More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_03361 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_03361  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  100 
 
 		 415 aa  832    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0600629  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03261  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  65.06 
 
 		 415 aa  567  1e-160  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03271  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  64.34 
 
 		 415 aa  564  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.163609  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0305  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  63.13 
 
 		 415 aa  555  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.535708  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0212  polyA polymerase  31.68 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.809405  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25491  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  32.02 
 
 		 415 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03291  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  34.09 
 
 		 421 aa  239  9e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.418266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0184  polyA polymerase  30.34 
 
 		 403 aa  238  2e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.648939  normal  0.0507556 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03821  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  33.17 
 
 		 418 aa  212  1e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.150415  normal  0.362341 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1668  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  33.17 
 
 		 418 aa  209  5e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2260  Polynucleotide adenylyltransferase region  24.18 
 
 		 422 aa  129  7.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.029615  unclonable  0.0000000423985 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  31.62 
 
 		 883 aa  127  4.0000000000000003e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  29.64 
 
 		 909 aa  123  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  36.87 
 
 		 903 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  29.07 
 
 		 907 aa  121  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  36.31 
 
 		 903 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1481  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.2 
 
 		 847 aa  121  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000006237  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  29.37 
 
 		 904 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.73 
 
 		 903 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1564  polynucleotide adenylyltransferase region  34.22 
 
 		 388 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  25.12 
 
 		 888 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 		 863 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  30.38 
 
 		 863 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  25.72 
 
 		 867 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0409  polyA polymerase family protein  39.05 
 
 		 418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2058  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36 
 
 		 469 aa  113  6e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  30.14 
 
 		 909 aa  112  9e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0388  polynucleotide adenylyltransferase region  34.85 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  37.56 
 
 		 845 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.33 
 
 		 873 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  29.54 
 
 		 859 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1581  polyA polymerase family protein  33.52 
 
 		 880 aa  110  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.48144  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1363  polynucleotide adenylyltransferase region  31.84 
 
 		 383 aa  110  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_352  polyA polymerase, tRNA nucleotidyltransferase  37.14 
 
 		 418 aa  110  6e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  30.23 
 
 		 885 aa  109  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2030  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.04 
 
 		 854 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.609547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  36.42 
 
 		 890 aa  107  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  33.33 
 
 		 888 aa  106  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 		 875 aa  106  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0551  polynucleotide adenylyltransferase region  30.48 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4906  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.03 
 
 		 495 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1109  metal dependent phosphohydrolase  33.16 
 
 		 470 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.875974  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  29.63 
 
 		 907 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1578  PolyA polymerase family protein  32.42 
 
 		 880 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.507141  normal  0.242793 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1972  CBS  34.64 
 
 		 898 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03578  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2755  CBS domain-containing protein  28.4 
 
 		 896 aa  104  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.1635  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0854  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.28 
 
 		 468 aa  103  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520307 
 
 
-
 
NC_002950  PG0801  polyA polymerase family protein  32.54 
 
 		 483 aa  102  8e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2535  tRNA adenylyltransferase (tRNA nucleotidyl transferase)  34.3 
 
 		 479 aa  102  8e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1346  cyclic nucleotide-binding protein  32.35 
 
 		 902 aa  102  9e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.761753 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0642  polynucleotide adenylyltransferase region  30.74 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000899541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  30.41 
 
 		 880 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  25.93 
 
 		 877 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0722  HDIG  30.5 
 
 		 476 aa  100  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.314731  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1433  polynucleotide adenylyltransferase region  32.58 
 
 		 904 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.743333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  30.29 
 
 		 875 aa  100  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1937  polynucleotide adenylyltransferase  28.06 
 
 		 567 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1441  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.6 
 
 		 821 aa  100  6e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000556215  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  31.15 
 
 		 875 aa  99.8  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.43 
 
 		 892 aa  99.8  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06110  tRNA nucleotidyltransferase  34.5 
 
 		 477 aa  99.4  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  33.15 
 
 		 880 aa  99  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3306  polynucleotide adenylyltransferase region  29.89 
 
 		 881 aa  99  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102582  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1525  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.89 
 
 		 475 aa  98.6  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  35.2 
 
 		 865 aa  98.6  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0992  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.98 
 
 		 471 aa  98.2  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1184  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.5 
 
 		 905 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  26.1 
 
 		 877 aa  97.8  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1306  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.24 
 
 		 489 aa  97.4  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2847  polynucleotide adenylyltransferase region  28.85 
 
 		 874 aa  96.7  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5957  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.35 
 
 		 483 aa  96.7  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2615  polynucleotide adenylyltransferase region  29.18 
 
 		 404 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0405883  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2415  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.32 
 
 		 471 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3525  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.58 
 
 		 448 aa  94.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4968  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.83 
 
 		 490 aa  94  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01581  poly A polymerase family protein  36.14 
 
 		 405 aa  92.8  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.178246  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0665  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.16 
 
 		 484 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0990908 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1151  polyA polymerase family protein  30.85 
 
 		 475 aa  92  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.71029 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2466  polynucleotide adenylyltransferase region  28.69 
 
 		 872 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.779181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2139  metal dependent phosphohydrolase  32.56 
 
 		 525 aa  90.9  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0872  hypothetical protein  29.19 
 
 		 474 aa  90.1  7e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1213  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.41 
 
 		 479 aa  89.4  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3102  metal-dependent phosphohydrolase  29.69 
 
 		 552 aa  89  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0143  poly A polymerase family protein  33.13 
 
 		 406 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1774  polyA polymerase family protein  23.93 
 
 		 450 aa  87  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.69358  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1450  Polynucleotide adenylyltransferase region  23.93 
 
 		 450 aa  87  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4849  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.28 
 
 		 499 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01601  poly A polymerase family protein  35.4 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.100479  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3924  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.76 
 
 		 502 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01691  poly A polymerase family protein  36.02 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9369  hypothetical protein  30.54 
 
 		 479 aa  83.6  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1507  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  33.53 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4157  metal dependent phosphohydrolase  29.82 
 
 		 496 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23340  tRNA adenylyltransferase  28.82 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4574  HDIG domain-containing protein  31.1 
 
 		 485 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2542  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  26.9 
 
 		 492 aa  80.5  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.277933 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5092  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.1 
 
 		 485 aa  80.5  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000588683 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1710  tRNA adenylyltransferase  34.48 
 
 		 394 aa  79.7  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.141453  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1033  polyA polymerase family protein  33.92 
 
 		 448 aa  79.3  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0733439  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5397  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.74 
 
 		 464 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>