More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3742 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  62.76 
 
 
904 aa  1121    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  100 
 
 
903 aa  1847    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  61.07 
 
 
907 aa  1100    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  56.48 
 
 
909 aa  966    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  59.12 
 
 
909 aa  1066    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  71.06 
 
 
903 aa  1321    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  94.02 
 
 
903 aa  1722    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  33.69 
 
 
907 aa  502  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  35.01 
 
 
877 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  34.3 
 
 
890 aa  483  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  32.94 
 
 
880 aa  483  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  33.88 
 
 
877 aa  458  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  31.63 
 
 
865 aa  436  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  33.41 
 
 
875 aa  432  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  32.68 
 
 
880 aa  430  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  33.41 
 
 
875 aa  432  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.42 
 
 
873 aa  429  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  31.73 
 
 
875 aa  428  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1578  PolyA polymerase family protein  32.25 
 
 
880 aa  428  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.507141  normal  0.242793 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1433  polynucleotide adenylyltransferase region  33.59 
 
 
904 aa  429  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.743333  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  37.66 
 
 
769 aa  418  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  30.7 
 
 
888 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.06 
 
 
892 aa  419  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1581  polyA polymerase family protein  32.79 
 
 
880 aa  403  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.48144  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  31.87 
 
 
867 aa  404  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3306  polynucleotide adenylyltransferase region  31.56 
 
 
881 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102582  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  30.92 
 
 
873 aa  395  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  31.37 
 
 
845 aa  393  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2755  CBS domain-containing protein  30.28 
 
 
896 aa  388  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.1635  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  31.23 
 
 
885 aa  386  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  30.44 
 
 
888 aa  386  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1346  cyclic nucleotide-binding protein  30.52 
 
 
902 aa  384  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.761753 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2847  polynucleotide adenylyltransferase region  31.91 
 
 
874 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  34.11 
 
 
863 aa  375  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1972  CBS  30.62 
 
 
898 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03578  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  30.38 
 
 
863 aa  372  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2466  polynucleotide adenylyltransferase region  32.06 
 
 
872 aa  363  8e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.779181  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1184  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.08 
 
 
905 aa  360  5e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  30.12 
 
 
859 aa  358  2.9999999999999997e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  31.14 
 
 
883 aa  352  2e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0358  CBS domain containing protein  28.28 
 
 
1077 aa  335  3e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0457131 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2030  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.22 
 
 
854 aa  313  6.999999999999999e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.609547  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1481  Polynucleotide adenylyltransferase region  24.97 
 
 
847 aa  243  1e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000006237  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0635  CBS domain-containing protein  32.49 
 
 
432 aa  212  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00186716  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1441  Polynucleotide adenylyltransferase region  25.54 
 
 
821 aa  204  5e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000556215  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2615  polynucleotide adenylyltransferase region  34.76 
 
 
404 aa  162  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0405883  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0388  polynucleotide adenylyltransferase region  29.8 
 
 
416 aa  162  4e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1450  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.13 
 
 
450 aa  161  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1774  polyA polymerase family protein  32.13 
 
 
450 aa  161  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.69358  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0184  polyA polymerase  32.64 
 
 
403 aa  159  3e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.648939  normal  0.0507556 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2260  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.14 
 
 
422 aa  154  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.029615  unclonable  0.0000000423985 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_352  polyA polymerase, tRNA nucleotidyltransferase  28.96 
 
 
418 aa  150  8e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1564  polynucleotide adenylyltransferase region  28.9 
 
 
388 aa  150  9e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36397  predicted protein  27.81 
 
 
759 aa  149  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0409  polyA polymerase family protein  29.63 
 
 
418 aa  147  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25491  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  30.88 
 
 
415 aa  136  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03291  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  30.17 
 
 
421 aa  136  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.418266  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1363  polynucleotide adenylyltransferase region  40.87 
 
 
383 aa  132  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0212  polyA polymerase  29.41 
 
 
404 aa  130  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.809405  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1668  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  29.26 
 
 
418 aa  128  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03821  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  29.37 
 
 
418 aa  127  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.150415  normal  0.362341 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03361  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  30.65 
 
 
415 aa  125  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0600629  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1937  polynucleotide adenylyltransferase  33.18 
 
 
567 aa  120  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03261  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  30.8 
 
 
415 aa  118  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5957  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.55 
 
 
483 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03271  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  32.74 
 
 
415 aa  116  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.163609  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0305  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  34.64 
 
 
415 aa  116  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.535708  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0642  polynucleotide adenylyltransferase region  32.93 
 
 
374 aa  113  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000899541  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2058  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.58 
 
 
469 aa  110  9.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2415  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.18 
 
 
471 aa  110  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0872  hypothetical protein  33.08 
 
 
474 aa  109  3e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2535  tRNA adenylyltransferase (tRNA nucleotidyl transferase)  35.42 
 
 
479 aa  108  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3102  metal-dependent phosphohydrolase  35.08 
 
 
552 aa  103  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4906  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.84 
 
 
495 aa  103  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0665  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.03 
 
 
484 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0990908 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0854  Polynucleotide adenylyltransferase region  25.96 
 
 
468 aa  103  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00520307 
 
 
-
 
NC_002950  PG0801  polyA polymerase family protein  35.53 
 
 
483 aa  102  5e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0992  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.01 
 
 
471 aa  101  8e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1306  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  24.12 
 
 
489 aa  99.4  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1109  metal dependent phosphohydrolase  32.52 
 
 
470 aa  99.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.875974  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2857  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.81 
 
 
484 aa  98.2  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.858546  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0551  polynucleotide adenylyltransferase region  34.03 
 
 
377 aa  97.4  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06110  tRNA nucleotidyltransferase  34.57 
 
 
477 aa  96.7  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0722  HDIG  31.14 
 
 
476 aa  96.7  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.314731  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3525  Polynucleotide adenylyltransferase region  37.43 
 
 
448 aa  95.1  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224253  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4968  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.96 
 
 
490 aa  94.7  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9036  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.82 
 
 
491 aa  94.7  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1525  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.73 
 
 
475 aa  92.4  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1064  polynucleotide adenylyltransferase region  31.31 
 
 
423 aa  92.8  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191372  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1151  polyA polymerase family protein  29.92 
 
 
475 aa  91.3  7e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.71029 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0973  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.11 
 
 
474 aa  91.3  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1756  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.67 
 
 
473 aa  90.5  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1213  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.91 
 
 
479 aa  90.5  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4849  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.29 
 
 
499 aa  90.1  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0767  tRNA CCA-pyrophosphorylase  26.81 
 
 
403 aa  89.4  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.746315  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2544  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.57 
 
 
561 aa  88.6  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3571  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.2 
 
 
483 aa  86.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.564653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0497  metal dependent phosphohydrolase  25.54 
 
 
454 aa  86.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9369  hypothetical protein  31.51 
 
 
479 aa  86.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1864  tRNA adenylyltransferase  28.6 
 
 
420 aa  85.1  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.124392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>