31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0304 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0304  Protein of unknown function DUF293  100 
 
 
177 aa  354  2.9999999999999997e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.480647  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2269  Protein of unknown function DUF293  92.09 
 
 
177 aa  331  3e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4532  transcriptional regulator, TrmB  79.1 
 
 
177 aa  296  9e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0936  Protein of unknown function DUF293  76.84 
 
 
177 aa  274  5e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0850424  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2734  Protein of unknown function DUF293  75.71 
 
 
177 aa  269  2e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.645133 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2771  transcriptional regulator, TrmB  70.62 
 
 
177 aa  255  2e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.129306  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3672  Protein of unknown function DUF293  60.71 
 
 
173 aa  216  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.829255  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1886  hypothetical protein  48.57 
 
 
291 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2165  hypothetical protein  49.14 
 
 
291 aa  177  5.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.758559  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1153  signal transduction protein  48.5 
 
 
288 aa  166  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1922  signal transduction protein  44.19 
 
 
293 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0054  putative signal transduction protein with CBS domains  46.51 
 
 
292 aa  160  9e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2102  signal transduction protein  43.6 
 
 
292 aa  153  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2936  signal transduction protein  41.28 
 
 
292 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000290592  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1067  signal transduction protein  44.19 
 
 
303 aa  142  3e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0897  signal transduction protein  43.02 
 
 
303 aa  142  3e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0754  signal transduction protein  41.36 
 
 
302 aa  141  5e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.284841  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0640  hypothetical protein  42.42 
 
 
292 aa  140  7e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1049  signal transduction protein  42.44 
 
 
303 aa  140  8e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1625  signal transduction protein  41.86 
 
 
303 aa  138  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1169  Protein of unknown function DUF293  40.94 
 
 
176 aa  136  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.896672  normal  0.435827 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2105  Protein of unknown function DUF293  43.53 
 
 
178 aa  133  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0300972  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2063  protein of unknown function UPF0074  34.5 
 
 
194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  33.71 
 
 
300 aa  107  9.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  34.83 
 
 
300 aa  102  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  32.34 
 
 
295 aa  90.9  9e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0942  signal transduction protein  30.12 
 
 
307 aa  79.7  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1555  signal transduction protein  32.89 
 
 
286 aa  67  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1735  signal transduction protein  33.57 
 
 
286 aa  63.9  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.281156  decreased coverage  0.000421461 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1742  signal transduction protein  29.8 
 
 
286 aa  55.5  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.12379 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0565  signal transduction protein  27.45 
 
 
286 aa  54.3  0.0000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  hitchhiker  0.00109381 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>