More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1555 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1555  signal transduction protein  100 
 
 
286 aa  564  1e-160  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0565  signal transduction protein  82.17 
 
 
286 aa  482  1e-135  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  hitchhiker  0.00109381 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1735  signal transduction protein  74.83 
 
 
286 aa  458  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.281156  decreased coverage  0.000421461 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1742  signal transduction protein  73.78 
 
 
286 aa  442  1e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.12379 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  37.67 
 
 
300 aa  172  6.999999999999999e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  35.59 
 
 
295 aa  171  1e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  37.12 
 
 
300 aa  160  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0942  signal transduction protein  34.63 
 
 
307 aa  137  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1067  signal transduction protein  29.08 
 
 
303 aa  113  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2165  hypothetical protein  29.58 
 
 
291 aa  112  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.758559  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0897  signal transduction protein  29.89 
 
 
303 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1625  signal transduction protein  29.89 
 
 
303 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1049  signal transduction protein  28.83 
 
 
303 aa  106  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0754  signal transduction protein  27.3 
 
 
302 aa  97.4  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.284841  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1886  hypothetical protein  28.32 
 
 
291 aa  93.6  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2102  signal transduction protein  30.21 
 
 
292 aa  90.5  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0640  hypothetical protein  29.02 
 
 
292 aa  90.1  4e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2936  signal transduction protein  28.42 
 
 
292 aa  89.7  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000290592  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1922  signal transduction protein  28.92 
 
 
293 aa  85.5  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0054  putative signal transduction protein with CBS domains  28.12 
 
 
292 aa  84  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1153  signal transduction protein  27.92 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1407  signal transduction protein  39.2 
 
 
322 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2734  Protein of unknown function DUF293  34.44 
 
 
177 aa  68.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.645133 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0304  Protein of unknown function DUF293  32.89 
 
 
177 aa  67  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.480647  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2771  transcriptional regulator, TrmB  34.44 
 
 
177 aa  64.7  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.129306  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  30.49 
 
 
426 aa  63.5  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.62 
 
 
903 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2269  Protein of unknown function DUF293  31.79 
 
 
177 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1487  sigma-L-dependent transcriptional regulator  35 
 
 
696 aa  62  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  30.47 
 
 
256 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  29.75 
 
 
261 aa  61.2  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  32.17 
 
 
154 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  31.65 
 
 
909 aa  60.1  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1475  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.57 
 
 
321 aa  59.3  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  27.52 
 
 
153 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.57 
 
 
321 aa  59.3  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  34.85 
 
 
903 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1719  CBS domain-containing protein  31.15 
 
 
143 aa  59.3  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000658293 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  30.3 
 
 
223 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  25.66 
 
 
152 aa  58.9  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  31.03 
 
 
155 aa  58.9  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  34.09 
 
 
903 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  30.33 
 
 
909 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2105  Protein of unknown function DUF293  44 
 
 
178 aa  58.9  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0300972  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  31.75 
 
 
380 aa  58.9  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  27.78 
 
 
427 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  27.82 
 
 
223 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0936  Protein of unknown function DUF293  33.33 
 
 
177 aa  57.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0850424  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  30.95 
 
 
221 aa  57.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3672  Protein of unknown function DUF293  36.25 
 
 
173 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.829255  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  25.49 
 
 
161 aa  57.8  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  24.31 
 
 
423 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  25.66 
 
 
152 aa  57.4  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0942  CBS domain containing membrane protein  25.15 
 
 
277 aa  57.4  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  27.01 
 
 
309 aa  57.4  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4744  thioesterase family protein  27.2 
 
 
437 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1395  CBS domain-containing protein  30.47 
 
 
137 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1434  CBS domain-containing protein  32.8 
 
 
336 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4739  thioesterase family protein  27.2 
 
 
437 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  29.32 
 
 
216 aa  56.2  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  25.19 
 
 
366 aa  56.2  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  29.32 
 
 
216 aa  56.2  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3293  DRTGG domain-containing protein  26.4 
 
 
437 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.113005  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  35 
 
 
875 aa  55.8  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  32.58 
 
 
279 aa  55.8  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  31.14 
 
 
867 aa  55.8  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1441  Polynucleotide adenylyltransferase region  29.69 
 
 
821 aa  55.8  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000556215  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  28.37 
 
 
223 aa  55.8  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  26.03 
 
 
153 aa  55.8  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0965  hypothetical protein  27.34 
 
 
271 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  27.78 
 
 
412 aa  55.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  30.28 
 
 
153 aa  55.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4532  transcriptional regulator, TrmB  37.5 
 
 
177 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1762  CBS domain-containing protein  29.51 
 
 
258 aa  55.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0911451  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0838  signal transduction protein  29.55 
 
 
279 aa  55.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.545659  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1913  putative sigma54 specific transcriptional regulator  32.48 
 
 
710 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0899132  normal  0.0546689 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1231  CBS domain-containing protein  30.08 
 
 
137 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.022182  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4505  thioesterase family protein  26.4 
 
 
437 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4341  CBS domain-containing cytosolic protein  26.4 
 
 
437 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4353  CBS domain-containing cytosolic protein  26.4 
 
 
437 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  35 
 
 
875 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  32.48 
 
 
593 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4727  thioesterase family protein  26.4 
 
 
437 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4858  thioesterase family protein  26.4 
 
 
437 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  28.29 
 
 
153 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2064  hypothetical protein  31.71 
 
 
139 aa  54.3  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.769911  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  25.87 
 
 
427 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  31.4 
 
 
338 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  24.32 
 
 
154 aa  54.3  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  29.2 
 
 
282 aa  53.9  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  28.12 
 
 
211 aa  53.9  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0517  thioesterase family protein  26.4 
 
 
437 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1405  signal transduction protein  29.32 
 
 
137 aa  53.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  33.33 
 
 
590 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  26.57 
 
 
428 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  29.55 
 
 
904 aa  53.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0546  putative signal-transduction protein with CBS and DRTGG domains  26.72 
 
 
434 aa  53.5  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.865084 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0735  putative signal transduction protein with CBS domains  27.27 
 
 
290 aa  53.5  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.14806  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0503  signal transduction protein  29.69 
 
 
137 aa  53.1  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  31.25 
 
 
907 aa  53.1  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>