More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0897 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0897  signal transduction protein  100 
 
 		 303 aa  600  1e-170  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1049  signal transduction protein  96.7 
 
 		 303 aa  588  1e-167  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1625  signal transduction protein  94.72 
 
 		 303 aa  574  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1067  signal transduction protein  77.56 
 
 		 303 aa  478  1e-134  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0754  signal transduction protein  60.61 
 
 		 302 aa  363  2e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.284841  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1886  hypothetical protein  42.21 
 
 		 291 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2165  hypothetical protein  40.62 
 
 		 291 aa  219  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.758559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2102  signal transduction protein  36.79 
 
 		 292 aa  202  4e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0640  hypothetical protein  37.46 
 
 		 292 aa  199  7e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2936  signal transduction protein  37.5 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000290592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0054  putative signal transduction protein with CBS domains  36.7 
 
 		 292 aa  195  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1153  signal transduction protein  40.74 
 
 		 288 aa  194  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1922  signal transduction protein  37.33 
 
 		 293 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  34.58 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0936  Protein of unknown function DUF293  50 
 
 		 177 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0850424  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2771  transcriptional regulator, TrmB  44.19 
 
 		 177 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.129306  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  32.88 
 
 		 300 aa  152  7e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2734  Protein of unknown function DUF293  43.53 
 
 		 177 aa  149  4e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.645133 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2269  Protein of unknown function DUF293  43.02 
 
 		 177 aa  145  7.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0304  Protein of unknown function DUF293  43.02 
 
 		 177 aa  142  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.480647  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  32.88 
 
 		 295 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4532  transcriptional regulator, TrmB  41.36 
 
 		 177 aa  139  7e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1735  signal transduction protein  29.89 
 
 		 286 aa  117  3e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.281156  decreased coverage  0.000421461 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0565  signal transduction protein  30.85 
 
 		 286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  hitchhiker  0.00109381 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3672  Protein of unknown function DUF293  35.8 
 
 		 173 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.829255  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0942  signal transduction protein  28.77 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1555  signal transduction protein  29.89 
 
 		 286 aa  108  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1742  signal transduction protein  29.43 
 
 		 286 aa  106  5e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.12379 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2063  protein of unknown function UPF0074  29.65 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2105  Protein of unknown function DUF293  30.2 
 
 		 178 aa  81.3  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0300972  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  31.51 
 
 		 873 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  30.37 
 
 		 769 aa  74.7  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1169  Protein of unknown function DUF293  27.33 
 
 		 176 aa  71.6  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.896672  normal  0.435827 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  34.92 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1475  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.43 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.43 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.14 
 
 		 873 aa  69.7  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1615  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  29.01 
 
 		 636 aa  67.4  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  39.42 
 
 		 689 aa  67.4  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  29.73 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  31.06 
 
 		 907 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  31.97 
 
 		 867 aa  63.9  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  29.17 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1899  putative signal transduction protein with CBS domains  30.17 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  29.01 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0451  hypothetical protein  25.89 
 
 		 502 aa  62.8  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6054  signal transduction protein  32.46 
 
 		 193 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000453933 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  31.36 
 
 		 366 aa  62  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  37.5 
 
 		 909 aa  61.6  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5536  CBS domain-containing protein  31.97 
 
 		 141 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0354137 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  26.43 
 
 		 880 aa  61.2  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  35.71 
 
 		 859 aa  61.6  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  25.38 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.09 
 
 		 605 aa  60.8  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  31.75 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  28.1 
 
 		 503 aa  60.1  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  29.91 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  34.58 
 
 		 615 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4760  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462026  normal  0.418108 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  31.93 
 
 		 890 aa  59.7  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1016  diguanylate cyclase  31.19 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  31.48 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2060  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.03 
 
 		 490 aa  59.3  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  31.93 
 
 		 500 aa  59.3  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  34.23 
 
 		 620 aa  58.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  30.77 
 
 		 209 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  35 
 
 		 615 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1568  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.91 
 
 		 488 aa  58.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  30.63 
 
 		 688 aa  58.9  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  29.57 
 
 		 615 aa  58.9  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0767  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.39 
 
 		 675 aa  57.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000798179  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  31.58 
 
 		 863 aa  58.2  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  30.34 
 
 		 155 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 149 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  33.64 
 
 		 615 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.09 
 
 		 485 aa  57.4  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  25.83 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  33.64 
 
 		 615 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1249  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 141 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  30.19 
 
 		 143 aa  57.4  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  34.55 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6583  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 141 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  35.19 
 
 		 903 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  28.45 
 
 		 845 aa  57.4  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1022  cyclic nucleotide-binding protein  25.42 
 
 		 613 aa  56.6  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1209  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.83 
 
 		 499 aa  57  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000206103  hitchhiker  0.00000852941 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0635  CBS domain-containing protein  35.58 
 
 		 432 aa  57  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00186716  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  33.93 
 
 		 615 aa  57  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  34.23 
 
 		 904 aa  56.6  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  32.43 
 
 		 620 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  32.43 
 
 		 620 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  28.57 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  28.99 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  30.48 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  33.64 
 
 		 615 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2632  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.46 
 
 		 486 aa  56.2  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6186  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  34 
 
 		 615 aa  56.2  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  29.31 
 
 		 492 aa  56.2  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.01 
 
 		 877 aa  56.2  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.625204 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>