More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0657 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  100 
 
 
309 aa  617  1e-176  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0628  signal transduction protein  69.16 
 
 
307 aa  420  1e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1475  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  64.38 
 
 
321 aa  409  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  64.38 
 
 
321 aa  409  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0911  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.51 
 
 
290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1291  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  50.76 
 
 
139 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0334  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  44.78 
 
 
149 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2146  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  50.76 
 
 
139 aa  122  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0092  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  43.28 
 
 
144 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.305697  hitchhiker  0.00140915 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0179  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  46.21 
 
 
142 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3799  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  44.36 
 
 
140 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000337486  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0691  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.04 
 
 
142 aa  107  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0164  CBS domain-containing protein  35.51 
 
 
139 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00289218  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2358  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.64 
 
 
494 aa  81.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.890412  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1382  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.79 
 
 
489 aa  79.3  0.00000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.614319 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  35.2 
 
 
300 aa  79  0.00000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  33.78 
 
 
152 aa  78.6  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2784  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.64 
 
 
495 aa  78.6  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.757104  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01920  Inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  36.51 
 
 
154 aa  77.4  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.778717  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  29.45 
 
 
368 aa  77.4  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0754  signal transduction protein  35.77 
 
 
302 aa  76.3  0.0000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.284841  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  35.65 
 
 
262 aa  75.9  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  30.47 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  31.72 
 
 
242 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  37.01 
 
 
217 aa  75.5  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1568  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.21 
 
 
488 aa  74.7  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  30.83 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  32.47 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  35.2 
 
 
141 aa  73.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0640  hypothetical protein  36.75 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  38.98 
 
 
865 aa  73.9  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  31.51 
 
 
242 aa  73.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  33.06 
 
 
503 aa  73.6  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2060  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.75 
 
 
490 aa  73.2  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  32.61 
 
 
223 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  35.4 
 
 
904 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  30.82 
 
 
226 aa  71.2  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1618  CBS domain-containing protein  32.09 
 
 
138 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  30.92 
 
 
241 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  29.11 
 
 
230 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  36.89 
 
 
877 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  31.2 
 
 
593 aa  70.5  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  31.03 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1580  signal-transduction protein  36.61 
 
 
143 aa  70.5  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  32.45 
 
 
153 aa  70.5  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1209  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.81 
 
 
499 aa  70.9  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000206103  hitchhiker  0.00000852941 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  34.96 
 
 
769 aa  70.9  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.19 
 
 
488 aa  70.9  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.85 
 
 
873 aa  70.1  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2859  signal transduction protein  32.84 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206571  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1735  signal transduction protein  31.62 
 
 
286 aa  69.7  0.00000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.281156  decreased coverage  0.000421461 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2711  CBS domain-containing membrane protein  32.62 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1067  signal transduction protein  33.88 
 
 
303 aa  69.3  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  31.39 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  33.33 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  33.91 
 
 
909 aa  69.3  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  32.06 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  28.68 
 
 
295 aa  68.9  0.00000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13445  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  32.82 
 
 
529 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0612971  normal  0.0362546 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  30.07 
 
 
230 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  29.44 
 
 
909 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  32.19 
 
 
231 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  36.04 
 
 
143 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0612  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.51 
 
 
483 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00142081  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  31.15 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  32 
 
 
590 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  24.48 
 
 
391 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0735  putative signal transduction protein with CBS domains  38.94 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.14806  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.37 
 
 
903 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.34 
 
 
903 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  33.33 
 
 
577 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  33.63 
 
 
907 aa  67.8  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  26.92 
 
 
392 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0352  putative signal transduction protein with CBS domains  33.63 
 
 
143 aa  67.8  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014797 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0565  signal transduction protein  31.62 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  hitchhiker  0.00109381 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  38.46 
 
 
132 aa  67.4  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  29.67 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  28.3 
 
 
426 aa  67  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  33.05 
 
 
166 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  35.38 
 
 
873 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1138  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.33 
 
 
500 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  28.96 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1511  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  32.06 
 
 
517 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316091 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  30.22 
 
 
229 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  26.9 
 
 
465 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.6 
 
 
903 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  26.9 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  30.66 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  26.9 
 
 
397 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  26.9 
 
 
397 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04740  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.59 
 
 
514 aa  66.6  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  26.9 
 
 
397 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  27.27 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  26.9 
 
 
382 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1886  hypothetical protein  31.03 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  31.03 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  31.69 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0970  CBS domain-containing protein  31.47 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.85 
 
 
754 aa  66.6  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  26.9 
 
 
382 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>