44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2063 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2063  protein of unknown function UPF0074  100 
 
 		 194 aa  391  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1169  Protein of unknown function DUF293  37.5 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.896672  normal  0.435827 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2105  Protein of unknown function DUF293  40.59 
 
 		 178 aa  131  5e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0300972  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0936  Protein of unknown function DUF293  39.53 
 
 		 177 aa  129  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0850424  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4532  transcriptional regulator, TrmB  37.43 
 
 		 177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3672  Protein of unknown function DUF293  35.47 
 
 		 173 aa  121  8e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.829255  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2269  Protein of unknown function DUF293  36.26 
 
 		 177 aa  120  9e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2734  Protein of unknown function DUF293  38.6 
 
 		 177 aa  119  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.645133 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2771  transcriptional regulator, TrmB  38.64 
 
 		 177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.129306  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0304  Protein of unknown function DUF293  34.5 
 
 		 177 aa  115  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.480647  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0640  hypothetical protein  31.9 
 
 		 292 aa  98.2  7e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2936  signal transduction protein  32.52 
 
 		 292 aa  95.1  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000290592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1886  hypothetical protein  33.74 
 
 		 291 aa  94  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1922  signal transduction protein  34.36 
 
 		 293 aa  91.7  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0054  putative signal transduction protein with CBS domains  31.29 
 
 		 292 aa  88.2  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2102  signal transduction protein  34.72 
 
 		 292 aa  86.7  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1049  signal transduction protein  30.64 
 
 		 303 aa  84.7  7e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0897  signal transduction protein  29.65 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1625  signal transduction protein  29.07 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0754  signal transduction protein  29.38 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.284841  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1153  signal transduction protein  32.52 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2165  hypothetical protein  30.54 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.758559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1067  signal transduction protein  29.38 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  26.83 
 
 		 300 aa  68.2  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  26.06 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  24.65 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0942  signal transduction protein  29.41 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1555  signal transduction protein  35.29 
 
 		 286 aa  50.1  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0565  signal transduction protein  35.62 
 
 		 286 aa  47.8  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  hitchhiker  0.00109381 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0716  HTH-type transcriptional regulator  30.51 
 
 		 168 aa  45.8  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1742  signal transduction protein  33.75 
 
 		 286 aa  45.4  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.12379 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1236  transcription factor IscR  27.34 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.507944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3512  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1735  signal transduction protein  32.88 
 
 		 286 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.281156  decreased coverage  0.000421461 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1422  rrf2 family protein  27.34 
 
 		 163 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2883  Rrf2 family protein  35.14 
 
 		 162 aa  43.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1343  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 162 aa  42.4  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000134779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0871  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 182 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3582  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.1 
 
 		 146 aa  42  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000128686  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0884  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 182 aa  42  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360129  hitchhiker  0.00284827 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2318  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 153 aa  41.6  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0363364  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0841  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 163 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1487  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 153 aa  41.2  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1326  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.33 
 
 		 159 aa  41.2  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0470001  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>