More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A1140 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  100 
 
 
382 aa  747    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  100 
 
 
346 aa  673    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  93.19 
 
 
416 aa  658    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  100 
 
 
382 aa  747    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  99.48 
 
 
465 aa  743    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  99.74 
 
 
397 aa  746    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  99.48 
 
 
397 aa  744    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  99.74 
 
 
397 aa  746    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  69.03 
 
 
391 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  68.5 
 
 
391 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  68.59 
 
 
391 aa  478  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  67.79 
 
 
399 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5763  CBS domain-containing protein  68.06 
 
 
391 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3827  CBS domain-containing protein  68.32 
 
 
391 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4541  CBS domain-containing protein  68.32 
 
 
391 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.0139408 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  61.32 
 
 
388 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  62.46 
 
 
373 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  62.57 
 
 
387 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  57.85 
 
 
382 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  59.1 
 
 
378 aa  385  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  57.59 
 
 
382 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0583  CBS domain-containing protein  50.93 
 
 
376 aa  310  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461407  normal  0.660708 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  51.04 
 
 
392 aa  309  4e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  49.73 
 
 
379 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  45.67 
 
 
410 aa  288  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  45.48 
 
 
390 aa  287  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  45.83 
 
 
404 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1760  CBS domain containing membrane protein  44.12 
 
 
376 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  44.03 
 
 
368 aa  277  3e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3655  hypothetical protein  44.22 
 
 
389 aa  271  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4053  CBS domain-containing protein  45.05 
 
 
400 aa  264  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0890  CBS domain-containing protein  45.41 
 
 
383 aa  260  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  44.64 
 
 
374 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  42.32 
 
 
361 aa  239  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  39.79 
 
 
376 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  40.97 
 
 
379 aa  239  8e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  41.49 
 
 
379 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  40.45 
 
 
344 aa  235  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  39.25 
 
 
383 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1669  CBS domain-containing protein  40.27 
 
 
389 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  40.49 
 
 
379 aa  233  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2035  CBS domain containing membrane protein  39.89 
 
 
389 aa  233  5e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  42.32 
 
 
379 aa  233  6e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  38.93 
 
 
373 aa  227  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  39.16 
 
 
449 aa  223  4e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0211  CBS domain-containing protein  43.51 
 
 
401 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40540  CBS domain-containing protein  38.52 
 
 
385 aa  209  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3439  hypothetical protein  38.52 
 
 
385 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1949  CBS domain-containing protein  36.8 
 
 
384 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429977  normal  0.0328188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3347  CBS domain-containing protein  36.53 
 
 
384 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2349  CBS domain-containing protein  36.13 
 
 
384 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1006  HPP family protein+B94  35.25 
 
 
383 aa  196  5.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3678  CBS domain containing membrane protein  38.16 
 
 
377 aa  195  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0501093  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  37.87 
 
 
394 aa  194  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  38.92 
 
 
391 aa  192  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1789  CBS domain-containing protein  37.33 
 
 
385 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228479  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4734  CBS domain-containing protein  41.11 
 
 
376 aa  180  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0061944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51100  HPP domain and CBS domain pair-containing protein  37.84 
 
 
374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299574  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4302  HPP family protein  47.39 
 
 
238 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4192  CBS:HPP  34.24 
 
 
390 aa  170  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0830  CBS domain-containing protein  35.69 
 
 
366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2488  CBS domain-containing protein  33.88 
 
 
366 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0447094  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1929  HPP  37.35 
 
 
323 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.171366  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0348  CBS domain-containing protein  35.41 
 
 
420 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3821  HPP family protein  34.42 
 
 
404 aa  139  7e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0819644  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  31.67 
 
 
325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2325  CBS domain-containing protein  40.64 
 
 
285 aa  127  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820911  normal  0.700753 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  33.91 
 
 
324 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3284  HPP  39.37 
 
 
231 aa  120  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.463691  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0299  HPP family protein+B94  42.86 
 
 
180 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1070  HPP family protein  38.76 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496114  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2629  HPP family protein?  39.86 
 
 
164 aa  112  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0334543 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  42.18 
 
 
180 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0430  HPP family protein?  33.18 
 
 
240 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.126514  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2860  HPP  41.71 
 
 
231 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.108086 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1498  HPP domain protein  39.18 
 
 
284 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0190022  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0138  HPP family protein+B94  43.59 
 
 
179 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  35.71 
 
 
199 aa  97.1  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  34.66 
 
 
199 aa  96.7  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  36.13 
 
 
194 aa  96.7  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  49.04 
 
 
178 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  37.5 
 
 
185 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  39.22 
 
 
183 aa  94.7  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3698  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 
202 aa  92.8  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.701418 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  33.93 
 
 
231 aa  92.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0503  HPP family membrane protein  43.51 
 
 
186 aa  92  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0469  HPP family protein  39.33 
 
 
207 aa  89.7  8e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  39.71 
 
 
182 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.687562 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15991  hypothetical protein  38.89 
 
 
178 aa  87.4  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.456081  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3855  HPP family protein  38.24 
 
 
182 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4271  HPP family protein  38.24 
 
 
182 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0081  HPP family protein  38.24 
 
 
182 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0064  HPP family protein+B94  38.24 
 
 
182 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2401  HPP  38.71 
 
 
178 aa  85.1  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0078  HPP family protein?  38.24 
 
 
182 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0081  HPP family protein  38.24 
 
 
182 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0079  HPP family protein  38.24 
 
 
182 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0083  HPP family protein?  38.24 
 
 
182 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  37.86 
 
 
427 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1745  hypothetical protein  43.97 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0908487  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>