More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1937 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1937  polynucleotide adenylyltransferase  100 
 
 
567 aa  1131    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  30.75 
 
 
863 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  30.99 
 
 
863 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  26.79 
 
 
877 aa  160  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  35.15 
 
 
877 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  35.32 
 
 
883 aa  153  7e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1578  PolyA polymerase family protein  28.18 
 
 
880 aa  152  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.507141  normal  0.242793 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  33.76 
 
 
859 aa  150  7e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  28.11 
 
 
907 aa  147  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1581  polyA polymerase family protein  26.65 
 
 
880 aa  143  9e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.48144  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1346  cyclic nucleotide-binding protein  34.48 
 
 
902 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.761753 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3306  polynucleotide adenylyltransferase region  26.67 
 
 
881 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102582  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1972  CBS  27.76 
 
 
898 aa  141  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03578  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  28.86 
 
 
885 aa  140  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  26.76 
 
 
875 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  26.24 
 
 
888 aa  140  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  26.6 
 
 
875 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  26.11 
 
 
880 aa  138  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  33.92 
 
 
845 aa  136  8e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.75 
 
 
892 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1481  Polynucleotide adenylyltransferase region  34.11 
 
 
847 aa  136  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000006237  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  33.03 
 
 
890 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1363  polynucleotide adenylyltransferase region  34.35 
 
 
383 aa  135  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  33.04 
 
 
867 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2755  CBS domain-containing protein  25.18 
 
 
896 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.1635  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  36.57 
 
 
865 aa  131  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  31.93 
 
 
880 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0642  polynucleotide adenylyltransferase region  34.12 
 
 
374 aa  130  5.0000000000000004e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000899541  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  30.67 
 
 
875 aa  130  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  25.8 
 
 
888 aa  128  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_352  polyA polymerase, tRNA nucleotidyltransferase  28.44 
 
 
418 aa  126  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1433  polynucleotide adenylyltransferase region  31.69 
 
 
904 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.743333  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0409  polyA polymerase family protein  26.81 
 
 
418 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2260  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.15 
 
 
422 aa  121  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.029615  unclonable  0.0000000423985 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1441  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.92 
 
 
821 aa  120  4.9999999999999996e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000556215  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  35.89 
 
 
907 aa  120  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0388  polynucleotide adenylyltransferase region  27.51 
 
 
416 aa  120  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1450  Polynucleotide adenylyltransferase region  36.17 
 
 
450 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.18 
 
 
903 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1774  polyA polymerase family protein  36.17 
 
 
450 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.69358  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0358  CBS domain containing protein  26.61 
 
 
1077 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0457131 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.73 
 
 
903 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  25.88 
 
 
904 aa  116  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2466  polynucleotide adenylyltransferase region  34.38 
 
 
872 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.779181  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  31.62 
 
 
909 aa  115  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  34.36 
 
 
873 aa  114  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2847  polynucleotide adenylyltransferase region  33.91 
 
 
874 aa  114  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1184  Polynucleotide adenylyltransferase region  24.64 
 
 
905 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  34.12 
 
 
909 aa  109  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2615  polynucleotide adenylyltransferase region  32.29 
 
 
404 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0405883  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0854  Polynucleotide adenylyltransferase region  29.6 
 
 
468 aa  107  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00520307 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0722  HDIG  31.06 
 
 
476 aa  106  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.314731  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5957  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.13 
 
 
483 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  33 
 
 
903 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2415  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.36 
 
 
471 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1564  polynucleotide adenylyltransferase region  27.69 
 
 
388 aa  104  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0665  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.2 
 
 
484 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0990908 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2030  Polynucleotide adenylyltransferase region  38.1 
 
 
854 aa  101  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.609547  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1109  metal dependent phosphohydrolase  29.61 
 
 
470 aa  101  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.875974  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1213  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.48 
 
 
479 aa  100  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0992  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.71 
 
 
471 aa  100  7e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2544  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.12 
 
 
561 aa  100  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06110  tRNA nucleotidyltransferase  32.84 
 
 
477 aa  100  9e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2535  tRNA adenylyltransferase (tRNA nucleotidyl transferase)  33.33 
 
 
479 aa  100  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1306  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.11 
 
 
489 aa  100  9e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03361  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  31.89 
 
 
415 aa  99.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0600629  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  31.69 
 
 
873 aa  98.6  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1151  polyA polymerase family protein  34.48 
 
 
475 aa  97.4  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.71029 
 
 
-
 
NC_002950  PG0801  polyA polymerase family protein  32.75 
 
 
483 aa  97.1  7e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0834  polynucleotide adenylyltransferase region  33.94 
 
 
427 aa  97.4  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000136333  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1193  tRNA nucleotidyltransferase  31.3 
 
 
417 aa  96.3  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.600883  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0971  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.58 
 
 
412 aa  96.7  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0004224  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4849  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 
499 aa  95.5  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1166  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32 
 
 
413 aa  95.5  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000545015  hitchhiker  0.000309959 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4906  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.37 
 
 
495 aa  95.5  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03261  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  31.52 
 
 
415 aa  95.1  3e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0212  polyA polymerase  36.36 
 
 
404 aa  94  7e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.809405  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0331  tRNA nucleotidyltransferase  33.94 
 
 
409 aa  93.6  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2058  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.07 
 
 
469 aa  93.2  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0872  hypothetical protein  27.08 
 
 
474 aa  92.8  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1756  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.01 
 
 
473 aa  92.4  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1525  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.29 
 
 
475 aa  92  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03271  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  26.88 
 
 
415 aa  92.8  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.163609  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0551  polynucleotide adenylyltransferase region  36.26 
 
 
377 aa  92.4  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25491  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  37.28 
 
 
415 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6061  metal dependent phosphohydrolase  29.28 
 
 
483 aa  92  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.182815 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0305  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  27.43 
 
 
415 aa  91.3  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.535708  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5092  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.67 
 
 
485 aa  91.3  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588683 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3102  metal-dependent phosphohydrolase  33.82 
 
 
552 aa  90.9  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2979  metal dependent phosphohydrolase  32.43 
 
 
416 aa  90.5  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000079724  normal  0.0360054 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0389  polynucleotide adenylyltransferase  34.29 
 
 
406 aa  90.5  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02926  fused tRNA nucleotidyl transferase/2'3'-cyclic phosphodiesterase/2'nucleotidase and phosphatase  30.32 
 
 
412 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000150145  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0644  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.32 
 
 
412 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000312929  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4574  HDIG domain-containing protein  29.71 
 
 
485 aa  89.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1033  polyA polymerase family protein  30.91 
 
 
448 aa  89.4  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0733439  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0643  multifunctional tRNA nucleotidyl transferase/2'3'-cyclic phosphodiesterase/2'nucleotidase/phosphatase  30.32 
 
 
412 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00557262  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1668  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  32.94 
 
 
418 aa  89.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02876  hypothetical protein  30.32 
 
 
412 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000142694  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3233  multifunctional tRNA nucleotidyl transferase/2'3'-cyclic phosphodiesterase/2'nucleotidase/phosphatase  30.32 
 
 
412 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1115  metal dependent phosphohydrolase  30.67 
 
 
420 aa  89.4  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>