More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0258 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0258  signal transduction protein  100 
 
 
412 aa  834    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.100598  normal  0.0168412 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  95.4 
 
 
413 aa  799    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  95.4 
 
 
413 aa  802    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  76.85 
 
 
411 aa  670    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  59.85 
 
 
399 aa  497  1e-139  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1776  CBS domain containing membrane protein  29.78 
 
 
381 aa  100  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17343  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2607  CBS domain containing membrane protein  28.84 
 
 
384 aa  94.4  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00560791  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  25.13 
 
 
380 aa  93.2  9e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  25.6 
 
 
386 aa  92.8  9e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0072  CBS domain containing membrane protein  28.26 
 
 
398 aa  92.4  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2156  CBS domain containing membrane protein  28.2 
 
 
385 aa  82.4  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1627  putative signal transduction protein with CBS domains  24.55 
 
 
379 aa  81.3  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.759399 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1013  CBS domain containing membrane protein  28.38 
 
 
380 aa  80.9  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  26.98 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0532  signal-transduction protein  27.64 
 
 
375 aa  76.3  0.0000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0376075 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0171  signal transduction protein  35 
 
 
132 aa  73.9  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  24.56 
 
 
331 aa  73.6  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  25.62 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  28.08 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  39.5 
 
 
295 aa  69.3  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  23.53 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  25.35 
 
 
281 aa  67.4  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  28.08 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  34.78 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0750  hypothetical protein  25.87 
 
 
291 aa  67  0.0000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341574  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  30.61 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0184  putative signal transduction protein with CBS domains  30.94 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  25.81 
 
 
313 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  32.5 
 
 
492 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  26.03 
 
 
242 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  35.83 
 
 
615 aa  63.9  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  27.59 
 
 
291 aa  63.9  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  26.85 
 
 
243 aa  63.5  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  34.55 
 
 
300 aa  63.5  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1796  CBS domain-containing protein  26.33 
 
 
315 aa  63.5  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.507937  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  33.59 
 
 
187 aa  63.2  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  21.68 
 
 
427 aa  63.2  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  26.8 
 
 
282 aa  63.2  0.000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00722  Signaling protein with a cAMP-binding, CBS domains and predicted nucleotidyltransferase domain  30.95 
 
 
613 aa  62.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  26.71 
 
 
339 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  32.79 
 
 
149 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  31.58 
 
 
127 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  26.34 
 
 
250 aa  61.2  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  28.11 
 
 
227 aa  61.2  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  25.5 
 
 
243 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1806  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  23.91 
 
 
574 aa  61.2  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55767  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1407  signal transduction protein  38.78 
 
 
322 aa  61.2  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  37.69 
 
 
225 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  34.75 
 
 
513 aa  60.8  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  28.74 
 
 
226 aa  60.8  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  33.9 
 
 
513 aa  61.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2638  putative signal transduction protein with CBS domains  26.09 
 
 
144 aa  60.5  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  28.77 
 
 
149 aa  60.1  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3545  CBS domain containing protein  24 
 
 
411 aa  60.1  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  32.06 
 
 
216 aa  60.1  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0838  signal transduction protein  31.35 
 
 
279 aa  60.1  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.545659  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  26.56 
 
 
688 aa  59.7  0.00000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  28.69 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  29.32 
 
 
269 aa  59.3  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  27.41 
 
 
148 aa  58.9  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  27.15 
 
 
261 aa  59.3  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  25.98 
 
 
313 aa  58.9  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0152  signal transduction protein  30.72 
 
 
160 aa  59.3  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0565  signal transduction protein  38.89 
 
 
286 aa  58.9  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  hitchhiker  0.00109381 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  31.3 
 
 
216 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  29.58 
 
 
426 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2165  hypothetical protein  32.46 
 
 
291 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.758559  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  26.62 
 
 
143 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  25.34 
 
 
230 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  30.49 
 
 
187 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  28.67 
 
 
226 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  28.36 
 
 
232 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2675  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  20.66 
 
 
840 aa  58.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0500157  hitchhiker  7.41843e-16 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  31.82 
 
 
188 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  33.62 
 
 
225 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  30.51 
 
 
128 aa  58.5  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1072  CBS domain containing protein  32.47 
 
 
221 aa  58.5  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  26.03 
 
 
223 aa  58.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  32.85 
 
 
133 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  30.67 
 
 
211 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3348  putative nucleotidyltransferase  21.76 
 
 
646 aa  57.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.351645  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  32.26 
 
 
225 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  34.65 
 
 
130 aa  57.4  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0735  putative signal transduction protein with CBS domains  24.38 
 
 
290 aa  57.4  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.14806  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3956  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  33.64 
 
 
325 aa  57.4  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  30.16 
 
 
907 aa  57.4  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0731  arabinose-5-phosphate isomerase  29.11 
 
 
325 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2043  homoserine O-acetyltransferase  29.41 
 
 
491 aa  57  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0677  KpsF/GutQ family protein  34.58 
 
 
325 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.953587  normal  0.0677039 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  27.94 
 
 
217 aa  57  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  24.12 
 
 
226 aa  57  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  32.81 
 
 
133 aa  56.6  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  31.85 
 
 
490 aa  57  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  30.83 
 
 
185 aa  56.6  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  32.76 
 
 
620 aa  56.6  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  30.22 
 
 
246 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  26.85 
 
 
909 aa  55.8  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  26.32 
 
 
217 aa  55.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0678  KpsF/GutQ family protein  33.64 
 
 
325 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.732488  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  34.23 
 
 
615 aa  56.2  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>