31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4532 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013745  Htur_4532  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 177 aa  357  4e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2269  Protein of unknown function DUF293  79.66 
 
 		 177 aa  298  3e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0304  Protein of unknown function DUF293  79.1 
 
 		 177 aa  296  9e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.480647  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0936  Protein of unknown function DUF293  72.32 
 
 		 177 aa  269  2e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0850424  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2734  Protein of unknown function DUF293  71.75 
 
 		 177 aa  258  2e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.645133 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2771  transcriptional regulator, TrmB  68.36 
 
 		 177 aa  248  3e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.129306  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3672  Protein of unknown function DUF293  58.82 
 
 		 173 aa  222  2e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.829255  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1886  hypothetical protein  49.14 
 
 		 291 aa  176  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0054  putative signal transduction protein with CBS domains  48.5 
 
 		 292 aa  163  9e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2165  hypothetical protein  45.71 
 
 		 291 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.758559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1153  signal transduction protein  46.07 
 
 		 288 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1922  signal transduction protein  43.43 
 
 		 293 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2102  signal transduction protein  42.51 
 
 		 292 aa  150  7e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2936  signal transduction protein  43.11 
 
 		 292 aa  150  8.999999999999999e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000290592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0754  signal transduction protein  41.01 
 
 		 302 aa  149  2e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.284841  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0640  hypothetical protein  41.32 
 
 		 292 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0897  signal transduction protein  41.36 
 
 		 303 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1049  signal transduction protein  41.36 
 
 		 303 aa  139  3e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1625  signal transduction protein  41.36 
 
 		 303 aa  139  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1067  signal transduction protein  41.98 
 
 		 303 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1169  Protein of unknown function DUF293  39.18 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.896672  normal  0.435827 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2063  protein of unknown function UPF0074  37.43 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2105  Protein of unknown function DUF293  40 
 
 		 178 aa  123  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0300972  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  31.84 
 
 		 300 aa  108  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  32.4 
 
 		 300 aa  108  4.0000000000000004e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  32.39 
 
 		 295 aa  84.3  8e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0942  signal transduction protein  29.82 
 
 		 307 aa  81.6  0.000000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1742  signal transduction protein  30.67 
 
 		 286 aa  57  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.12379 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1735  signal transduction protein  30.23 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.281156  decreased coverage  0.000421461 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1555  signal transduction protein  37.5 
 
 		 286 aa  55.1  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0565  signal transduction protein  34.15 
 
 		 286 aa  53.9  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  hitchhiker  0.00109381 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>