  34.53 
 
 		 909 aa  65.9  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  33.07 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  30.56 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  32.33 
 
 		 216 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  29.53 
 
 		 153 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0942  CBS domain containing membrane protein  33.04 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0304  Protein of unknown function DUF293  33.57 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.480647  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1203  signal transduction protein  30.41 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.803351  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  34.96 
 
 		 907 aa  63.5  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  34.65 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  32.33 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  32.28 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  30 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  30.46 
 
 		 907 aa  62.8  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2105  Protein of unknown function DUF293  43.24 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0300972  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  31.01 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.09 
 
 		 903 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  28.57 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  26.85 
 
 		 154 aa  60.8  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.09 
 
 		 903 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  30.26 
 
 		 153 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  28.87 
 
 		 153 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  31.34 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1405  signal transduction protein  31.25 
 
 		 137 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  27.34 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  32.64 
 
 		 154 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0503  signal transduction protein  31.25 
 
 		 137 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0477  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.96 
 
 		 494 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0432  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.6 
 
 		 494 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1899  putative signal transduction protein with CBS domains  31.67 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0735  putative signal transduction protein with CBS domains  27.27 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.14806  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  30.77 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1688  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  33.61 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.315313  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2269  Protein of unknown function DUF293  34.29 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4214  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.64 
 
 		 488 aa  59.7  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  26.95 
 
 		 427 aa  59.7  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  29.82 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  28.57 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1395  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  32.8 
 
 		 904 aa  58.9  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4505  thioesterase family protein  30.4 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4341  CBS domain-containing cytosolic protein  30.4 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4353  CBS domain-containing cytosolic protein  30.4 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0965  hypothetical protein  26.14 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  34.78 
 
 		 141 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4858  thioesterase family protein  30.4 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1231  CBS domain-containing protein  30.47 
 
 		 137 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.022182  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4727  thioesterase family protein  30.4 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  37.7 
 
 		 769 aa  58.5  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  33.07 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  30.71 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  30.28 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  34.19 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0936  Protein of unknown function DUF293  32.62 
 
 		 177 aa  58.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0850424  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4739  thioesterase family protein  29.6 
 
 		 437 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  29.75 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>