More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5888 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 242 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  58.01 
 
 		 230 aa  277  9e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  54.08 
 
 		 231 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  49.78 
 
 		 230 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  45.89 
 
 		 229 aa  205  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  45.41 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  45.41 
 
 		 230 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  43.89 
 
 		 242 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  43.3 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  43.89 
 
 		 243 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  42.48 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  42.99 
 
 		 243 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  43.48 
 
 		 241 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  41.89 
 
 		 243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  42.99 
 
 		 243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  40.72 
 
 		 242 aa  164  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  41.26 
 
 		 231 aa  161  9e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  39.13 
 
 		 242 aa  161  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  41.26 
 
 		 228 aa  158  6e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  38.94 
 
 		 223 aa  152  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  38.01 
 
 		 249 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  42.53 
 
 		 246 aa  148  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  43.53 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  41.33 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  39.35 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6177  transport-associated  39.89 
 
 		 198 aa  126  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1897  signal-transduction protein  31.9 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  35.84 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2522  CBS domain containing membrane protein  39.38 
 
 		 235 aa  112  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0807239 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  39.52 
 
 		 217 aa  109  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  34.93 
 
 		 147 aa  108  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  36.59 
 
 		 339 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.2 
 
 		 338 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  31.11 
 
 		 233 aa  106  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  39.08 
 
 		 348 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  36.05 
 
 		 339 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  40.41 
 
 		 132 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  41.38 
 
 		 333 aa  96.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  34.44 
 
 		 149 aa  94.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  35.57 
 
 		 153 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  36.99 
 
 		 120 aa  93.6  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  33.77 
 
 		 154 aa  93.6  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  32.43 
 
 		 152 aa  90.5  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  35.76 
 
 		 150 aa  89.7  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  33.56 
 
 		 149 aa  89.4  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  35.06 
 
 		 150 aa  89  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  35.62 
 
 		 155 aa  89  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  36.55 
 
 		 151 aa  88.6  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  34.19 
 
 		 161 aa  88.6  9e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  33.56 
 
 		 152 aa  88.2  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  39.04 
 
 		 154 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  33.79 
 
 		 155 aa  87  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  36.91 
 
 		 149 aa  86.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  34.9 
 
 		 153 aa  86.3  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  32.89 
 
 		 149 aa  85.9  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  36.81 
 
 		 149 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  32.19 
 
 		 152 aa  84.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  31.29 
 
 		 152 aa  84.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_8994  predicted protein  39.57 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  31.86 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  32 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  31.39 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  31.82 
 
 		 150 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  32.23 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  32.43 
 
 		 153 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  32.43 
 
 		 153 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2008  CBS  34.84 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  32.57 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  35.42 
 
 		 427 aa  79.7  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  34.72 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2138  putative signal transduction protein with CBS domains  32.19 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  31.76 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  35.62 
 
 		 155 aa  78.2  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  33.8 
 
 		 148 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  32.89 
 
 		 150 aa  77  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 149 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  30.04 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  34 
 
 		 154 aa  77.4  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  34.46 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  31.41 
 
 		 153 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  32.69 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1490  signal transduction protein  33.33 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.421198 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  36.11 
 
 		 428 aa  76.3  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  32.48 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17501  IMP dehydrogenase-like protein  33.1 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 216 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.17 
 
 		 628 aa  74.7  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  31.08 
 
 		 153 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  31.1 
 
 		 164 aa  74.7  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  31.08 
 
 		 153 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 154 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  33.11 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  30.07 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  30.41 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0550  CBS domain-containing protein  30.14 
 
 		 146 aa  72  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  32.43 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  28.45 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  32.88 
 
 		 863 aa  70.9  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  30.22 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>