More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1885 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  100 
 
 
145 aa  286  6e-77  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  80.28 
 
 
142 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  72.34 
 
 
145 aa  213  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  51.72 
 
 
145 aa  169  1e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  54.55 
 
 
136 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0255  signal-transduction protein  55.63 
 
 
142 aa  147  5e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0155982  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  51.59 
 
 
141 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  49.25 
 
 
141 aa  132  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  49.21 
 
 
141 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1597  signal-transduction protein  50 
 
 
141 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  46.67 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  36.09 
 
 
160 aa  107  5e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  43.51 
 
 
139 aa  106  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  41.18 
 
 
135 aa  104  5e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0201  signal-transduction protein  41.41 
 
 
138 aa  102  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0979  signal transduction protein  41.18 
 
 
139 aa  100  4e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000114145 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1479  signal-transduction protein  41.32 
 
 
126 aa  96.7  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2105  signal-transduction protein  40 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.141062  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1825  signal-transduction protein  39.71 
 
 
139 aa  94.7  3e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  40.54 
 
 
688 aa  94.4  5e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  39.64 
 
 
688 aa  93.6  8e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  39.06 
 
 
130 aa  87.4  6e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  41.38 
 
 
131 aa  87  7e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  38.4 
 
 
132 aa  87.4  7e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  38.51 
 
 
145 aa  87  8e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0939  signal-transduction protein  37.4 
 
 
135 aa  86.7  9e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.120432  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  39.85 
 
 
140 aa  86.3  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0254  signal-transduction protein  40.3 
 
 
136 aa  86.7  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00659332  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0295  signal-transduction protein  40.77 
 
 
139 aa  84.7  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0624  signal-transduction protein  38.64 
 
 
143 aa  83.2  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  40.34 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  38.89 
 
 
142 aa  80.1  0.000000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  36.97 
 
 
128 aa  80.1  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  35.19 
 
 
688 aa  79  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  41.18 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  36.96 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  35.83 
 
 
618 aa  78.2  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0471  nucleotidyltransferase, putative  35 
 
 
622 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4702  cyclic nucleotide-binding/CBS:putative nucleotidyltransferase  35 
 
 
644 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  44.54 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  37.3 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2880  signal-transduction protein  34.78 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.982708  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  31.65 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  36.94 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  36.94 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  39.34 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  36.04 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1251  signal-transduction protein  32.23 
 
 
131 aa  73.2  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.904359  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  34.43 
 
 
623 aa  72.8  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  34.13 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  38.69 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  39.23 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1855  CBS domain-containing protein  47.5 
 
 
88 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3004  signal-transduction protein  37.25 
 
 
139 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  36.43 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0410  putative CBS domain-containing signal transduction protein  39.05 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269207  normal  0.258379 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3204  putative signal transduction protein with CBS domains  37.25 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.585184  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  30.25 
 
 
144 aa  72  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3103  putative signal-transduction protein with CBS domains  37.25 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  36.67 
 
 
643 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  35.77 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  36.3 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3238  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.365049  normal  0.128899 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  33.61 
 
 
133 aa  70.5  0.000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  35.62 
 
 
153 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  35.62 
 
 
153 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0705  putative signal transduction protein with CBS domains  35.4 
 
 
124 aa  70.1  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  35.62 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  34.13 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6173  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.67 
 
 
837 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  35.62 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  34.15 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.34 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  36 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1863  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.3 
 
 
625 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0994673  normal  0.46863 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  35.71 
 
 
120 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.05 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  35.62 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  35.45 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2480  CBS domain-containing protein  33.61 
 
 
639 aa  68.2  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218166  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2079  signal-transduction protein  37.14 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.266751  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2096  signal-transduction protein  37.14 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3773  putative signal transduction protein with CBS domains  31.62 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2142  signal-transduction protein  37.14 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0386104 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  37.72 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2052  cyclic nucleotide-binding protein  33.61 
 
 
663 aa  67.8  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  35.79 
 
 
689 aa  67.8  0.00000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  28.79 
 
 
188 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3669  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2234  putative signal transduction protein with CBS domains  32.59 
 
 
139 aa  67  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2970  signal-transduction protein  33.33 
 
 
187 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  26.77 
 
 
625 aa  67  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0090  CBS signal-transduction protein  30.43 
 
 
629 aa  67  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.382061 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1321  hypothetical protein  32.85 
 
 
142 aa  67  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0382  CBS domain-containing protein  29.71 
 
 
645 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.263171 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  36.13 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0859  XRE family transcriptional regulator  36.97 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  38.18 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.44759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>