More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0640 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0640  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  591  1e-168  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0054  putative signal transduction protein with CBS domains  58.42 
 
 		 292 aa  364  1e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2102  signal transduction protein  58.22 
 
 		 292 aa  358  5e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2936  signal transduction protein  59.11 
 
 		 292 aa  340  1e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000290592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1922  signal transduction protein  60.07 
 
 		 293 aa  340  1e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1886  hypothetical protein  45.99 
 
 		 291 aa  275  8e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2165  hypothetical protein  45.3 
 
 		 291 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.758559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1067  signal transduction protein  38.8 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1153  signal transduction protein  38.33 
 
 		 288 aa  203  2e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0754  signal transduction protein  38.31 
 
 		 302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.284841  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0897  signal transduction protein  37.46 
 
 		 303 aa  199  7e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1625  signal transduction protein  37.12 
 
 		 303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1049  signal transduction protein  36.45 
 
 		 303 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  35.15 
 
 		 300 aa  175  6e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  34.47 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0936  Protein of unknown function DUF293  45.51 
 
 		 177 aa  157  3e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0850424  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2734  Protein of unknown function DUF293  42.51 
 
 		 177 aa  151  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.645133 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2771  transcriptional regulator, TrmB  41.92 
 
 		 177 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.129306  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4532  transcriptional regulator, TrmB  41.32 
 
 		 177 aa  146  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2269  Protein of unknown function DUF293  43.71 
 
 		 177 aa  145  7.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  32.17 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0304  Protein of unknown function DUF293  42.42 
 
 		 177 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.480647  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3672  Protein of unknown function DUF293  35.33 
 
 		 173 aa  119  3.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.829255  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2105  Protein of unknown function DUF293  38.93 
 
 		 178 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0300972  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1169  Protein of unknown function DUF293  33.33 
 
 		 176 aa  105  8e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.896672  normal  0.435827 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0942  signal transduction protein  26.51 
 
 		 307 aa  105  8e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0565  signal transduction protein  29.82 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  hitchhiker  0.00109381 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1735  signal transduction protein  27.62 
 
 		 286 aa  99.4  6e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.281156  decreased coverage  0.000421461 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2063  protein of unknown function UPF0074  31.9 
 
 		 194 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1742  signal transduction protein  27.62 
 
 		 286 aa  90.5  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.12379 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1555  signal transduction protein  29.02 
 
 		 286 aa  90.1  4e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  36.75 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  29.31 
 
 		 897 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  31.58 
 
 		 845 aa  65.1  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0635  CBS domain-containing protein  34.11 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00186716  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  32.46 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  31.36 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  31.06 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  28.81 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  34.75 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  28.09 
 
 		 862 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  32.54 
 
 		 863 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  29.66 
 
 		 384 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  28.95 
 
 		 161 aa  61.2  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0822  diguanylate cyclase  31.86 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  29.1 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  29.55 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.23 
 
 		 605 aa  59.3  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  29.84 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  29.32 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  32.46 
 
 		 879 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  32.46 
 
 		 879 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  29.82 
 
 		 863 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1618  CBS domain-containing protein  31.93 
 
 		 138 aa  58.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  29.91 
 
 		 907 aa  57  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.48 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  28.57 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1475  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.48 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  32.54 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.57 
 
 		 877 aa  56.2  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  25.95 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  29.92 
 
 		 370 aa  55.8  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.53 
 
 		 1643 aa  55.8  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1913  putative sigma54 specific transcriptional regulator  28.57 
 
 		 710 aa  55.8  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0899132  normal  0.0546689 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  26.56 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2905  XRE family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0601  signal transduction protein  32.32 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.35039  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1231  CBS domain-containing protein  30.66 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.022182  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  30.83 
 
 		 875 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  27.35 
 
 		 132 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  30.51 
 
 		 202 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  28.26 
 
 		 873 aa  55.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  27.7 
 
 		 153 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1016  diguanylate cyclase  30.43 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  26.24 
 
 		 242 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  32.29 
 
 		 364 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  26.36 
 
 		 279 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  28.28 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  26.89 
 
 		 147 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  27.48 
 
 		 212 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  27.13 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  27.19 
 
 		 377 aa  54.3  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  25.17 
 
 		 152 aa  53.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1405  signal transduction protein  30.23 
 
 		 137 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  27.13 
 
 		 279 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6173  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.84 
 
 		 837 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  26 
 
 		 241 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0164  CBS domain-containing protein  31.34 
 
 		 139 aa  53.1  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00289218  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0521  diguanylate cyclase  28.95 
 
 		 290 aa  53.1  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  24.65 
 
 		 242 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  29.75 
 
 		 216 aa  53.1  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  28.24 
 
 		 212 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  26.5 
 
 		 145 aa  53.1  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  29.84 
 
 		 865 aa  53.1  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  28.12 
 
 		 209 aa  53.1  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0503  signal transduction protein  30.23 
 
 		 137 aa  53.1  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01920  Inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  25.4 
 
 		 154 aa  52.8  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.778717  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  31.62 
 
 		 144 aa  52.8  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0401  signal-transduction protein  27.07 
 
 		 302 aa  52.4  0.000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  27.7 
 
 		 153 aa  52.4  0.000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>