More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_03291 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_03291  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  100 
 
 
421 aa  855    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.418266  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25491  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  47.36 
 
 
415 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0212  polyA polymerase  41 
 
 
404 aa  341  2e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.809405  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0184  polyA polymerase  42.43 
 
 
403 aa  336  5e-91  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.648939  normal  0.0507556 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1668  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  41.38 
 
 
418 aa  310  2e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03821  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  41.13 
 
 
418 aa  310  4e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.150415  normal  0.362341 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03271  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  36.05 
 
 
415 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.163609  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0305  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  34.24 
 
 
415 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.535708  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03261  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  33.5 
 
 
415 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03361  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  34.09 
 
 
415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0600629  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  29.25 
 
 
903 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  30.25 
 
 
904 aa  136  8e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2260  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.19 
 
 
422 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.029615  unclonable  0.0000000423985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.17 
 
 
903 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  29.28 
 
 
909 aa  129  9.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.48 
 
 
903 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  27.86 
 
 
907 aa  122  8e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  28.31 
 
 
880 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  32.7 
 
 
909 aa  119  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  33.45 
 
 
865 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1346  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 
902 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.761753 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1481  Polynucleotide adenylyltransferase region  34.58 
 
 
847 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000006237  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2030  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.81 
 
 
854 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.609547  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  36.74 
 
 
890 aa  109  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1972  CBS  28.51 
 
 
898 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03578  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1363  polynucleotide adenylyltransferase region  39.04 
 
 
383 aa  109  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  28.4 
 
 
867 aa  108  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0409  polyA polymerase family protein  27.48 
 
 
418 aa  107  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2466  polynucleotide adenylyltransferase region  28.36 
 
 
872 aa  107  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.779181  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  33.18 
 
 
907 aa  106  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0642  polynucleotide adenylyltransferase region  28.77 
 
 
374 aa  105  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000899541  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2847  polynucleotide adenylyltransferase region  28.01 
 
 
874 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1564  polynucleotide adenylyltransferase region  33.68 
 
 
388 aa  104  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  34.86 
 
 
859 aa  104  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.67 
 
 
873 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  31.88 
 
 
883 aa  100  5e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  33.78 
 
 
863 aa  99.4  9e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2615  polynucleotide adenylyltransferase region  34.05 
 
 
404 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0405883  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.75 
 
 
892 aa  98.2  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  30.99 
 
 
845 aa  99  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  32.89 
 
 
863 aa  97.8  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0551  polynucleotide adenylyltransferase region  30.2 
 
 
377 aa  97.4  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0388  polynucleotide adenylyltransferase region  25.77 
 
 
416 aa  97.4  5e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_352  polyA polymerase, tRNA nucleotidyltransferase  25.78 
 
 
418 aa  95.9  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1184  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.71 
 
 
905 aa  95.5  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2415  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.18 
 
 
471 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  23.2 
 
 
877 aa  94.7  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  26.99 
 
 
885 aa  93.2  7e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  31.86 
 
 
888 aa  93.2  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1433  polynucleotide adenylyltransferase region  30.86 
 
 
904 aa  93.2  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.743333  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3306  polynucleotide adenylyltransferase region  23.76 
 
 
881 aa  92.8  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102582  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0358  CBS domain containing protein  28.23 
 
 
1077 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0457131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  34.44 
 
 
877 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  31.55 
 
 
888 aa  92  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1774  polyA polymerase family protein  33.33 
 
 
450 aa  90.5  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.69358  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1450  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.33 
 
 
450 aa  90.5  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4906  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.32 
 
 
495 aa  89.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1525  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.07 
 
 
475 aa  89.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2535  tRNA adenylyltransferase (tRNA nucleotidyl transferase)  34.04 
 
 
479 aa  89.4  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06110  tRNA nucleotidyltransferase  35.43 
 
 
477 aa  88.6  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2755  CBS domain-containing protein  30.25 
 
 
896 aa  88.6  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.1635  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1441  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.64 
 
 
821 aa  87.8  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000556215  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2058  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.13 
 
 
469 aa  87.4  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0854  Polynucleotide adenylyltransferase region  35.43 
 
 
468 aa  86.7  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00520307 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4968  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32 
 
 
490 aa  86.7  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3571  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
483 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.564653 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  29.29 
 
 
875 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1306  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.45 
 
 
489 aa  85.9  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1581  polyA polymerase family protein  29.67 
 
 
880 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.48144  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3525  Polynucleotide adenylyltransferase region  39.05 
 
 
448 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224253  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0872  hypothetical protein  33.69 
 
 
474 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1109  metal dependent phosphohydrolase  34.48 
 
 
470 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.875974  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3102  metal-dependent phosphohydrolase  33.53 
 
 
552 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0722  HDIG  34.62 
 
 
476 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.314731  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5957  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.28 
 
 
483 aa  84.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1937  polynucleotide adenylyltransferase  33.72 
 
 
567 aa  84  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  29.56 
 
 
880 aa  84  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  29.82 
 
 
875 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1151  polyA polymerase family protein  30.2 
 
 
475 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.71029 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  29.82 
 
 
875 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9369  hypothetical protein  32.74 
 
 
479 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1578  PolyA polymerase family protein  28.85 
 
 
880 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.507141  normal  0.242793 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0810  polyA polymerase family protein  26.34 
 
 
372 aa  80.5  0.00000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.101557  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4849  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.14 
 
 
499 aa  80.1  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39600  tRNA adenylyltransferase  30.91 
 
 
523 aa  79.7  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0880  polyA polymerase family protein  27 
 
 
343 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4207  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  39.62 
 
 
483 aa  79  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1213  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.98 
 
 
479 aa  78.2  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0023  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.84 
 
 
462 aa  78.6  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0428  multifunctional tRNA nucleotidyl transferase/2'3'-cyclic phosphodiesterase/2'nucleotidase/phosphatase  34.05 
 
 
368 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.308892  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5397  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.48 
 
 
464 aa  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7321  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.75 
 
 
508 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4808  multifunctional tRNA nucleotidyl transferase/2'3'-cyclic phosphodiesterase/2'nucleotidase/phosphatase  34.05 
 
 
370 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.263929  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4531  metal dependent phosphohydrolase  34.75 
 
 
502 aa  76.6  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1480  polynucleotide adenylyltransferase region  28.36 
 
 
436 aa  76.3  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.846111  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0394  multifunctional tRNA nucleotidyl transferase/2'3'-cyclic phosphodiesterase/2'nucleotidase/phosphatase  33.51 
 
 
368 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.936074  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0801  polyA polymerase family protein  35.19 
 
 
483 aa  75.9  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2475  tRNA cytidylyltransferase  27.86 
 
 
436 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152668  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0992  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.33 
 
 
471 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2544  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.59 
 
 
561 aa  75.5  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>