More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1902 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 231 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  64.91 
 
 		 228 aa  301  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  49.55 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  48.65 
 
 		 230 aa  185  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  44.84 
 
 		 230 aa  178  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  44.84 
 
 		 230 aa  178  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  44.58 
 
 		 241 aa  177  9e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  46.4 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  38.57 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  40.54 
 
 		 242 aa  159  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  40.99 
 
 		 243 aa  155  6e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  40.99 
 
 		 246 aa  155  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  40.09 
 
 		 243 aa  154  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  39.64 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  38.29 
 
 		 242 aa  149  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  37.84 
 
 		 243 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  40.81 
 
 		 242 aa  149  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  40.44 
 
 		 231 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  39.01 
 
 		 226 aa  148  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  40.99 
 
 		 246 aa  144  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  38.29 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  36.65 
 
 		 249 aa  143  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  36.09 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  40.99 
 
 		 247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  32.6 
 
 		 236 aa  122  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6177  transport-associated  40.21 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2522  CBS domain containing membrane protein  37.1 
 
 		 235 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0807239 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1897  signal-transduction protein  31.39 
 
 		 231 aa  118  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  31.22 
 
 		 233 aa  111  9e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  43.14 
 
 		 339 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  44.08 
 
 		 348 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  44.22 
 
 		 338 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  31.02 
 
 		 232 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  36.57 
 
 		 201 aa  99.8  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  40.82 
 
 		 339 aa  98.6  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  38 
 
 		 154 aa  95.5  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  43.54 
 
 		 333 aa  95.1  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  35.53 
 
 		 147 aa  93.6  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  31.77 
 
 		 226 aa  92.8  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  37.41 
 
 		 153 aa  91.7  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  35.86 
 
 		 153 aa  91.7  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  32.23 
 
 		 232 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  33.56 
 
 		 152 aa  89.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  33.79 
 
 		 152 aa  90.1  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  37.04 
 
 		 164 aa  90.1  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  31.03 
 
 		 234 aa  88.6  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  31.98 
 
 		 217 aa  88.6  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  33.1 
 
 		 155 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  35.86 
 
 		 132 aa  87.8  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2008  CBS  41.33 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  33.11 
 
 		 149 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  29.69 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  39.73 
 
 		 332 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  35.86 
 
 		 155 aa  81.3  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  32.65 
 
 		 149 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  37.75 
 
 		 151 aa  80.9  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  32.65 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  34.27 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  30.67 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2711  CBS domain-containing membrane protein  30.3 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  31.33 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  31.97 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  31.85 
 
 		 427 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  31.76 
 
 		 153 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  31.76 
 
 		 153 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  30.82 
 
 		 151 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  33.57 
 
 		 150 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  27.27 
 
 		 907 aa  76.6  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  35.37 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  30.2 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  29.93 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  34.75 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0394  CBS domain-containing membrane protein  33.8 
 
 		 201 aa  75.1  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  28.97 
 
 		 155 aa  74.7  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  29.73 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  29.93 
 
 		 145 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  30.06 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 		 428 aa  72  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_8994  predicted protein  33.81 
 
 		 133 aa  72  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  28.06 
 
 		 241 aa  71.6  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  27.27 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  32.67 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  32.14 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  34.59 
 
 		 147 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  32.24 
 
 		 153 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  31.29 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  37.93 
 
 		 436 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  27.27 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  30.56 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  34.87 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2021  CBS domain containing membrane protein  33.54 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  33.1 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  29.03 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  32.62 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  33.55 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  32.19 
 
 		 309 aa  68.6  0.00000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  31.58 
 
 		 148 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  29.09 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>