More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0578 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  100 
 
 		 413 aa  834    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  75.86 
 
 		 411 aa  660    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0258  signal transduction protein  95.4 
 
 		 412 aa  802    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.100598  normal  0.0168412 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  97.34 
 
 		 413 aa  816    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  60.61 
 
 		 399 aa  501  1e-141  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1776  CBS domain containing membrane protein  30.48 
 
 		 381 aa  99.8  7e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17343  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2607  CBS domain containing membrane protein  29.43 
 
 		 384 aa  95.5  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00560791  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  25.32 
 
 		 380 aa  95.1  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0072  CBS domain containing membrane protein  28.89 
 
 		 398 aa  93.2  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  24.77 
 
 		 386 aa  92.8  9e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2156  CBS domain containing membrane protein  28.52 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1013  CBS domain containing membrane protein  28.38 
 
 		 380 aa  82.8  0.000000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1627  putative signal transduction protein with CBS domains  24.76 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.759399 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0532  signal-transduction protein  28.46 
 
 		 375 aa  79.3  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0376075 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  25.9 
 
 		 279 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  27.44 
 
 		 315 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  24.73 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0171  signal transduction protein  35 
 
 		 132 aa  73.9  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  28.77 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  30.14 
 
 		 243 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  38.66 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  28.08 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  24.91 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  24.31 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0750  hypothetical protein  25.87 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  27.52 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  33.33 
 
 		 492 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  27.52 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  30.61 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1796  CBS domain-containing protein  27.8 
 
 		 315 aa  67  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.507937  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  34.43 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  29.34 
 
 		 226 aa  65.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1806  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  23.99 
 
 		 574 aa  66.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55767  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  25.45 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  33.33 
 
 		 282 aa  65.5  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  33.04 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  26.34 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  32.82 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  37.19 
 
 		 688 aa  63.9  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  32.82 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  27.65 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0152  signal transduction protein  31.37 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1072  CBS domain containing protein  33.77 
 
 		 221 aa  62.4  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0184  putative signal transduction protein with CBS domains  29.5 
 
 		 142 aa  62.4  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  21.17 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 865 aa  62.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  35 
 
 		 615 aa  62.4  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2693  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.42 
 
 		 873 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2638  putative signal transduction protein with CBS domains  26.81 
 
 		 144 aa  62  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  26.03 
 
 		 230 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  33.9 
 
 		 513 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2675  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  21.31 
 
 		 840 aa  62.4  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0500157  hitchhiker  7.41843e-16 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  27.6 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  32.84 
 
 		 138 aa  62  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  28.69 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  27.4 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  26.03 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  33.9 
 
 		 513 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  29.37 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  28.36 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2043  homoserine O-acetyltransferase  31.09 
 
 		 491 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  32.06 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  31.15 
 
 		 149 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  29.45 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  28.65 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00722  Signaling protein with a cAMP-binding, CBS domains and predicted nucleotidyltransferase domain  30.95 
 
 		 613 aa  60.8  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3545  CBS domain containing protein  24.29 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  28.68 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  27.41 
 
 		 148 aa  60.5  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  28.06 
 
 		 143 aa  60.5  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  31.82 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  31.58 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  26.24 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  31.58 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1479  signal-transduction protein  25.19 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.543565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  30.94 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  35.14 
 
 		 615 aa  59.7  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0793  hypothetical protein  32.5 
 
 		 511 aa  59.7  0.00000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.455242  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  35.14 
 
 		 615 aa  59.7  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  32.2 
 
 		 128 aa  59.3  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  28.77 
 
 		 149 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  25.36 
 
 		 280 aa  59.7  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  26.17 
 
 		 242 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  36.36 
 
 		 142 aa  58.5  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0348  CBS domain-containing protein  23.18 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  24.12 
 
 		 226 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  32.12 
 
 		 133 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0467  KpsF/GutQ  29.11 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3348  putative nucleotidyltransferase  21.24 
 
 		 646 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.351645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  24.69 
 
 		 242 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  36.15 
 
 		 225 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  32.81 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  21.85 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  35.14 
 
 		 615 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  33.08 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  35.14 
 
 		 615 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  29.45 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  29.5 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  32.81 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0451  hypothetical protein  31.62 
 
 		 502 aa  58.2  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>